| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AM406671 | 778852 = | 1067 (1.000) | 33 (0.030) | 30/270 | 34.4 | 3.3% | intergenic (+11/+180) | rbsB/ps301 | ribose ABC transporter substrate binding protein RbsB/putative integrase |
| ? | AM406671 | = 820924 | 952 (0.980) | intergenic (+251/‑254) | ps358/llmg_0854 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein predicted by Glimmer/Critica | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 1087 total aligned reads displayed.
TGTGCTGCAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAATGTTG > AM406671/820776‑821072 | tgtgCTGCAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTAc > 1:3247274/1‑149 (MQ=255) tgctgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCATGAACCATGATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACct < 2:5747023/149‑1 (MQ=255) tgctgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACct > 1:1424743/1‑149 (MQ=255) gctgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACctc < 1:5377056/149‑1 (MQ=255) ctgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACctct > 2:7971755/1‑149 (MQ=255) tgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTg < 2:5333104/149‑1 (MQ=255) tgcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTg < 1:3043209/149‑1 (MQ=255) gcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGt > 1:4901820/1‑149 (MQ=255) gcAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGt > 1:2128054/1‑149 (MQ=255) aGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCg > 2:2530799/1‑149 (MQ=255) gATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGc > 1:1926178/1‑149 (MQ=255) aTTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCt > 2:4033322/1‑149 (MQ=255) tCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGa < 2:655708/149‑1 (MQ=255) cATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGAt > 2:430788/1‑149 (MQ=255) cATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGAt < 1:1182711/149‑1 (MQ=255) tatTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATag < 1:6763796/149‑1 (MQ=255) atTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATaga > 2:1059106/1‑149 (MQ=255) ttttGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATagag > 2:1565891/1‑149 (MQ=255) gTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGttttt > 1:8181756/1‑149 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATAtt < 1:2298045/149‑1 (MQ=255) tAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATAtt < 2:3825949/149‑1 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGTTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGACCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTa > 2:4903970/1‑149 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTa < 2:6332773/149‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTaaaa > 2:1225640/1‑149 (MQ=255) tCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTCTTATATTaaaa < 1:4677021/149‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTATATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTaaaaaa < 2:2255513/149‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTaaaaaa < 1:7642064/149‑1 (MQ=255) aGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTaaaaaa < 1:3776554/149‑1 (MQ=255) ttGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGt > 2:8929368/1‑149 (MQ=255) ttGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGt > 1:2574486/1‑149 (MQ=255) ttGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGt > 1:7156969/1‑149 (MQ=255) ggTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTAc > 2:5235279/1‑149 (MQ=255) ggTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTAc < 1:3652794/149‑1 (MQ=255) ggTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTAc < 2:8252037/149‑1 (MQ=255) gCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGc < 2:1753990/149‑1 (MQ=255) aaCCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGa < 1:5035467/149‑1 (MQ=255) ccGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATa > 2:3388080/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAg > 2:3222496/1‑149 (MQ=255) tCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAgg < 1:6354175/149‑1 (MQ=255) tCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAgg > 2:6056722/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGgtagt < 2:6854660/149‑1 (MQ=255) cTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACg > 2:4732616/1‑149 (MQ=255) tGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACgg < 1:2432968/149‑1 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGc > 1:6891911/1‑149 (MQ=255) ggTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGc < 1:1645555/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCa < 2:4179803/149‑1 (MQ=255) gTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCa > 2:9194216/1‑149 (MQ=255) ttCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCGCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTGTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCAt > 2:8721463/1‑149 (MQ=255) ttCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGATTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCAt < 2:6640663/149‑1 (MQ=255) tCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATa > 1:6445571/1‑149 (MQ=255) aGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATaaaa > 1:2945690/1‑149 (MQ=255) aaCCATAATGCCCCATTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAta > 1:3528012/1‑149 (MQ=255) cATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAtaaat < 1:337585/149‑1 (MQ=255) tGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGATTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAtaaattaaat > 2:7713217/1‑149 (MQ=255) ccccTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAatat < 1:5749843/149‑1 (MQ=255) ccTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATAttt > 1:1024729/1‑149 (MQ=255) tttGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTGGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAg < 1:6613809/149‑1 (MQ=255) aGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAAtaaattaaa > 1:1801290/1‑137 (MQ=255) 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aaaGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAAtt > 1:8003554/1‑149 (MQ=255) aaGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAAttt > 1:2816153/1‑149 (MQ=255) aaGTATTTACCTCCGTCGCTAGGAAAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAACCTGATACATGTAGTAAGGCATAAAATACTCACAATAAATTAAATAGATAGAAACAAAATAAATAGATGCTATTGGTATAAAAAATGCCATCAActt > 2:1913332/1‑149 (MQ=255) tATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTtata > 2:8503131/1‑149 (MQ=255) aTTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATaa < 2:3031798/149‑1 (MQ=255) aTTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATaa > 2:1399307/1‑149 (MQ=255) tttACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAt > 1:5471262/1‑149 (MQ=255) tttACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAt < 1:4541995/149‑1 (MQ=255) ttACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAtg > 2:7069246/1‑149 (MQ=255) aCCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAtgtt > 2:2370798/1‑149 (MQ=255) aCCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAtgtt < 2:6754843/149‑1 (MQ=255) ccTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAAtgttg > 2:2824875/1‑149 (MQ=255) | TGTGCTGCAGATTGTCATATTTTGGTTCTTTAGCTCAGTTGGTAGCTAACCGTTCGGTCGCTGGTTCGAGTCCAGCAAGAACCATAATGCCCCTTTGTAGCCCCTTTTTATAAAATAGCTCATTTAAATGTTAGTTTTAAAGTATTTACCTCTGTCGCTAGGATAGAGTTTTTTATATTAAAAAAGTACAAGCTGATACAGGTAGTACGGCATAAAATATTCACAATAAATTAAATATTTAGGAGCAGAATCAATAGAGGCTATGGGTATAAAAAATTACATCAATTTATAATGTTG > AM406671/820776‑821072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |