| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | AM406671 | 2086138 = | NA (NA) | 1313 (1.180) | 288/296 | 0.0 | 95.3% | intergenic (‑41/+48) | ps442/tnp905 | putative terminase large subunit/pseudogene |
| ? | AM406671 | = 2090433 | 64 (0.060) | coding (31/309 nt) | ps435 | hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
Only 100 of 2507 total aligned reads displayed.
TTTTCAATAACTTCAGGATTAAACGTAAAAGCCCAATCATATCTTGGCTTATATAAAACCTTAAATTTATAATGGCTATCAACAGTATTCTTTAACTTATAAAGTTCATCTCTAAACTTATCATTTGCCTTTTGCAAGTCGTTAATTCGATATTCTAACTTTTTATATCTATTAAACATTCTATTCAACCTCAACTTTCTTAAATTCCACTATTTTTAATCCTCTACTTAATTCATCATCAAAAACAACTCCGTTTTCCAAATATCTCAAAGCATCTTCGAAAGTACATTCCTTCGT > AM406671/2090285‑2090581 | ttttCAATAACTTCAGGATTAAACGTAAAAGCCCAATCATATCTTGGCTTATATAAAACCTTAAATTTATAATGGCTATCAACAGTATTCTTTAACTTATAAAGTTCATCTCTAAACTTATCATTTGCCTTTTGCAAGTCGTTAATTCg > 2:9269196/1‑149 (MQ=255) tcttgcttttgggctaggaagttaagtagttctgtggtaaactgagtcataggaataaatctctttctagtaatgtttcgcaactctactataacggatttattcctttttgtgtttacacaacttattttacactaccTTAATTCGat > 2:449108‑M2/140‑149 (MQ=255) tgcttttgggctaggaagttaagtagttctgtggtaaactgagtcataggaataaatctctttctagtaatgtttcgcaactctactataacggatttattcctttttgtgtttacacaacttattttacactaccTTAATTCGATAtt < 1:137610‑M2/13‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |