Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 474,423 | IS1 (+) +8 bp | coding (876‑883/1677 nt) | ybaL ← | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 474423 = | 4 (0.020) | 359 (1.490) | 114/150 | 0.1 | 98.8% | coding (883/1677 nt) | ybaL | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
? | REL606 | 589555 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 474430 | 4 (0.020) | 327 (1.360) | 113/150 | 0.1 | 98.7% | coding (876/1677 nt) | ybaL | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
? | REL606 | = 547699 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
GACTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/474356‑474430 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < REL606/547699‑547625 GACTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACG > 1:5616950/1‑76 GACTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACG < 2:1552228/76‑1 ACTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGG < 1:666237/76‑1 ACTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGG > 2:5513196/1‑76 CTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGT > 2:1677471/1‑76 CTTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGT < 1:2669823/76‑1 ttcCCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTG < 2:4110372/73‑1 taACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTG < 1:2533209/74‑1 TTACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTG > 2:1327429/1‑76 TACTAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGA > 2:2137465/1‑76 TACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGA > 1:3975015/1‑76 TACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGA > 2:1992096/1‑76 ACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGAT < 2:7187171/76‑1 ACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGAT > 2:7885076/1‑76 ACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGAT < 1:4520742/76‑1 ACCAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGAT > 1:4152285/1‑76 CAAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGC > 2:567324/1‑76 AAACAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCT < 1:4663090/76‑1 CAGAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCC > 2:2434583/1‑76 GAATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAA < 1:6094159/76‑1 AATAATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAAC < 1:6766524/76‑1 AATCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:3673959/76‑1 TCGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:2932692/76‑1 CGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 1:3579791/1‑76 CGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:7128033/76‑1 CGCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:3764587/76‑1 GCCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 2:1192596/76‑1 CCAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 2:2035409/1‑76 CAGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:535619/76‑1 AGCGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 2:6923197/1‑76 GCGTCGCCAGCCCTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAA‑GGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:3545762/76‑1 GCGTCGCCACCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 2:7500002/76‑1 ctTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:1141236/74‑1 CGTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 2:2317961/1‑76 GTCGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:547244/1‑76 TCGCCAGCCCTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 2:1800716/76‑1 CGCCAGCACTGCCAGCGGTTGCTGAATCAGAATTAACGGATCAAACGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:599382/1‑76 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |