| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1519141 = | 66 (1.020) | 5 (0.080) | 4/138 | 7.6 | 6.9% | coding (725/957 nt) | yddK | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 1519345 = | 74 (1.240) | coding (521/957 nt) | yddK | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAAGA > REL606/1519067‑1519216 | cagcGTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAg < 2:21935/76‑1 (MQ=255) cGTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTaa < 2:702257/76‑1 (MQ=255) cGTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTaa > 1:810300/1‑76 (MQ=255) gTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAAc > 2:302993/1‑76 (MQ=255) gTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAAc > 2:292102/1‑76 (MQ=255) ttAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGt > 2:2006614/1‑76 (MQ=255) tGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTc < 1:467037/76‑1 (MQ=255) gTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCa > 1:556821/1‑76 (MQ=255) gTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCa < 1:249918/76‑1 (MQ=255) gTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCa < 1:249902/76‑1 (MQ=255) aaCATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTg < 2:1545128/76‑1 (MQ=255) aaCATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTg < 2:1932206/76‑1 (MQ=255) aaCATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTg > 2:550870/1‑76 (MQ=255) cATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTggg < 2:653926/76‑1 (MQ=255) cATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTggg > 1:489921/1‑76 (MQ=255) cATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTggg > 1:489935/1‑76 (MQ=255) ttGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGaa < 2:1875700/76‑1 (MQ=255) ttGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGaa < 2:1274152/76‑1 (MQ=255) gCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAAt < 1:860441/76‑1 (MQ=255) gCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAAt > 2:541625/1‑76 (MQ=255) cAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATa > 1:1036753/1‑76 (MQ=255) aGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTc < 1:229457/76‑1 (MQ=255) cTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATtgt > 1:198140/1‑76 (MQ=255) tataGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATtgtg < 2:2087713/76‑1 (MQ=255) ataGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTgtgt > 2:1721511/1‑76 (MQ=255) taGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTa > 1:424406/1‑76 (MQ=255) taGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTa > 2:1962330/1‑76 (MQ=255) aGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAGATAAGTCATTGTGTaa < 2:1158867/76‑1 (MQ=255) atatTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACt > 1:553023/1‑76 (MQ=255) tatTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACtt > 2:2089577/1‑76 (MQ=255) tatTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACtt > 1:1197352/1‑76 (MQ=255) atTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTg > 1:700813/1‑76 (MQ=255) tttAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGtt > 2:1606402/1‑76 (MQ=255) ttAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTa < 2:1090211/76‑1 (MQ=255) ttAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTa < 2:2020738/76‑1 (MQ=255) ttAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTa > 2:1771462/1‑76 (MQ=255) ttAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTa < 2:665478/76‑1 (MQ=255) tAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAg > 2:239026/1‑76 (MQ=255) aaTTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGt > 1:1428846/1‑76 (MQ=255) aTTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGtt > 2:1399370/1‑76 (MQ=255) ttCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTtta < 2:1018129/76‑1 (MQ=255) aGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTttatta > 2:49041/1‑76 (MQ=255) cAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGAt > 2:1557762/1‑76 (MQ=255) aaaTTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATa > 2:1674818/1‑76 (MQ=255) aaaTTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATa < 2:1957140/76‑1 (MQ=255) tgttgtTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATc > 1:1434449/1‑76 (MQ=255) tgttgtTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATc > 1:1434464/1‑76 (MQ=255) tgttgtTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATc > 1:1448990/1‑76 (MQ=255) gttgttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATcc < 1:197672/76‑1 (MQ=255) gttgttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATcc < 2:1216682/76‑1 (MQ=255) ttgttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCca > 1:659317/1‑76 (MQ=255) ttgttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCca > 1:659319/1‑76 (MQ=255) ttttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTGGTTTATTATGGGATAGATCcag < 1:773199/74‑1 (MQ=255) tgttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCcag < 2:1594754/76‑1 (MQ=255) tgttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCcag > 1:176867/1‑76 (MQ=255) gttAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCcagc < 1:5688/76‑1 (MQ=255) taataaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCcagcag > 2:327631/1‑76 (MQ=255) aataaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATGAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGt < 2:1741844/76‑1 (MQ=255) aataaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGt > 1:1519407/1‑76 (MQ=255) ataaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTa < 1:2044746/76‑1 (MQ=255) taaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTaa < 2:1147259/76‑1 (MQ=255) taaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTaa > 2:1524129/1‑76 (MQ=255) aaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAag < 1:1000246/76‑1 (MQ=255) aaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAag > 2:420158/1‑76 (MQ=255) aaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAag > 2:1767890/1‑76 (MQ=255) aaGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAag > 1:539171/1‑76 (MQ=255) aGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAaga > 1:1319996/1‑76 (MQ=255) aGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAaga > 2:20464/1‑76 (MQ=255) | CAGCGTTTAATGTCTGAACATTGCAGAAGTTGCTATAGAATATTTTAATTTCAGAAAGCAAATTGTTGTTAATAAGTAACGTATTCAAGTTGGGAAATAAGTCATTGTGTAAACTTGTTAGTTTATTATGGGATAGATCCAGCAGTAAGA > REL606/1519067‑1519216 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |