| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 2,448,488 | IS4 (+) +14 bp | intergenic (+19/+18) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2448488 = | 5 (0.030) | 308 (1.270) | 119/148 | 0.0 | 98.1% | intergenic (+19/+31) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | 4483982 = | NA (NA) | noncoding (1426/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 2448501 | 5 (0.030) | 271 (1.110) | 112/150 | 0.1 | 97.8% | intergenic (+32/+18) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
| ? | REL606 | = 4485407 | NA (NA) | noncoding (1/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
Only 100 of 716 total aligned reads displayed.
AAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCAC > REL606/4483907‑4484057 | gcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTa > 2:5842757‑M2/75‑76 (MQ=255) gcaagggtatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTa > 2:7314903‑M2/75‑76 (MQ=255) aaaGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTa > 2:2993668/1‑76 (MQ=255) aGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAAt < 2:7732795/76‑1 (MQ=255) cTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGc > 2:7942468/1‑76 (MQ=255) cAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCca > 1:5048884/1‑76 (MQ=255) tatttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCcag > 1:7706954‑M2/68‑76 (MQ=255) atttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCcagt > 2:2430227‑M2/67‑76 (MQ=255) atttgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCcagt > 2:4886865‑M2/67‑76 (MQ=255) tATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtc > 2:6982771/1‑76 (MQ=255) aTTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCcagtca < 1:7163876/76‑1 (MQ=255) tgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCcagtcag > 2:5424405‑M2/64‑76 (MQ=255) tgattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCcagtcag > 1:3183455‑M2/64‑76 (MQ=255) gattggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCcagtcagt > 2:6764775‑M2/63‑76 (MQ=255) tggtcgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTaa > 2:799209‑M2/60‑76 (MQ=255) cGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTaa < 2:5364541/76‑1 (MQ=255) ggtcgcccccagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAg < 2:3680320‑M2/18‑1 (MQ=255) gTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAg < 2:7086919/76‑1 (MQ=255) tGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCa > 2:7255861/1‑76 (MQ=255) tGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCa < 1:5843460/76‑1 (MQ=255) tGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCa < 1:6451482/76‑1 (MQ=255) tGGCAACCAGATAATTTAACAGGGGAGTCGGAAACGAAATAGGCATCGGGGGGCTGGAAAGCCAGGCAGTGAAACa < 2:1775163/76‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCaa < 2:4211022/76‑1 (MQ=255) cgcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCaa > 1:1549016‑M2/56‑76 (MQ=255) gcccgcagccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAac > 1:2998508‑M2/55‑76 (MQ=255) aaCCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactg > 1:6958364/1‑76 (MQ=255) cAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAACAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgact < 2:3799109/76‑1 (MQ=255) agccattagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgactg > 2:5267545‑M2/49‑76 (MQ=255) aGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgactg < 2:4489785/76‑1 (MQ=255) aGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAactgactg < 1:6272412/76‑1 (MQ=255) gATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTgg < 2:1190410/76‑1 (MQ=255) aTAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGc > 1:4243606/1‑76 (MQ=255) aTAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGc < 2:1896413/76‑1 (MQ=255) tAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGct < 2:6581670/76‑1 (MQ=255) tAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGct > 1:2481716/1‑76 (MQ=255) attagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGctc < 2:5005714‑M2/32‑1 (MQ=255) aaTTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGctc > 1:2101775/1‑76 (MQ=255) ttagctgattaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGctct > 1:1610863‑M2/44‑76 (MQ=255) tttAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCtt > 2:2536127/1‑76 (MQ=255) tttAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCtt > 1:5953149/1‑76 (MQ=255) tAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCtttt > 1:5329079/1‑76 (MQ=255) aaCAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCttttt < 2:1520174/76‑1 (MQ=255) aCAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTc < 2:5941843/76‑1 (MQ=255) cAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCg < 2:7186356/76‑1 (MQ=255) attaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCgg < 1:4573561‑M2/40‑1 (MQ=255) ttaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCggg > 2:2006802‑M2/36‑76 (MQ=255) ttaacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCggg < 1:7430902‑M2/41‑1 (MQ=255) taacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCgggg > 1:8163990‑M2/35‑76 (MQ=255) taacaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCgggg > 1:5702104‑M2/35‑76 (MQ=255) gATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCt > 1:1254555/1‑76 (MQ=255) acaggcgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCt < 1:4074593‑M2/44‑1 (MQ=255) tGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCtgt < 1:3378126/76‑1 (MQ=255) cTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTgg > 2:6836684/1‑76 (MQ=255) tGAAACGACATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTggg < 2:4812977/76‑1 (MQ=255) cgtaaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTggg < 2:1313629‑M2/49‑1 (MQ=255) aaaCGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGt > 2:6893289/1‑76 (MQ=255) aaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTgtggggga > 2:2378725‑M2/25‑74 (MQ=255) aaaaaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTa < 2:6409992‑M2/52‑1 (MQ=255) gAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTAttt > 1:7567109/1‑76 (MQ=255) aaaaccggggaattatccccgTAATGCCCGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCCGTGGGGGAttt > 1:4719980‑M2/22‑76 (MQ=255) aaaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGAttt > 2:4375012‑M2/22‑76 (MQ=255) aaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTc < 2:6161553‑M2/56‑1 (MQ=255) aaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTc > 2:8068991‑M2/21‑76 (MQ=255) aaaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGCATTTc > 2:7466822‑M2/21‑76 (MQ=255) aaaTAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTc > 2:3989258/1‑76 (MQ=255) aaccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTcc < 2:2226625‑M2/57‑1 (MQ=255) aTAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCa < 2:2654293/76‑1 (MQ=255) tAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAg > 2:1870349/1‑76 (MQ=255) ccggggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAg < 1:4887424‑M2/59‑1 (MQ=255) gggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGc > 2:6047281‑M2/15‑76 (MQ=255) gggaattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGATTTCCAGGGc > 1:1011505‑M2/15‑76 (MQ=255) gCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGc < 1:1829874/76‑1 (MQ=255) aTCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCct < 2:4674502/76‑1 (MQ=255) aTCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCct > 1:3296058/1‑76 (MQ=255) aTCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCct > 1:7862358/1‑76 (MQ=255) aattatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCctc < 2:6325959‑M2/65‑1 (MQ=255) cTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCctct < 1:6673878/76‑1 (MQ=255) attatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCctct > 2:849731‑M2/11‑76 (MQ=255) tatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTcc > 2:3412907‑M2/9‑76 (MQ=255) tatccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGATTTTCCGGGCCCCTcc > 1:3073456‑M2/9‑76 (MQ=255) atccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCt > 2:3921495‑M2/8‑76 (MQ=255) atccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCt > 2:1674851‑M2/8‑76 (MQ=255) tccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCtt > 2:5125760‑M2/7‑76 (MQ=255) ttCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt > 2:5601943/1‑76 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt > 2:1070298‑M2/6‑76 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt > 2:8114611‑M2/6‑76 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt < 1:2264028‑M2/71‑1 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt < 2:758706‑M2/71‑1 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt > 1:3762659‑M2/6‑76 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCttt > 2:3280613‑M2/6‑76 (MQ=255) ccccgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGGATTTCCAGGGCCTCTCCttt > 2:2902052‑M2/6‑76 (MQ=255) tGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAcc > 2:5753216/1‑76 (MQ=255) tGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAcc > 2:2714379/1‑76 (MQ=255) tGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAcc > 2:7837977/1‑76 (MQ=255) tGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAcc < 1:1452113/76‑1 (MQ=255) cgTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTAcc > 1:2673075‑M2/3‑76 (MQ=255) gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCa < 1:8015709‑M2/75‑1 (MQ=255) gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCa > 2:1461538‑M2/2‑76 (MQ=255) gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCa > 2:3149989‑M2/2‑76 (MQ=255) gTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCa < 1:1200877‑M2/75‑1 (MQ=255) | AAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCAC > REL606/4483907‑4484057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |