| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 495860 = | 67 (0.060) | 1195 (1.080) | 275/294 | 0.1 | 94.7% | intergenic (+60/‑49) | llmg_0504/nifZ | putative membrane protein/pyridoxal‑phosphate dependent aminotransferase |
| ? | AM406671 | 548108 = | NA (NA) | intergenic (+264/+47) | llmg_0553/tnp905 | conserved hypothetical protein/transposase for insertion sequence element IS905B | |||||
Only 100 of 1352 total aligned reads displayed.
AACTTGAAGGGTTTCCCATAATTTTTGTTGCTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/496008‑495860‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGT > AM406671/548108‑548255 AGGGTTTCCCATAATTTTTGTTGCTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGT > 1:4194508/1‑149 TCCCACAATTTTTGTTGCTACATGTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAA < 1:5452658/149‑1 TTTTTGTTGCTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGT > 2:2043223/1‑149 TTTGTTGCTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAA > 2:5170838/1‑149 TGTTGCTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAAC > 2:87644/1‑149 CTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCA > 2:8279422/1‑149 CTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCA > 2:4895807/1‑149 TACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAA > 2:4206731/1‑149 ACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAG < 1:7757013/149‑1 ACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAG > 1:5123694/1‑149 CATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGT > 1:622436/1‑149 CATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGT > 2:8108904/1‑149 ATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTA < 2:3992419/149‑1 ATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTA < 1:4658182/149‑1 CTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGA > 1:4093371/1‑149 ATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTG < 1:6912267/149‑1 ATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTG > 1:1120397/1‑149 TAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGA > 1:5726838/1‑149 TAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGA < 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1:8008302/1‑149 TATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGG < 2:4405202/149‑1 ATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGC > 2:3571074/1‑149 TCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCC > 2:2525092/1‑149 AAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAA < 1:7926377/149‑1 AAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAA > 1:4793396/1‑149 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1:3848683/1‑149 GATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGT > 1:2814271/1‑149 GATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGT > 1:2348081/1‑149 GATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGT > 1:2030137/1‑149 GATACTGTCAAAAATTATGTGTAAACCCTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAACCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGTATGCGTTGACGTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGT < 2:9415550/149‑1 AACTTGAAGGGTTTCCCATAATTTTTGTTGCTACATCTGTATAAGTTCGTAAAACCATTGGATTAACTGCCGTCGTAGCAGAATTATCAAAATATATCATTTTTTATCCTTAATATTTAAAAATCAATCTTATTTTATCACAAAAAATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/496008‑495860‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTAAGT > AM406671/548108‑548255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |