| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,488 | IS4 (+) +14 bp | intergenic (+19/+18) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448488 = | 5 (0.030) | 308 (1.270) | 119/148 | 0.0 | 98.1% | intergenic (+19/+31) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 4483982 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448501 | 5 (0.030) | 271 (1.110) | 112/150 | 0.1 | 97.8% | intergenic (+32/+18) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 4485407 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
GGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2448427‑2448501‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCG < REL606/4485407‑4485333 GGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCT < 2:2404518/76‑1GGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCT > 1:572883/1‑76GGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCT < 2:7630873/76‑1 GTGAGTGTGGTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTA > 2:7556485/1‑76 TGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAA > 2:3125320/1‑76 AGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATG > 2:1357889/1‑76 GTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGC > 2:5828694/1‑76 TGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCC > 2:6305596/1‑76 TGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCC > 2:3834078/1‑76 GTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCG < 1:548103/76‑1 TGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGA < 1:5550966/76‑1 CTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATC < 2:4672389/76‑1 CTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATC < 1:4074156/76‑1 CTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATC < 2:3303469/76‑1 TGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCA > 2:6512984/1‑76 TGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCA < 1:7260728/76‑1 TGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCA < 1:2248042/76‑1 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CGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGT > 1:7589824/1‑76 GCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTT > 2:5986967/1‑76 GCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTT < 1:7828348/76‑1 CAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTG < 2:3988412/76‑1 CAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTG < 1:3145006/76‑1 CAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTG < 2:1760105/76‑1 CACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACC < 1:8111495/76‑1 ACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCG < 2:4540511/76‑1 ACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCG < 2:2885466/76‑1 ACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCG > 1:735863/1‑76 ACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCG < 2:5654484/76‑1 CTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGA > 2:4793019/1‑76 CTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGA > 2:1311235/1‑76 GTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCC < 1:100022/76‑1 TGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCA < 1:2688609/76‑1 TGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCA < 2:2123253/76‑1 GCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAG < 1:1396990/76‑1 CTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGT > 1:3785402/1‑76 CTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGT > 1:6764238/1‑76 TGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTG > 2:788380/1‑76 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AAAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGA < 1:4856027/76‑1 AAGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAA < 1:6395385/76‑1 AGCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAA < 1:4548720/76‑1 GCCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAAC < 1:6951968/76‑1 CCGGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACG < 1:303887/76‑1 GGGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCT < 1:4285928/76‑1 GGGATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTC < 2:1614160/76‑1 GGATATTTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCA < 1:1491225/76‑1 GATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCAC < 1:6814711/76‑1 ATAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACT < 2:5569970/76‑1 TAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTT < 2:6377121/76‑1 TAATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTT < 1:1843071/76‑1 AATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTG < 2:4969580/76‑1 AATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTG < 2:2750847/76‑1 ATTCCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATTCGGAAACGCTCCCTTGT > 1:4822179/1‑76 CCCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGGGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTC > 1:1289700/1‑76 CCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCC < 1:2869813/76‑1 CCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCCGAAACGCCCACTTTTTTtc > 2:4227777/1‑74 CCTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGGGGTAGAATACGGAAACGCTCCCTTGTTTCC > 2:7247404/1‑76 CTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCG < 1:4994080/76‑1 CTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCG < 2:2950956/76‑1 CTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGGGTCAGAATCCGGGCACCCTCTCTTGTTTTCG > 2:6895845/1‑76 CTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGGGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCG > 1:6634520/1‑76 GGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/2448427‑2448501‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCG < REL606/4485407‑4485333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |