| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 2086138 = | NA (NA) | 1402 (1.160) | 283/296 | 0.0 | 95.2% | intergenic (‑41/+48) | ps442/tnp905 | putative terminase large subunit/pseudogene |
| ? | AM406671 | = 2090433 | 70 (0.060) | coding (31/309 nt) | ps435 | hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
Only 100 of 1402 total aligned reads displayed.
CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/2086285‑2086138‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAAGTTATTGAAA < AM406671/2090433‑2090286 CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCATCTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCC < 2:878784/149‑1CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCC > 2:8179194/1‑149CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCC > 1:4804411/1‑149CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCC > 2:9289694/1‑149CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCC > 2:2036221/1‑149CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCC < 1:5630173/149‑1 TTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCG > 2:225237/1‑149 TTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCG < 1:2390858/149‑1 TAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGA > 1:4214793/1‑149 TAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGA < 1:5016433/149‑1 GTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAAT < 1:2554244/149‑1 GTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAAT < 1:1970269/149‑1 GTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAAT > 1:9621214/1‑149 TACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTA < 2:6313772/149‑1 ACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAA < 1:11563/149‑1 CTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAAC > 1:7448885/1‑149 TTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGA < 1:5479337/149‑1 TTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGA > 2:8026876/1‑149 TTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTT > 2:8896437/1‑149 AAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAA > 1:3309495/1‑149 GATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAA < 1:6805870/149‑1 GATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAA > 2:4804773/1‑149 TTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGG < 1:9085715/149‑1 TATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGC < 1:10017794/149‑1 AATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAA > 2:6022789/1‑149 TTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGA > 2:3656335/1‑149 CAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATA < 2:69974/149‑1 AAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAA < 2:7329353/149‑1 AGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAG > 1:3936977/1‑149 CAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTT < 2:9098594/149‑1 AAGTCAACGCATCCACACAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGATAGCTGATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGgtga < 2:3173957/149‑5 AGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAG > 2:3828158/1‑149 TCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAG > 2:9478006/1‑149 AACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGAT < 2:4319699/149‑1 AACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGAT > 1:6062615/1‑149 AACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCGTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGAT < 1:6255981/149‑1 ACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATG > 1:2740648/1‑149 CGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGA > 1:4453914/1‑149 CATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAAC > 1:1434033/1‑149 CATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAAC > 1:8131394/1‑149 TCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTT < 2:8337646/149‑1 ATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTAT > 1:10210127/1‑149 AAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAG < 2:2857065/149‑1 GGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTT > 2:3498493/1‑149 GTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAA > 2:1358618/1‑149 TTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAA > 1:2664091/1‑149 CCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATA > 2:6506163/1‑149 CCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATA < 1:7244317/149‑1 CCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATA < 1:8454796/149‑1 CAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGACAAGTCTAGAGATCAACTTTATAAGTTAAAGAATAC > 2:66786/1‑149 AATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACT > 1:2186124/1‑149 AATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACT < 2:5232813/149‑1 TGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTG < 2:1152585/148‑1 CTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGAT > 2:7679769/1‑149 ACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGC > 1:9359945/1‑149 ACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATT < 2:9702784/149‑1 ACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATT < 1:9938085/149‑1 TTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTAT < 2:8542889/149‑1 GAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAA < 1:7928520/149‑1 AAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAAT < 2:7874928/149‑1 AAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAAT > 2:159036/1‑149 GCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTT < 1:4117080/149‑1 GCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTT > 1:6900731/1‑149 CTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTA < 2:7155609/149‑1 CTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTA > 2:303127/1‑149 TATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAG > 2:4501364/1‑149 ATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGG > 1:5253437/1‑149 TTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGT > 2:5126708/1‑149 TTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTT > 2:7506427/1‑149 TGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTT > 2:5676511/1‑149 GATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTT < 1:184752/149‑1 ATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCCTTATAAATTTAAGGTTTTA < 2:4165253/149‑1 TTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATTATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAATAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTAT < 2:1845002/149‑1 TTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTAT < 1:2864902/149‑1 ATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATA > 1:4589466/1‑149 ATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAG < 2:6791571/149‑1 TCTTCAATTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAAGGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCt > 2:2507432/1‑148 TCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATACTTATTGTCAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCC > 2:1702958/1‑149 CTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCA < 2:5463790/149‑1 CAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGA < 2:10058860/149‑1 CAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGA < 2:2722831/149‑1 AACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACCACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGAT < 1:663365/149‑1 ACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATA > 1:644856/1‑149 ACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATA > 1:8307089/1‑149 CTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATAT > 2:4630534/1‑149 TCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATG > 1:8602731/1‑149 ACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATT > 2:984155/1‑149 TGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATGAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGG < 2:3363456/149‑1 TGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGG < 1:3738737/149‑1 TGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGG > 1:1642044/1‑149 ACACATAATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGT < 1:7732233/149‑1 AATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATC < 1:3006788/149‑1 ATTATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCC < 2:10258072/149‑1 ATTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGA < 1:8853662/149‑1 TTGACAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAA < 1:10424328/149‑1 CAGTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAAGTTA < 1:7092329/149‑1 GTATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAAGTTATT < 2:5819265/149‑1 ATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAAGTTATTGA < 2:10348078/149‑1 ATCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAAGTTATTGA < 1:3492298/149‑1 TCCGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAANGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGATTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTCTTACGTTTAATCCTGAAGTTATTGAA > 1:5834139/1‑149 CTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/2086285‑2086138‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGAATTAACGACTTGCAAAAGGCAAATGATAAGTTTAGAGATGAACTTTATAAGTTAAAGAATACTGTTGATAGCCATTATAAATTTAAGGTTTTATATAAGCCAAGATATGATTGGGCTTTTACGTTTAATCCTGAAGTTATTGAAA < AM406671/2090433‑2090286 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |