| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,488 | IS4 (+) +14 bp | intergenic (+19/+18) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448488 = | 5 (0.030) | 308 (1.270) | 119/148 | 0.0 | 98.1% | intergenic (+19/+31) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 4483982 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448501 | 5 (0.030) | 271 (1.110) | 112/150 | 0.1 | 97.8% | intergenic (+32/+18) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 4485407 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
CTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448563‑2448488‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA > REL606/4483982‑4484056 GCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTA < 1:4856792/76‑1 GCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTA > 2:7314903/1‑76 agGGGTATTTGATTGGCCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAAT < 1:71942/74‑1 GTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCA > 2:8064348/1‑76 TATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAG < 1:7431228/76‑1 ATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTCAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCCGT > 1:3071027/1‑76 ATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGT > 2:4886865/1‑76 tgtATTGGCCGCCCCCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCA < 2:3440059/73‑1 TTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCA > 2:1867654/1‑76 TTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCA > 1:8108506/1‑76 TGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAG > 1:3183455/1‑76 TGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAG < 2:1652257/76‑1 TGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAG > 2:5424405/1‑76 TGATGGGTCCCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAG < 2:775411/76‑1 TTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTA > 1:6548918/1‑76 TTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTA < 2:3958863/76‑1 TTGGTCCCCCCCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTA < 2:2969672/76‑1 TGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAA > 2:8103915/1‑76 TGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAA > 2:799209/1‑76 GGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAG < 1:2316958/76‑1 TCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCA > 2:3844570/1‑76 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAAC > 2:1491606/1‑76 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAAC > 2:7438647/1‑76 GCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAAC > 2:1759320/1‑76 CCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACT < 2:467480/76‑1 CGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGA < 1:1704338/76‑1 GCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCCACTGAC > 1:3111103/1‑76 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTG > 2:5267545/1‑76 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGG < 2:5853765/76‑1 CCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGC > 1:5209374/1‑76 ATTAGCTGATTAACAGGCGT‑AAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCT < 2:6584482/76‑1 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTT > 2:7145027/1‑76 AGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTT < 2:701382/76‑1 AGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTT > 2:1141858/1‑76 AGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCACTTT > 1:1277825/1‑76 CTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTT < 2:2106326/76‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTC < 1:3507591/76‑1 TGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTC < 2:6481084/76‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGG < 1:4573561/76‑1 ATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGATCTTTTTCGG > 2:2702452/1‑76 TTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGG > 2:2006802/1‑76 TAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGG > 1:5702104/1‑76 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGTGGC > 2:4403654/1‑76 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCT < 2:3681913/76‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGGCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCT < 2:2862556/76‑1 AGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTTGGGGCTGT > 1:4161003/1‑76 GCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGG < 2:2395807/76‑1 CGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGG > 2:6056355/1‑76 GTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGG > 1:296836/1‑76 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGT < 2:5617683/76‑1 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGT > 1:1588839/1‑76 TAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAAATGACTGGCTCTTTTTCTGGGCTGGGGGGg > 1:6344485/1‑75 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGga > 1:3004608/1‑74 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTA < 2:6409992/76‑1 AAAAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTA > 2:1030412/1‑76 AAAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATT < 2:2409016/76‑1 AAAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTAACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTT > 2:4109528/1‑76 AAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTC > 2:8142840/1‑76 AAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTC > 1:819001/1‑76 AAACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGCTTGGGGGGTATTTC > 2:7528981/1‑76 AACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCC < 1:4669810/76‑1 AACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCC < 2:2226625/76‑1 ACCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCA < 1:1541868/76‑1 CCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAG < 1:7054897/76‑1 CCGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAG > 1:3314400/1‑76 CGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGG < 1:5983365/76‑1 CGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGG < 2:5818104/76‑1 CGGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGG < 2:6766642/76‑1 GGGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGG < 2:2354452/76‑1 GGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGC > 1:7707609/1‑76 GGGAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGATTTCCAGGGC > 1:1011505/1‑76 GAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCT < 2:7948128/76‑1 GAATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCT > 2:7661584/1‑76 AATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTC > 2:4958794/1‑76 AATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTC < 2:6325959/76‑1 AATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGATTTCCAGGGCCTC > 2:6851378/1‑76 ATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCT > 2:849731/1‑76 ATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCT < 2:5329571/76‑1 ATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCT > 1:3885024/1‑76 ATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCT < 1:5837698/76‑1 ATTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTCAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCT > 2:7579113/1‑76 TTATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTC > 1:1206636/1‑76 ttTCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGAGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCATCTCC > 2:3199366/3‑76 TATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGATTTCCAGGGCCTCTCC > 2:4274236/1‑76 TATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGCATTTCCAGGGCCTCTCC > 2:6261009/1‑76 ATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCT > 2:1367311/1‑76 ATCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCT > 2:1284565/1‑76 TCCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTT > 1:776631/1‑76 CCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTT < 2:3372445/76‑1 CCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTT > 2:1890065/1‑76 CCCCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTT > 1:3762659/1‑76 CCGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAC < 2:7232209/76‑1 CGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAgc > 2:5008173/1‑74 CGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACC < 1:208188/76‑1 CGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACC > 1:2673075/1‑76 CGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACC > 2:5110868/1‑76 GTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA > 2:4588621/1‑76 GTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA > 1:7616921/1‑76 GTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA < 1:8015709/76‑1 GTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA > 2:6834972/1‑76 CTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448563‑2448488‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCA > REL606/4483982‑4484056 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |