| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4384397 | 325 (1.320) | 235 (0.960) | 99/148 | 0.5 | 42.0% | coding (53/426 nt) | yjeB | predicted DNA‑binding transcriptional regulator |
| ? | REL606 | 4505342 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
CGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4384323‑4384397‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > REL606/4505342‑4505417 CGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCG > 2:3791717/1‑76 GATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGG > 2:2728765/1‑76 TTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTA < 1:4722773/76‑1 TTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAA < 2:7594482/76‑1 TCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAAT > 2:7211471/1‑76 TCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAAT > 1:6891871/1‑76 CCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATG < 2:7016650/76‑1 CCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATG > 1:4880346/1‑76 CCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATG > 1:6495543/1‑76 CCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGA > 2:6373669/1‑76 TTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACT < 2:2136128/76‑1 TTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTC > 1:6536094/1‑76 TTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCC > 2:3183408/1‑76 TTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCC > 1:6625180/1‑76 TGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCA > 1:1127019/1‑76 TGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCA > 2:6591380/1‑76 GAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAA > 2:7440602/1‑76 GAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAA < 2:6135663/76‑1 GAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAA < 2:7524230/76‑1 AGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAAC > 2:1124332/1‑76 AGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAAC < 1:8186545/76‑1 GGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCACCT > 1:361046/1‑76 GGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACT < 1:5878459/76‑1 GTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTT > 1:1597111/1‑76 TGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTAT > 2:4513790/1‑76 TGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTAT < 2:2458183/76‑1 TGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTAT < 1:1013526/76‑1 TGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTAT > 1:1227093/1‑76 ATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAAATTATTG > 2:6307242/1‑76 TGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:7675048/76‑1 CAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:3394648/76‑1 GTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 2:1538262/76‑1 GTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:2035396/76‑1 GTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT > 1:3855024/1‑76 AACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:4403783/1‑76 ACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:3769751/76‑1 ACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 2:3958825/76‑1 CGAGTTTCACTTATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGTCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:7341296/76‑1 GAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 2:1021573/76‑1 GTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:7718893/76‑1 TTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 1:6965604/76‑1 TTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:5948148/76‑1 CACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:8010114/76‑1 TGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA > 2:4019870/1‑76 GATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:4345777/1‑76 GATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 1:3513793/76‑1 TTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 2:4211131/1‑76 CGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 1:5074477/76‑1 GGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:5163310/76‑1 ATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 1:8152909/1‑76 ATTACGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 2:5348816/76‑1 CGTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT > 2:5824142/1‑76 GTGCGCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 1:590446/76‑1 GCTGATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 2:6877111/1‑76 GATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:1896244/76‑1 GATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:2933220/76‑1 GATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 1:6709302/1‑76 GATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 1:2464296/1‑76 ATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA > 2:6732604/1‑76 ATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA > 2:2863941/1‑76 ATCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 2:2382807/76‑1 TCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCcg > 2:3073418/1‑74 TCTACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG < 2:8282833/76‑1 TACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT < 1:6373669/76‑1 TACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT > 1:4368515/1‑76 ACATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC < 2:5206409/76‑1 CATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 1:853829/76‑1 CATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 1:3171528/76‑1 CATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 1:615122/76‑1 ATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 2:3544824/76‑1 ATGGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 2:5861172/76‑1 GCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG > 1:4822662/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:6941763/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:7236255/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:3965724/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < 2:3422410/76‑1 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:2584210/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:7547022/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:219731/1‑76 CGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:1451114/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTGTGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:1680571/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 2:6207966/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:8087804/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:6841698/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:1057720/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:1887441/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 1:2538281/76‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:2967510/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:4188216/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:4665063/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 1:5454024/76‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 1:5745191/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 2:5575606/76‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 2:1355531/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 2:1756678/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 2:196134/76‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 2:2093649/76‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 2:2517798/76‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > 2:2635457/1‑76 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 2:5009704/76‑1 CGATTTCCCTTTTGAGGTTGATGTGCAGTTAACGAGTTTCACTGATTACGGATTACGTGCGCTGATCTACATGGCg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/4384323‑4384397‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT > REL606/4505342‑4505417 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |