| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 778852 = | 1067 (1.000) | 33 (0.030) | 30/270 | 34.4 | 3.3% | intergenic (+11/+180) | rbsB/ps301 | ribose ABC transporter substrate binding protein RbsB/putative integrase |
| ? | AM406671 | = 820924 | 952 (0.980) | intergenic (+251/‑254) | ps358/llmg_0854 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1076 total aligned reads displayed.
GCTCAACAACCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCAAATTTCTGCCCC > AM406671/778704‑779000 | cTCAACAACCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAAct < 1:5436468/149‑1 (MQ=255) tCAACAACCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAActc < 1:49587/149‑1 (MQ=255) caacaaCCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAActct > 2:236538/1‑149 (MQ=255) aacaacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTAGCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTg < 1:6614104/149‑1 (MQ=255) aacaacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTg < 2:6600180/149‑1 (MQ=255) aacaacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTg < 1:6032025/149‑1 (MQ=255) acaacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTAACTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGt < 2:2573367/149‑1 (MQ=255) caacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTc > 2:8448331/1‑149 (MQ=255) caacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTc > 1:5196629/1‑149 (MQ=255) aacCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCg < 1:3847582/149‑1 (MQ=255) gCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAgg < 2:3788096/149‑1 (MQ=255) gCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAgg > 1:2921209/1‑149 (MQ=255) cTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAggg < 1:6229572/149‑1 (MQ=255) cTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAggg < 1:88758/149‑1 (MQ=255) tAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGt < 1:4172262/149‑1 (MQ=255) tAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAAAGGAAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGt < 2:2990584/149‑1 (MQ=255) aaGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTAACATGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTa < 2:86312/149‑1 (MQ=255) aGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAACTTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAg < 1:1196591/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTGGCTAGGGTAttt > 1:7635986/1‑149 (MQ=255) tGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTa > 1:5616179/1‑149 (MQ=255) ggTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTaa < 2:1277047/149‑1 (MQ=255) gTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAat < 1:8082025/149‑1 (MQ=255) aaaTGGCTTTGCAAGCTAACTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATAGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAAtata < 2:7273381/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGa < 1:8669061/149‑1 (MQ=255) aTGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGa > 2:7837301/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGAt > 2:6265644/1‑149 (MQ=255) tGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATGTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGAt < 1:9046998/149‑1 (MQ=255) cTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTGAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTAt < 1:5883304/149‑1 (MQ=255) tttGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATc < 1:6785576/149‑1 (MQ=255) ttGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAAAACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCa < 2:4883335/149‑1 (MQ=255) tGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCAt < 1:1007140/149‑1 (MQ=255) gCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAggg > 1:8415000/1‑127 (MQ=255) gCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATa < 1:3694250/149‑1 (MQ=255) cAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGAAGTTTAATACAGCTTACCATAg > 2:3474279/1‑149 (MQ=255) gCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAAt > 2:3901939/1‑149 (MQ=255) gCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAAt < 2:1900796/149‑1 (MQ=255) tGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTg < 2:4273487/149‑1 (MQ=255) tGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTg < 2:4748731/149‑1 (MQ=255) tGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTg > 1:1666169/1‑149 (MQ=255) gATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGt < 1:3534166/149‑1 (MQ=255) attattATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGtt > 1:2714257/1‑149 (MQ=255) ttatCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGttatta < 2:1125358/149‑1 (MQ=255) ttatCAAGGAAAGAAAATTACTACAGTGATTAATTCACCAAATTATATTGTAGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGttatta < 2:3123658/149‑1 (MQ=255) tatCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATCGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTaa < 1:5762018/149‑1 (MQ=255) atCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTaaa > 2:2707079/1‑149 (MQ=255) atCAAGGAAAGAAAATTTAGTCAGTGAGTAATTCACCAATTTATGTTGTGGATGAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGATTAATATAGATGATCATAAAATAGCTTTTGTTATTaaa > 2:5626202/1‑149 (MQ=255) tCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAATAATAAAAAAGTCTTTCGTTAGGATAGTTTAATATAGATTATAATAAAATAGCTTTTTTTATTaaaa > 2:2845254/1‑149 (MQ=255) tCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTaaaa > 2:7072692/1‑149 (MQ=255) agaaaATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCaa < 1:1549761/149‑1 (MQ=255) gaaaATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCaaa < 1:4535842/149‑1 (MQ=255) aaaTTTCTTCAGTGATTAATTCACCAAATTATCTTGTGGATAAAGCTACTGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTGTAATATAGATTATCATAGAATAGGTGTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAg < 2:5029029/149‑1 (MQ=255) aaTTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGc < 1:7979395/149‑1 (MQ=255) aTTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCt < 2:5725079/149‑1 (MQ=255) tttCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTa > 2:8245932/1‑149 (MQ=255) tttCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTa > 2:5217684/1‑149 (MQ=255) ttcttcAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAg > 2:5981207/1‑149 (MQ=255) tcttcAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCa < 1:1454587/140‑1 (MQ=255) cttcAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGt < 1:7259231/149‑1 (MQ=255) cAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGtaaa > 2:4397219/1‑149 (MQ=255) aGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGtaaat < 1:4329428/149‑1 (MQ=255) gTGATTAAATCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATTTTGATGAACACAAATAGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGtaaata < 2:1377464/149‑1 (MQ=255) aTTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAg > 2:9003231/1‑149 (MQ=255) aTTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAg > 2:5537287/1‑149 (MQ=255) aTTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAg < 2:1551445/149‑1 (MQ=255) ttCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGtt > 1:741020/1‑149 (MQ=255) ttCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGtt > 1:2087553/1‑149 (MQ=255) ttCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGtt < 1:1899480/149‑1 (MQ=255) ttCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGtt < 1:4060395/149‑1 (MQ=255) cACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTta > 1:8269613/1‑149 (MQ=255) cACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTta > 1:3073239/1‑149 (MQ=255) tttATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGtt < 1:786766/149‑1 (MQ=255) ttATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTa < 1:7121811/149‑1 (MQ=255) ttATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTa > 1:629971/1‑149 (MQ=255) aTCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATg < 2:9196237/149‑1 (MQ=255) ttGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGgtg < 1:2388420/149‑1 (MQ=255) tgtgGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGgtgt > 2:5872276/1‑149 (MQ=255) tgtgGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGgtgt > 2:6787638/1‑149 (MQ=255) gtgGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGtt > 1:7035229/1‑149 (MQ=255) tagATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGttt < 2:2235103/147‑1 (MQ=255) tGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCa < 2:8868011/149‑1 (MQ=255) tGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCa > 2:5402161/1‑149 (MQ=255) gTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCaa > 1:4652092/1‑149 (MQ=255) ctgaACACAAATGGTACAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGCAGTTTAATATAGATTATCATAGACTAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTGTAGTAGTCATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGaa > 2:1680435/2‑148 (MQ=255) atgaACACAAATAGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGAt < 2:7468189/149‑1 (MQ=255) aaCACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAAt < 1:2538064/149‑1 (MQ=255) cacaAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTa > 1:946155/1‑149 (MQ=255) cacaAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTa > 1:7527705/1‑149 (MQ=255) caAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTaaa > 1:8187738/1‑149 (MQ=255) aaaTGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAat < 2:8010931/149‑1 (MQ=255) aTGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAatat < 1:6864307/149‑1 (MQ=255) ggTAAATAGAAAAAACTTTGTCGATAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGGTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTg < 2:75902/149‑1 (MQ=255) gTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGt > 1:332283/1‑149 (MQ=255) aaaaGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCaa < 1:1772389/149‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCaaa < 2:6414748/149‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCaaa < 1:9205889/149‑1 (MQ=255) aaaGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCaaa > 1:2220869/1‑149 (MQ=255) gAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCAAAttt < 1:7768178/149‑1 (MQ=255) aaaaaCTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCTTAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCAAAtttct < 2:6925947/149‑1 (MQ=255) aCTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCAAAtttctgccc < 2:2003199/149‑1 (MQ=255) aCTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCAAAtttctgccc > 2:4586838/1‑149 (MQ=255) | GCTCAACAACCAGCTAAGATTGGTGAAATGGCTTTGCAAGCTACCTATGATTATTATCAAGGAAAGAAAATTTCTTCAGTGATTAATTCACCAATTTATCTTGTGGATAAAGATAATGTTGATGAACACAAATGGTAAAAAGAAAAAACTCTGTCGCTAGGGTAGTTTAATATAGATTATCATAGAATAGCTTTTGTTATTAAAAGTTATCAAAAGCTAGGTAAATAAAGGTGTTTAGTAGTTATGGTGTTTTTAAAAGTTATCAAAGATAATTAAATATTGTCAAATTTCTGCCCC > AM406671/778704‑779000 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |