| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | = 495868 | 56 (0.050) | 1208 (1.090) | 284/296 | 0.0 | 95.6% | intergenic (+68/‑41) | llmg_0504/nifZ | putative membrane protein/pyridoxal‑phosphate dependent aminotransferase |
| ? | AM406671 | = 549419 | NA (NA) | intergenic (‑89/‑298) | tnp905/tdk | transposase for insertion sequence element IS905B/Tdk protein | |||||
Only 100 of 1208 total aligned reads displayed.
TTCTTATTTTTATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AM406671/495721‑495868‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTGATGA < AM406671/549419‑549272 TCTTATTTTTATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGG < 1:4443286/149‑1 CTTATTTTTATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGT < 2:816026/149‑1 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2:9463966/1‑149 TATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAA < 2:5053087/149‑1 TATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAA < 2:3303686/149‑1 ATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAA < 1:5921899/149‑1 TTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAAT > 2:6437726/1‑149 TTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATA > 2:1434192/1‑149 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2:832959/149‑1 GTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTT < 1:4645194/149‑1 TTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGT > 1:3111778/1‑149 ATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGT > 2:8517351/1‑149 ATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGATTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAATTAAGTTGTGT > 2:4055342/1‑149 TTTATTCGATGATTAGAAATCGGAAGAAAAAAAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAA < 2:89743/149‑1 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1:157959/1‑149 ATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAA > 1:713181/1‑149 ATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAA < 1:7938455/149‑1 TGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAG > 1:687826/1‑149 TGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAG > 1:1353555/1‑149 TGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAG > 1:5123066/1‑149 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1:2596174/149‑1 GATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACC < 1:8740077/149‑1 ATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATTACTCAGTTTACCA > 2:2678507/1‑149 TATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCAC < 1:11150/149‑1 TATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCAC > 1:9304464/1‑149 CCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTAC < 1:8327830/149‑1 CCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTAC < 2:2128603/149‑1 TTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTT < 2:2281791/149‑1 ATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACT > 1:5260234/1‑149 TTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTT > 2:4810706/1‑149 ATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCC < 2:4491299/149‑1 TTCAACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGC < 1:9489434/149‑1 TCAACGCTCAGCAATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCC < 2:5296623/149‑1 ACGCTCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAA > 1:6961841/1‑149 TCAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGC > 1:6064312/1‑149 CAGACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCA < 1:4874425/149‑1 GACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAG < 1:3939322/149‑1 GACATTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAG < 1:8151167/149‑1 TTTTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATAT < 1:4221579/149‑1 TTTTGGGTAGTGTAAAATAAGTAATAAAAAAACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTG < 2:7268876/149‑1 GGGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTGATGA < 2:690161/149‑1 TTCTTATTTTTATTTTGGTTTATATTTATTCGATGATTAGAAATCGGCAGATTGTCAAAAAATTTAATAAAGAGAGCTGAGTTTTCTTATAATAGATGCTCTTGATATTTACTCCTTATATTATTTTTCAACGCTCAGACATTTTTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > AM406671/495721‑495868‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAGTGTAAAATAAGTTGTGTAAACACAAAAAGGAATAAATCCGTTATAGTAGAGTTGCGAAACATTACTAGAAAGAGATTTATTCCTATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTGATGA < AM406671/549419‑549272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |