| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 778852 = | 1067 (1.000) | 33 (0.030) | 30/270 | 34.4 | 3.3% | intergenic (+11/+180) | rbsB/ps301 | ribose ABC transporter substrate binding protein RbsB/putative integrase |
| ? | AM406671 | = 820924 | 952 (0.980) | intergenic (+251/‑254) | ps358/llmg_0854 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GGGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/779012‑778852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctagcgacagagGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < AM406671/820924‑820777 GGGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACC < 1:7912435/149‑1 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC > 2:8816302/1‑149 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC > 1:1664908/1‑149 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC < 2:7391903/149‑1 GGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCC < 1:3379392/149‑1 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT < 2:4799051/149‑1 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT < 1:5767720/149‑1 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT < 2:405262/149‑1 GGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCT > 2:1629807/1‑149 GCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTA < 1:8731700/149‑1 GCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTA < 1:7655082/149‑1 CAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAG < 1:8813621/149‑1 CAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAG < 1:4843170/149‑1 CAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAG > 1:2285152/1‑149 AGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGC < 1:2987574/149‑1 GAAAAAGGTGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 1:5311541/149‑1 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 1:7512871/149‑1 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG > 1:3749527/1‑149 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 1:210192/149‑1 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG > 2:4443633/1‑149 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 2:4784832/149‑1 GAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCG < 2:8155281/149‑1 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA > 1:3822028/1‑149 AAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGA > 1:5995998/1‑149 AAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC < 1:6873502/149‑1 AAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGAC > 1:9191389/1‑149 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG > 1:2915953/1‑149 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG > 2:9064803/1‑149 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG > 2:629971/1‑149 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG > 1:5856615/1‑149 AAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAG > 2:5858244/1‑149 AGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGA > 2:127616/1‑149 AGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGA < 1:8216278/149‑1 AGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGA < 2:3661463/149‑1 AGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGA > 2:561478/1‑149 GGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG < 1:6502107/149‑1 GGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG > 2:1037644/1‑149 GGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG > 2:6600245/1‑149 CAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAA > 1:7424907/1‑149 TTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTT < 2:5628288/149‑1 GATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCT > 2:6547239/1‑149 TTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAGAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTA > 2:5813351/1‑149 AAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAA > 2:826376/1‑149 ACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGG > 1:7784326/1‑149 AAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGC > 1:450434/1‑149 CCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTAT > 2:2022643/1‑149 CTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTG > 1:26992/1‑149 TTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGA < 1:5663347/149‑1 TTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAAGTAAATACTTTAAAAAAAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAACGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTCTTTGCTGGGCACGAACCAGCGACC > 2:6981557/1‑149 TAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAAC < 2:4157750/149‑1 ACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGG < 1:8408048/149‑1 AGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGC < 1:9057977/149‑1 TTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCAT < 1:2806610/102‑1 TATTAAACTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAAC > 2:7775584/1‑149 CTACCCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATA > 1:944368/1‑149 CCTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGAC > 1:4587028/1‑149 CTAGCGACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGATCGAACGGATAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACA > 2:3850218/1‑149 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ACAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACAAAAATATGACAATCTGC > 2:1742613/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 2:8543617/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA > 1:3325826/1‑149 CAGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCA < 2:2789249/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAATTATGACAATCTGCAG > 2:6064147/1‑149 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG > 1:5156029/1‑149 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG < 1:6606797/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG < 2:7971755/149‑1 AGAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAG > 2:2338481/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTTAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC > 2:7083775/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC > 2:7245472/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC > 1:9247543/1‑149 GAGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGC > 2:636612/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:1897040/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:542194/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACAAAAATATGACAATCTGCAGCA > 1:1159352/1‑149 AGGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGACATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCA > 2:3418740/1‑149 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC > 2:1941952/1‑149 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 2:8598125/149‑1 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < 1:6977896/149‑1 GGTAAATACTTTAAAACTAACATTGAACTGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC > 2:2435717/1‑149 GGGGCAGAAAAAGGGGCAGAAATTTGACAATATTTAATTATCTTTGATAACTTTTAAAAACACCATAACTACTAAACACCTTTATTTACCTAGCTTTTGATAACTTTTAATAACAAAAGCTATTCTATGATAATCTATATTAAACTACCCTAGCGACAGAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < AM406671/779012‑778852‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cctagcgacagagGTAAATACTTTAAAACTAACATTTAAATGAGCTATTTTATAAAAAGGGGCTACAAAGGGGCATTATGGTTCTTGCTGGACTCGAACCAGCGACCGAACGGTTAGCTACCAACTGAGCTAAAGAACCAAAATATGACAATCTGCAGCAC < AM406671/820924‑820777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |