| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 495877 = | 124 (0.110) | 19 (0.020) +AAAAAAAAAAAAAAA |
19/266 | 23.8 | 14.6% | intergenic (+77/‑32) | llmg_0504/nifZ | putative membrane protein/pyridoxal‑phosphate dependent aminotransferase |
| ? | AM406671 | 988634 = | NA (NA) | intergenic (‑25/+49) | llmg_1021/tnp905 | putative membrane protein/pseudogene | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1004 total aligned reads displayed.
GTGTGGTTACTAACCAACCTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTA > AM406671/988486‑988780 | gtgGTTACTAACCAACCTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGa > 2:2545119/1‑149 (MQ=255) gTTACTAACCAAACTGGTTCTATAGAGCAACGATTAAATAAAAATCCGGCAATAATACGACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATAc < 1:3132988/149‑1 (MQ=255) tACTAACCAACCTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTg > 1:2428426/1‑149 (MQ=255) accaaccTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCaat > 2:3283075/1‑149 (MQ=255) accaaccTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCaat < 1:5718359/149‑1 (MQ=255) aaccTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCaataat < 1:115060/149‑1 (MQ=255) tGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTAATAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTAtg < 2:1762747/149‑1 (MQ=255) ggTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTAtgt > 1:1401132/1‑149 (MQ=255) tCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTa < 1:8590779/149‑1 (MQ=255) tCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTa < 1:4768658/149‑1 (MQ=255) tGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAaca > 1:8273463/1‑149 (MQ=255) ggAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCANTAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAacac > 1:5325481/1‑149 (MQ=255) cAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCaa > 1:5966547/1‑149 (MQ=255) cAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCaa < 1:4512523/149‑1 (MQ=255) cAACGATTAAATAAAACACCGGCAATAATACTACTAATACTAAAAAAAGAGGCAACCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCaa > 2:8996704/1‑149 (MQ=255) aaCGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAg < 2:605202/149‑1 (MQ=255) aTTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTaga > 2:5291264/1‑149 (MQ=255) aTTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTaga < 2:4056912/149‑1 (MQ=255) ttAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTagag > 1:296398/1‑149 (MQ=255) aataaaATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTg > 1:3974135/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAata > 1:2716638/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAata > 1:3904007/1‑149 (MQ=255) tCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTa < 1:5817426/135‑1 (MQ=255) tCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAatat < 2:8402903/149‑1 (MQ=255) gCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAAt < 2:4691631/149‑1 (MQ=255) cAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATc > 1:6859619/1‑149 (MQ=255) cAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATc < 2:6783293/149‑1 (MQ=255) taataCTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCaaa > 2:4497371/1‑149 (MQ=255) aataCTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAAt > 1:7461688/1‑149 (MQ=255) ataCTAGTGACACCAGAAAGAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAAGTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGGTGAAGAAGATTAATCAAATa < 2:1562099/149‑1 (MQ=37) tactacTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATaa > 2:6870074/1‑149 (MQ=255) actactAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAg < 1:4053172/149‑1 (MQ=255) tactaATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCt < 2:48554/149‑1 (MQ=255) ctaATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCttt < 2:7815151/149‑1 (MQ=255) aTACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACTCTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCaa < 2:6482507/149‑1 (MQ=255) aTACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCaa > 1:6235572/1‑149 (MQ=255) aTACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCaa < 2:5724270/149‑1 (MQ=255) aCCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAgt < 2:2285516/149‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAgtgtgt < 2:7296075/149‑1 (MQ=255) aaaaaGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTc > 2:8053114/1‑149 (MQ=255) aaaaGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCa < 2:2369909/149‑1 (MQ=255) aaaaGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCa < 2:9544668/149‑1 (MQ=255) aaaaGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCa > 1:6771258/1‑149 (MQ=255) aaaGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAg < 1:1921971/149‑1 (MQ=255) gagGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGcac > 2:1424486/1‑149 (MQ=255) gagGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTACTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGcac < 1:6989094/149‑1 (MQ=255) agGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGcaca < 2:2853060/149‑1 (MQ=255) ggCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACAt < 2:8527084/149‑1 (MQ=255) ggCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACAt < 2:3651342/149‑1 (MQ=255) gCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACAtt < 2:5030028/149‑1 (MQ=255) gCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACAtt < 2:8781290/149‑1 (MQ=255) ccAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGcc > 1:2597560/1‑149 (MQ=255) cAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCa < 1:6115737/149‑1 (MQ=255) aaaGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCaa > 1:2352640/1‑149 (MQ=255) aagaagCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCaaa > 1:553086/1‑149 (MQ=255) aagCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAAccc < 1:4245555/149‑1 (MQ=255) gCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCtt > 1:1013337/1‑149 (MQ=255) gCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCtt > 2:4248438/1‑149 (MQ=255) gCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCtt > 2:8258894/1‑149 (MQ=255) cGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTGCCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCTATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATGGGCCAAACCCtgt > 2:104513/1‑147 (MQ=255) cGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCttt < 2:3144861/149‑1 (MQ=255) tAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTAt > 1:3634624/1‑149 (MQ=255) aaaTTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTAATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATg > 2:2666208/1‑149 (MQ=255) aaTTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATgg < 1:91092/149‑1 (MQ=255) aaTTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATgg > 2:1208256/1‑149 (MQ=255) attattCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGa < 2:9230099/149‑1 (MQ=255) tattCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATTGATg > 2:865089/1‑149 (MQ=255) tattCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATg > 1:7596447/1‑149 (MQ=255) attCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGc > 1:9387848/1‑149 (MQ=255) ttCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCACTTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCg < 2:216403/149‑1 (MQ=255) tCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGt < 1:880260/149‑1 (MQ=255) tCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGt > 1:1770295/1‑149 (MQ=255) ccTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGtt > 1:6375843/1‑149 (MQ=255) cTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTg > 2:3420421/1‑149 (MQ=255) ttATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGCTACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTCTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGAc > 2:5802093/1‑149 (MQ=255) ttATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGAc > 2:302190/1‑149 (MQ=255) ttATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGAc > 2:6606427/1‑149 (MQ=255) tataTTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACt < 2:6349417/149‑1 (MQ=255) atatTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACtt > 1:2166179/1‑149 (MQ=255) atatTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACtt < 1:1643118/149‑1 (MQ=255) tttAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGc > 1:777185/1‑149 (MQ=255) tttAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGc < 1:7917231/149‑1 (MQ=255) ttAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCt > 2:7625356/1‑149 (MQ=255) tAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCtt > 2:7478519/1‑149 (MQ=255) gTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGa > 1:8021298/1‑149 (MQ=255) cATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGaaa < 1:8932494/149‑1 (MQ=255) tAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAAtt > 1:3376059/1‑149 (MQ=255) aaaTGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATta > 1:3538983/1‑149 (MQ=255) aaaTGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAATTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATta > 1:5005397/1‑149 (MQ=255) aCCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCt > 1:9524991/1‑149 (MQ=255) cAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTc > 2:5536876/1‑149 (MQ=255) cAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTc < 2:3844089/149‑1 (MQ=255) aaTTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTca > 1:720666/1‑149 (MQ=40) tattGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTcaaac > 1:6475181/1‑149 (MQ=38) ttGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTcaaacaa > 2:1963701/1‑149 (MQ=37) ggTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAg < 1:5123030/149‑1 (MQ=35) ggTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAg < 1:8125200/149‑1 (MQ=35) gTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGt > 2:9390290/1‑149 (MQ=34) tttCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTaa < 2:707275/149‑1 (MQ=32) tttCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTaa > 1:3249967/1‑149 (MQ=32) | GTGTGGTTACTAACCAACCTGGTTCTATGGAGCAACGATTAAATAAAATTCCGGCAATAATACTACTAATACCAAAAAAAGAGGCACCCAAAGAAGCGTAAATTATTCCTTTATATTTAGTCATAAATGTACCAATTATTGGTTTTCTTGATACTGTCAATAATTATGTGTAAACACTCAAGTAGAGTTGAAGAATATTAATCAAATAAGCTTTCAAGTGTGTCAGCACATTGGCCAAACCCTTTATGGATGCGTTGACTTTGCTTGAAATTATAATCTTCAAACAAAGTAACTA > AM406671/988486‑988780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |