| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 2,298,770 | (ATCACTGC)1→2 | coding (313/1359 nt) | glpT ← | sn‑glycerol‑3‑phosphate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2298762 = | 24 (0.100) | 184 (0.800) | 94/148 | 0.5 | 91.4% | coding (321/1359 nt) | glpT | sn‑glycerol‑3‑phosphate transporter |
| ? | REL606 | = 2298769 | 11 (0.050) | coding (314/1359 nt) | glpT | sn‑glycerol‑3‑phosphate transporter | |||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
CATGGGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2298837‑2298762‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCTCT < REL606/2298769‑2298695 CATGGGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATG < 1:3971276/76‑1 TGGGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCA < 1:3553228/76‑1 GGGTTTGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAG < 1:7016868/76‑1 GGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGT < 1:6649100/76‑1 GGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGT < 1:6997556/76‑1 GGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGT < 1:3780371/76‑1 GGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGT < 1:5504181/76‑1 GTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTG < 1:5903643/76‑1 GTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTG < 1:6121582/76‑1 GTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCACGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTG < 1:3193995/76‑1 TCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCCGGGGTGCAGTGAT > 1:2703223/1‑76 CGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCCGTGGTGCAGTGgag > 2:2503006/1‑73 CGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCCGGGATGCAGTGATGTTGTTT > 2:4802993/1‑76 CGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCCGTGATGTTGTTT > 1:2841015/1‑76 CGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTCTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTT < 1:1904347/76‑1 GGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTA < 2:2325794/76‑1 GGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTA < 2:1204487/76‑1 GATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTAT < 1:4314205/76‑1 TCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGGAGTGATGTTGTTTATGG > 2:293256/1‑76 TCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGG < 2:2114017/76‑1 TCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGG < 2:3784487/76‑1 GCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCCGGGGTGCGGTGAGGTTGTTTATGGGC > 1:2154761/1‑76 CTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTTGCGGCGGCAGAGATGCAGTGGTGGTGTTTATGGGgt > 2:1132876/1‑74 CGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCCGTGATGTTGTTTATGGGCTTT > 2:2663472/1‑76 CGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGATTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTT < 1:1031687/76‑1 CGAATCCGCCCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTT < 1:5797871/76‑1 AATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGGGATGTTGTTTATGGGCTTTGT > 1:3817064/1‑76 CCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCC < 1:2797067/76‑1 CGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCA < 2:3370971/76‑1 GCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCAT < 1:7390150/76‑1 CGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATG > 1:6070187/1‑76 GCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGG < 2:1407491/76‑1 GCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGG < 1:5709256/76‑1 CGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGG < 2:2629548/76‑1 TTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCG < 1:5075105/76‑1 TTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCG > 1:5332677/1‑76 TTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGg > 2:856016/1‑75 TTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGA < 1:6396716/76‑1 TTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGAGATGTTGGTTATGGGCTTTGTGCCATGGGGGA > 2:6398331/1‑76 TTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGAC > 2:1041756/1‑76 TTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGAC > 1:4114259/1‑76 CCTGCCCGCAGGTTTGATGCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGT < 1:7147419/76‑1 CTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTC < 2:371646/76‑1 CTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTC < 1:3435779/76‑1 CTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTC < 2:1895569/76‑1 CTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTC > 1:4498406/1‑76 TGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGGTGCAGGGATGTTGTTTATGGGCTTTTTGCCCTGGGGGCCGTCG > 2:2209402/1‑76 CCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGC > 1:4384703/1‑76 CCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGC < 2:2298127/76‑1 CGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCA < 1:3278886/76‑1 GCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAACAT < 2:41239/76‑1 CAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATT < 1:6197484/76‑1 CAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATT < 1:667261/76‑1 CAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATT < 1:2631712/76‑1 CAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATT < 1:357743/76‑1 AGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGCGCATTG > 2:4832122/1‑76 AGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTG < 2:4509506/76‑1 GGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGC < 2:440852/76‑1 TTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGG < 1:1217975/76‑1 TTTGATTCTGGCGGCGGCAGGGGTGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCCACGTCGGGGCTTGCGG > 2:4485956/1‑76 TTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGg > 2:7314936/1‑75 TGATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTG < 1:2398493/76‑1 GATTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGA > 1:5095748/1‑76 GATTCTGGCGGCGGCAGTGAAGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGA > 2:5651291/1‑76 TTCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATG > 2:1500128/1‑76 TCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGT > 1:688097/1‑76 TCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGT < 2:6530704/76‑1 TCTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTGTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGT < 2:5591142/76‑1 CTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCCTGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTT > 2:5863785/1‑76 CTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTT > 2:6078791/1‑76 CTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTT > 1:1646270/1‑76 CTGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTT > 2:309726/1‑76 TGGCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTT > 2:1418473/1‑76 GCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGT < 1:5273980/76‑1 GCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGT < 1:1100744/76‑1 GCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGT < 2:5398536/76‑1 GCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGT < 1:4222735/76‑1 GCGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGT < 1:296622/76‑1 CGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTA < 1:173658/76‑1 CGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTA < 2:365910/76‑1 CGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTA < 1:7654503/76‑1 CGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTA > 1:3765520/1‑76 CGGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGGGATGTTTGTA > 1:4828235/1‑76 GGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTAC > 2:5232217/1‑76 GGCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTAC < 2:6839591/76‑1 GCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACT < 1:2445028/76‑1 GCGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACT < 2:7506463/76‑1 CGGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTG > 1:4674506/1‑76 GGCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGT < 1:21071/76‑1 GCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTTCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTT < 1:7418117/76‑1 GCAGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTT < 2:1707336/76‑1 AGTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGT < 2:6970005/76‑1 GTGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTT > 1:5886997/1‑76 TGATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGCGCATTGCGGTGATGTTTGTCCTGTTGTTC > 2:3199655/1‑76 GATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGTGCTTTTCGGGGATGTTTGTACTGTTGTTCC > 1:884051/1‑76 ATGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCT > 1:6491644/1‑76 TGCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCTC < 2:6073853/76‑1 GCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCTCT < 1:4613118/76‑1 GCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCTCT < 2:6161700/76‑1 GCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCTCT < 1:4213817/76‑1 CATGGGTTCGGTATCGGATCGCTCGAATCCGCGCGTTTTCCTGCCCGCAGGTTTGATTCTGGCGGCGGCAGTGATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2298837‑2298762‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gCAGTGATGTTGTTTATGGGCTTTGTGCCATGGGCGACGTCGAGCATTGCGGTGATGTTTGTACTGTTGTTCCTCT < REL606/2298769‑2298695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |