| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 44 (0.260) | 167 (1.060) | 62/68 | 0.1 | 83.4% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 25 (0.160) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 368 total aligned reads displayed.
TAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGC > REL606/1733252‑1733324 | aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAAc < 2:10504316/37‑1 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAAc < 1:185817/37‑1 (MQ=255) tcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 2:7592355‑M1/4‑1 (MQ=255) tcggcaaaagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 1:9005068‑M1/4‑1 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACgg > 1:4438472/1‑36 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt > 1:10010119/1‑37 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt > 1:5831826/1‑37 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt < 2:5661497/37‑1 (MQ=255) cggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt > 1:1641789‑M1/33‑37 (MQ=255) cggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt > 2:555802‑M1/33‑37 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta > 1:10178986‑M1/32‑37 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta > 2:10433854‑M1/32‑37 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta > 2:1165708‑M1/32‑37 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta < 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tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 2:5816846‑M2/37‑5 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGGAACGCACGaacg < 1:1031916‑M2/37‑5 (MQ=255) agcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAgg > 2:2527260‑M1/26‑37 (MQ=255) cgaaatgggtgcggtaacgtatgAAAGTATGGAGGtt < 1:9982849‑M1/14‑1 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt < 1:8915953‑M1/15‑1 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt > 2:4707994‑M1/23‑37 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt < 2:3404503‑M1/15‑1 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat > 2:7214879‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat < 2:203874‑M2/37‑8 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat < 2:10099834‑M2/37‑8 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTGGCGGTAACGTATGaacgtat > 1:5311400‑M2/1‑30 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 1:7661643‑M2/37‑9 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 1:8862834‑M2/37‑9 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 1:8226252‑M2/37‑9 (MQ=255) aaattgttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGGTTc < 1:6794646‑M1/16‑1 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 1:4623682‑M1/16‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga > 2:413987‑M2/1‑28 (MQ=255) atggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 2:6948048‑M1/18‑1 (MQ=255) tggttgcggtaacgtatgAACGTATGACGGTTTCact < 2:2110293‑M1/19‑1 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag > 2:1536981‑M2/1‑26 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag < 1:6836907‑M2/37‑12 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag < 1:1161049‑M2/37‑12 (MQ=255) gCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggt < 2:10971723‑M2/37‑14 (MQ=255) gCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggt < 1:9546815‑M2/37‑14 (MQ=255) ttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 1:4382645‑M1/22‑1 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg > 2:3574600‑M1/15‑37 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt > 1:8773272‑M2/1‑22 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa > 2:4582642‑M1/14‑37 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 1:410851‑M2/1‑20 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca < 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tatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 1:2988229‑M1/33‑1 (MQ=255) tatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 2:7104240‑M1/33‑1 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 1:7910199‑M2/37‑26 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac > 2:3815429‑M2/1‑12 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac > 1:5472403‑M2/1‑12 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 1:9939857‑M2/37‑26 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 2:2231288‑M1/34‑1 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg > 2:8354281‑M1/3‑37 (MQ=255) gTAGCGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 2:6758301‑M2/1‑10 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 1:9076634‑M2/1‑10 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgt < 1:619465‑M2/37‑30 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 1:2145993‑M1/37‑1 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 1:712118‑M1/37‑1 (MQ=255) | TAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGC > REL606/1733252‑1733324 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |