| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 495875 = | 109 (0.100) | 18 (0.020) +ATATCACAAAAAAT |
17/268 | 24.6 | 2.8% | intergenic (+75/‑34) | llmg_0504/nifZ | putative membrane protein/pyridoxal‑phosphate dependent aminotransferase |
| ? | AM406671 | = 2450963 | 1260 (1.140) | intergenic (+48/+63) | tnp905/ywjF | transposase for insertion sequence element IS905N/Putative 3‑hydroxyisobutyrate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1260 total aligned reads displayed.
TAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAACTGCT > AM406671/2450818‑2451111 | gTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGtt < 2:4824315/149‑1 (MQ=32) ttgtttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGa > 2:512322/1‑149 (MQ=34) tgtttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGat < 1:1476241/149‑1 (MQ=35) gtttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGata > 1:178819/1‑149 (MQ=35) gtttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCAATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGata > 2:105976/1‑149 (MQ=25) tttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGatat < 1:117888/149‑1 (MQ=38) tttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGatat < 1:8699104/149‑1 (MQ=38) tttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGatat > 2:347621/1‑149 (MQ=38) ttgAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATc < 1:6056288/149‑1 (MQ=38) gAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTg < 1:8465239/149‑1 (MQ=40) aaGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGt < 1:3464687/149‑1 (MQ=40) tataATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTaaaaa > 2:7717514/1‑149 (MQ=255) tataATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTaaaaa > 1:4725868/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAg > 1:299582/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGCTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAg < 1:3672078/149‑1 (MQ=255) aTTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGc < 1:9044771/149‑1 (MQ=255) aGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGaat < 2:5834970/149‑1 (MQ=255) gCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGaata > 1:918821/1‑149 (MQ=255) aaaGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGaataat < 1:6848300/149‑1 (MQ=255) aaaGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGaataat < 2:2962762/149‑1 (MQ=255) aGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCa > 1:6718817/1‑149 (MQ=255) aGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCa < 1:7140794/149‑1 (MQ=255) tCAACGCATCCATAAAGGGTTTAGACAATGTGCTAACACACTTGAAAGCTTATTTAATTAATATACTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTCTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAgg < 2:920568/149‑1 (MQ=17) cAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGc > 2:1231730/1‑149 (MQ=255) aaCGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCt < 1:7967080/149‑1 (MQ=255) aaCGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCt < 1:1048880/149‑1 (MQ=255) aCGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTTTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCtt > 1:6149823/1‑149 (MQ=255) aCGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCtt < 1:646751/149‑1 (MQ=255) aCGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCtt > 2:9492685/1‑149 (MQ=255) cGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAATCCTGAATAATCAGGCTTa > 2:1740269/1‑149 (MQ=255) gCATCCATAAAGGTTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATCTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGTCATTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAGCGGAAGCCTGAATAATCAGGCTTaa < 2:5250004/149‑1 (MQ=17) tCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAAttt < 1:2321957/149‑1 (MQ=255) tCCATAAAGGATTTGGCAAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTGTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGAAATATATAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAAttt < 2:2724144/149‑1 (MQ=18) ccATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAAtttt > 1:7759360/1‑149 (MQ=255) aTAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTa > 1:4177654/1‑149 (MQ=255) aTAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTa < 1:5499592/149‑1 (MQ=255) gggTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATACTTATTGATAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGATTAATCAGGCTTAATTTTTATTTTg < 2:8126973/149‑1 (MQ=255) tttGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACt > 1:132317/1‑149 (MQ=255) ttGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACtt < 2:3963517/149‑1 (MQ=255) tGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACttt < 1:3784047/149‑1 (MQ=255) tGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACttt < 1:7592849/149‑1 (MQ=255) gacAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTAt < 2:4187421/147‑1 (MQ=255) ccAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATc < 1:1629863/149‑1 (MQ=255) cAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCa < 1:4355398/149‑1 (MQ=255) 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cTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGTTTTCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATTTCCCTCTGGcc > 2:6672006/1‑149 (MQ=255) cTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGcc > 2:1516277/1‑149 (MQ=255) tttGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGccacca > 1:8061225/1‑149 (MQ=255) tttGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGccacca > 2:2582153/1‑149 (MQ=255) tttGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGccacca > 2:2090527/1‑149 (MQ=255) ttGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCaa < 2:7204806/149‑1 (MQ=255) ttGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCaa > 2:7904527/1‑149 (MQ=255) ttGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCaa > 2:800804/1‑149 (MQ=255) aTTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTGATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGt < 2:4956847/149‑1 (MQ=255) aTTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGt < 1:3943867/149‑1 (MQ=255) 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gAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGTCTGAATAATCAGGGTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTACcatc > 2:7576042/1‑149 (MQ=255) gAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCcatc < 2:2222726/149‑1 (MQ=255) gtgtTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCcatcat > 1:6307375/1‑149 (MQ=255) acacATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCaa < 1:8505294/149‑1 (MQ=255) aTAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAAcc < 1:7376173/149‑1 (MQ=255) tAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCt > 1:2790008/1‑149 (MQ=255) tAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCt < 1:4807963/149‑1 (MQ=255) aaTTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCtt < 2:6229658/149‑1 (MQ=255) aaTTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCtt < 2:4308097/149‑1 (MQ=255) aaTTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCtt > 1:6995470/1‑149 (MQ=255) ttattGACAGTATCTTGTTTTTTGATATCTGTAAAATAAGCCTGAATAATCTGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATTTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTg < 2:310571/149‑1 (MQ=255) tattGACAGTATCCTGTTTGTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCTCTCTGGCCAGTAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGt > 2:5522102/1‑149 (MQ=255) attGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTc < 2:8357389/149‑1 (MQ=255) tGACAGTATCCTGTTTTTTGTTTTCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCac > 2:7402700/1‑148 (MQ=255) aGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCAACAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTaa > 1:879318/1‑149 (MQ=255) gTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAAc < 2:708358/149‑1 (MQ=255) gTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAAc > 1:193157/1‑149 (MQ=255) aTCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAACTg > 2:8460605/1‑149 (MQ=255) tCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAACTGc < 1:8157881/149‑1 (MQ=255) ccTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCGGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAACTGCt < 1:5894506/149‑1 (MQ=255) ccTGTTTTTTGATATCTGAAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAACTGCt < 1:2890643/149‑1 (MQ=255) | TAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCCTGTTTTTTGATATCTGTAAAAAAAGCCTGAATAATCAGGCTTAATTTTTATTTTGACTTTATCATTCTGGGCGATGTCCCTCTGGCCACCAAAGTTTAATCAAAGCTTGTGTTCCATCATTTTCAAAACCTTTGTCAGCTAACTGCT > AM406671/2450818‑2451111 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |