| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 880528 = | 240 (1.260) | 6 (0.040) | 6/122 | 15.7 | 3.4% | intergenic (+17/+163) | ybjK/ECB_00814 | predicted DNA‑binding transcriptional regulator/conserved hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 904682 | 149 (0.960) | intergenic (+77/+159) | ECB_00851/ybjL | protein similar to prophage P2 OGR protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
ACCGTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGGTGGT > REL606/880453‑880603 | accgTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa > 1:667833/1‑76 (MQ=255)accgTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 1:3613126/76‑1 (MQ=255)accgTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATa < 2:2017034/76‑1 (MQ=255) ccgTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa > 1:95147/1‑76 (MQ=255) ccgTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTCCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATaa < 1:2175183/76‑1 (MQ=255) gTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACa < 1:797271/76‑1 (MQ=255) gTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACa < 1:5906946/76‑1 (MQ=255) tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa > 2:2968401/1‑76 (MQ=255) tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa > 1:2729069/1‑76 (MQ=255) tAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaa > 1:2402523/1‑76 (MQ=255) gCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaa < 2:4410430/76‑1 (MQ=255) ccGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa < 1:3085382/76‑1 (MQ=255) ccGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACaaaaaa < 1:1516032/76‑1 (MQ=255) cTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc > 2:4772850/1‑76 (MQ=255) cTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAAccc > 2:3904371/1‑76 (MQ=255) tATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCa > 2:1027067/1‑76 (MQ=255) aTCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCAt < 2:12874/76‑1 (MQ=255) gcgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTa < 1:5340881/76‑1 (MQ=255) cgcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTAt < 2:5078574/76‑1 (MQ=255) gcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 1:3858199/76‑1 (MQ=255) gcgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 1:3921072/76‑1 (MQ=255) gcgAGGAGATGTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATg < 2:1525601/76‑1 (MQ=255) cgAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGt > 1:6073500/1‑76 (MQ=255) gaggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTa > 2:1983143/1‑76 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaa < 2:3295416/76‑1 (MQ=255) aggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaa < 1:726121/76‑1 (MQ=255) ggagATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTaaa < 2:667833/76‑1 (MQ=255) agaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACg < 2:4144382/76‑1 (MQ=255) gaTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACgg < 2:4875030/76‑1 (MQ=255) aTTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACggg < 1:229019/76‑1 (MQ=255) ttttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCCGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGt > 1:3799453/1‑76 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt < 1:6296894/76‑1 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt > 2:1209228/1‑76 (MQ=255) tttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGtt > 2:3591050/1‑76 (MQ=255) ttGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTa < 1:4732149/76‑1 (MQ=255) gAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAAt < 1:4396105/76‑1 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 1:4810016/76‑1 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg < 2:3673138/76‑1 (MQ=255) aGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATg > 1:1139195/1‑76 (MQ=255) aTGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaa > 2:1443707/1‑76 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa < 1:4584493/76‑1 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa < 1:5560167/76‑1 (MQ=255) tGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGaaaa > 2:5959291/1‑76 (MQ=255) ggTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAAc < 1:2931851/76‑1 (MQ=255) ttGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACaa < 1:511309/76‑1 (MQ=255) tGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAAt < 1:5398971/76‑1 (MQ=255) tGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAAt < 1:2201656/76‑1 (MQ=255) gagaGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATa > 2:1677417/1‑76 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 2:6158830/76‑1 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa < 1:6260864/76‑1 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa > 1:250705/1‑76 (MQ=255) agagGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATaa > 1:4231035/1‑76 (MQ=255) agGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGt < 2:3977390/76‑1 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTta > 1:2488581/1‑76 (MQ=255) ggTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTta > 2:5189512/1‑76 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata < 1:2464882/76‑1 (MQ=255) ttGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTtata < 2:4610066/76‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg < 1:2852239/76‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg < 2:4269220/76‑1 (MQ=255) tGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAg > 2:4541560/1‑76 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAAt > 2:5789340/1‑66 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 2:831443/76‑1 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 2:4643606/76‑1 (MQ=255) gCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGt < 1:1250754/76‑1 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa > 2:1829117/1‑76 (MQ=255) cAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTa < 1:4116653/76‑1 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 1:3545912/1‑76 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa > 1:1889237/1‑76 (MQ=255) aGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaa < 2:295078/76‑1 (MQ=255) gggTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaa > 2:5281471/1‑76 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa < 1:4528913/76‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa < 2:6126305/76‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa < 2:3538937/76‑1 (MQ=255) gtagtaGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTaaaaa < 1:5223008/76‑1 (MQ=255) tagtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAAc < 1:5807860/76‑1 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa > 1:1917906/1‑76 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa > 2:4359158/1‑76 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa < 1:6168840/76‑1 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa > 1:5695117/1‑76 (MQ=255) agtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACa < 1:4072524/76‑1 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACaa < 2:3081295/76‑1 (MQ=255) gtagATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACaa < 2:5945678/76‑1 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa > 1:1548789/1‑76 (MQ=255) agATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATa < 1:396281/76‑1 (MQ=255) aTAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg > 2:2424326/1‑76 (MQ=255) aTAAATTTCAGGCAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAg > 2:5583550/1‑76 (MQ=37) aaGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgtt < 1:495477/76‑1 (MQ=255) aGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttg < 2:2500120/76‑1 (MQ=255) ttttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttggg > 1:231623/1‑76 (MQ=255) ttAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggtt > 1:1003576/1‑76 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg > 1:2380076/1‑76 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg > 2:2451741/1‑76 (MQ=255) tAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAgttgggttg > 1:3248514/1‑76 (MQ=255) ggcaaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTtggt > 2:5736615/4‑76 (MQ=255) gcaaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTtggtg < 1:266138/74‑1 (MQ=255) aTAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTtggtg > 2:547069/1‑76 (MQ=255) tAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTtggtgg > 1:3683315/1‑76 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTggtggt < 1:4366382/76‑1 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTggtggt > 2:1105320/1‑76 (MQ=255) aaCAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTggtggt < 1:3478473/76‑1 (MQ=255) | ACCGTAAGCCGCTATCGCGCGAGGAGATTTTGAGGATGGTTGAGAGGGTTGCAGGGTAGTAGATAAGTTTTAGATAACAAAAAACCCATTTATGTAAACGGGTTAATGAAAACAATAAGTTATAGTAAAAACAATAAGTTGGGTTGGTGGT > REL606/880453‑880603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |