New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3201814 = | 66 (1.120) | 21 (0.380) | 11/142 | 3.9 | 18.6% | coding (366/1104 nt) | yhaC | hypothetical protein |
? | REL606 | 3202251 = | 121 (2.180) | coding (803/1104 nt) | yhaC | hypothetical protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCCAGTCCCACAACTAAAAATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/3201892‑3201814 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gataAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTAAAT > REL606/3202251‑3202325 TCCAGTCCCACAACTAAAAATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTG < 2:1329696/76‑1 CAGTCCCACAACTAAAAATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGAT < 1:900676/76‑1 ACAACTAAAAATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAG < 2:1302756/76‑1 ACAACTAAAAATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAG < 2:1302748/76‑1 AATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAAT < 2:1471308/76‑1 TTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAA < 2:978919/76‑1 CCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAA < 2:709946/76‑1 TCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATA < 2:1672279/76‑1 TCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATA < 2:1672299/76‑1 CTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATA < 2:1162527/76‑1 CTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATA < 2:1162534/76‑1 TGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATAT < 2:574360/76‑1 TGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATAT < 2:574372/76‑1 TGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATAT < 2:574371/76‑1 TTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAA < 2:1312355/76‑1 TTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAA < 2:1312376/76‑1 TTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAA < 2:72063/76‑1 TTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAA < 2:72042/76‑1 TTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAA < 2:48746/76‑1 TTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATAAAAAA < 2:605065/76‑1 TCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATAAAAAAG < 2:1041066/76‑1 CATTGTATATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAA‑AAAAAAAAGAAATATATAAAAGCT < 2:431559/76‑1 CATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATAAATTAGAAAATGAA‑AAAAAAAAGAAATATATAAAAGCT < 2:431537/76‑1 GATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTA > 2:1756285/1‑76 GATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTA > 1:1736179/1‑76 GATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTA > 1:181493/1‑76 GATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTA > 1:181508/1‑76 ATAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTAA < 1:621361/76‑1 TAAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTAAA > 2:363710/1‑76 AAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTAAAT < 1:295443/76‑1 AAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTAAAT < 1:114294/76‑1 TCCAGTCCCACAACTAAAAATTACGTTTAACCTCCTGATTTCATTGTAAATATCTTTTAATGGGCAATTAATATTGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/3201892‑3201814 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gataAATTAGAAAATGAATTAACAAAAGAAATATATAAAAGCTCATCGAAAATCAACAATTGCTTGAACAGAATTAAAT > REL606/3202251‑3202325 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |