| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 474,423 | IS1 (+) +8 bp | coding (876‑883/1677 nt) | ybaL ← | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 474423 = | 4 (0.020) | 359 (1.490) | 114/150 | 0.1 | 98.8% | coding (883/1677 nt) | ybaL | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
| ? | REL606 | 589555 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 474430 | 4 (0.020) | 327 (1.360) | 113/150 | 0.1 | 98.7% | coding (876/1677 nt) | ybaL | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
| ? | REL606 | = 547699 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CCGCCCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/474497‑474423‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > REL606/589555‑589629 CCGCCCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCG < 2:7516169/76‑1 CGCCCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGG > 2:904583/1‑76 GCCCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGT < 1:319522/76‑1 GCCCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGT < 1:262877/76‑1 CCCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTA < 2:2096725/76‑1 CCACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAA < 2:4720834/76‑1 CACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAAT < 2:3418999/76‑1 CACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAAT < 1:4928841/76‑1 CACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAAT < 1:2740524/76‑1 CACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAAT > 1:2294071/1‑76 ACGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATG > 2:3760004/1‑76 CGATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGA < 1:7505074/76‑1 ATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGGTGTTGTTTGATCGGTAATGACT > 2:7674995/1‑76 ATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACT < 2:1556418/76‑1 ATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACT < 1:3262067/76‑1 ATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACT > 1:1003829/1‑76 ATACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACT > 1:3892331/1‑76 ACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCC > 2:222552/1‑76 ACGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCC < 2:4881210/76‑1 CGCTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCA < 1:3686043/76‑1 CTGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAAC > 2:4358633/1‑76 TGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACT > 1:6295062/1‑76 TGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACT > 2:6213261/1‑76 GCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTT < 2:3036030/76‑1 GCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTT < 2:6918442/76‑1 CCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTA < 1:5351917/76‑1 CATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTAT < 2:4254491/76‑1 CATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTAT > 2:401941/1‑76 CATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTAT < 1:6199875/76‑1 ATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:884630/1‑76 TTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTG < 2:7018446/76‑1 TTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:1687016/1‑76 TGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:3528705/1‑76 GCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:1693918/76‑1 GCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:562399/76‑1 GCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG < 2:7801655/76‑1 CGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:3015792/76‑1 GACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 2:5917425/76‑1 GACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:3773647/76‑1 ACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT > 2:2942613/1‑76 GTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 2:501752/1‑76 GTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 2:5970413/76‑1 TTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:4804125/1‑76 TTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:4330028/76‑1 TTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:7172747/1‑76 TGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT > 2:3514288/1‑76 GCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:1269384/76‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |