| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 433,624 | Δ2 bp :: IS186 (–) +8 bp | coding (119‑126/273 nt) | hupB → | HU, DNA‑binding transcriptional regulator, beta subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 429504 = | NA (NA) | 60 (1.050) | 48/150 | 0.1 | 100% | noncoding (1341/1343 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | REL606 | = 433631 | 0 (0.000) | coding (126/273 nt) | hupB | HU, DNA‑binding transcriptional regulator, beta subunit | |||||
| * | ? | REL606 | = 430844 | NA (NA) | 66 (1.200) | 46/144 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | REL606 | 433624 = | 0 (0.000) | coding (119/273 nt) | hupB | HU, DNA‑binding transcriptional regulator, beta subunit | |||||
ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/430770‑430844‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAACCCG > REL606/433624‑433694 ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA > 1:1030201/1‑76ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGA > 1:1336163/1‑76 TCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT < 2:823312/76‑1 TCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT < 2:128512/76‑1 TCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAT < 1:1251191/76‑1 GTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGA < 2:1265776/76‑1 GTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGA > 1:1665041/1‑76 GAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATG > 1:648262/1‑76 GAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTA < 1:1719802/76‑1 AATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCAC > 1:496287/1‑76 AATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCAC < 1:1621752/76‑1 TCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGG > 1:151030/1‑76 CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGT < 1:1155338/76‑1 CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGT < 1:369132/76‑1 CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGT < 1:775103/76‑1 CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGT > 1:1383816/1‑76 CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGT < 2:707352/76‑1 ATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTA < 1:879333/76‑1 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTT < 1:75407/76‑1 CACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTGGCACTGGTAGGTTT > 2:1079282/1‑76 GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGG > 2:217713/1‑76 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGT > 1:1550222/1‑76 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGT > 1:489217/1‑76 AAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTAC > 1:508350/1‑76 ATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTT < 1:430262/76‑1 CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTT > 2:300178/1‑76 CATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTT < 1:1805910/76‑1 ATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTG > 2:733184/1‑76 ATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTG > 2:1308948/1‑76 ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCC > 1:1044564/1‑76 AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTT < 2:520154/76‑1 AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTT > 1:877384/1‑76 AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTT < 2:1550222/76‑1 GGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTA < 1:1753867/76‑1 GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAA < 1:499872/76‑1 CGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAA < 1:316077/76‑1 CGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAA < 2:1027412/76‑1 TAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGA < 1:1175543/76‑1 AATACCACAGCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAG < 1:712730/76‑1 AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAG > 2:1661337/1‑76 ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGT > 2:143287/1‑76 ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGT > 1:1047583/1‑76 ACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGT < 1:1702114/76‑1 CAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTG < 1:1490800/76‑1 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGC > 1:1575382/1‑76 AACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGC < 1:1331668/76‑1 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCC > 2:956548/1‑76 ACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCC > 2:563456/1‑76 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCC > 2:1169264/1‑76 CCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCC < 1:1644154/76‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCG > 1:571695/1‑76 AAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACT < 2:620995/76‑1 AAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACT < 1:1195388/76‑1 AAGTTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACT < 2:772361/76‑1 AAGTGAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACT < 2:772378/76‑1 TTAGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGC > 1:1353843/1‑76 AGCGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCG < 2:1393066/76‑1 CGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCA > 2:233853/1‑76 CGCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCA > 2:49296/1‑76 GCTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAA < 1:1252580/76‑1 CTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAAC > 1:800886/1‑76 CTTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAAC < 2:1788484/76‑1 TTATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAACC > 2:289487/1‑76 ATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAACCCG > 2:1144070/1‑76 ATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAACCCG > 1:1776866/1‑76 ATGGGATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAACCCG > 1:1735990/1‑76 ATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/430770‑430844‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggATGATGTAGCACTGGTAGGTTTTGGTACTTTTGCCGTTAAAGAGCGTGCTGCCCGTACTGGCCGCAACCCG > REL606/433624‑433694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |