| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3201814 = | 66 (1.120) | 21 (0.380) | 11/142 | 3.9 | 18.6% | coding (366/1104 nt) | yhaC | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3202251 = | 121 (2.180) | coding (803/1104 nt) | yhaC | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGG > REL606/3201740‑3201886 | attCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAata < 2:1402569/76‑1 (MQ=255)attCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAata > 2:554020/1‑76 (MQ=255) ttCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAatat < 1:399851/76‑1 (MQ=255) aaCGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCaa > 2:1436607/1‑76 (MQ=255) aaCGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCaa > 2:1440881/1‑76 (MQ=255) aaCGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGCAATATCaa > 2:1440872/1‑76 (MQ=255) aCGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAat < 1:391775/76‑1 (MQ=255) cGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAata > 2:1202311/1‑76 (MQ=255) cGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAata > 2:431831/1‑76 (MQ=255) tCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTa > 2:659875/1‑76 (MQ=255) tCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTa < 1:981364/76‑1 (MQ=255) tCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTa < 1:981343/76‑1 (MQ=255) ggACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAAt > 2:1496528/1‑76 (MQ=255) gACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAAtt < 2:1773829/76‑1 (MQ=255) aCAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTg < 2:1053398/76‑1 (MQ=255) cAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGc < 1:439739/76‑1 (MQ=255) aaTACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGcc > 2:77140/1‑76 (MQ=255) aTACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGccc > 1:903250/1‑76 (MQ=255) aCTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCAt < 1:1415388/76‑1 (MQ=255) aCTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCAt < 1:1415382/76‑1 (MQ=255) tgtgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTaa > 2:1133704/1‑76 (MQ=255) tgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTaaaa < 1:37606/76‑1 (MQ=255) tgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTaaaa < 1:175315/76‑1 (MQ=255) tgAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTaaaa < 1:814295/76‑1 (MQ=255) gAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAg > 1:1694450/1‑76 (MQ=255) aaCTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGa > 1:559363/1‑76 (MQ=255) aCTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGat < 1:1082192/76‑1 (MQ=255) ttACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGatat > 1:1813194/1‑76 (MQ=255) tACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATAtt < 2:1018153/76‑1 (MQ=255) aCCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATAttt < 1:1875657/76‑1 (MQ=255) ccATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTa > 1:1227287/1‑76 (MQ=255) ttAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACaa < 1:1158320/76‑1 (MQ=255) ttAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACaa < 1:83840/76‑1 (MQ=255) tAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTACTTGCCCATTAAAAGATATTTACAAt > 2:1326898/1‑76 (MQ=255) aaTGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATg > 2:638928/1‑76 (MQ=255) aaTGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATg > 2:1175313/1‑76 (MQ=255) aTGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGa < 1:25353/76‑1 (MQ=255) tGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGaa < 2:1819310/76‑1 (MQ=255) tGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGaa < 2:1671791/76‑1 (MQ=255) gAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGaaa > 2:231318/1‑76 (MQ=255) aaCCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAAt > 1:1523086/1‑76 (MQ=255) aCCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATc < 2:587672/76‑1 (MQ=255) cGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCag > 1:892669/1‑76 (MQ=255) gTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCagg < 1:546511/76‑1 (MQ=255) ttAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCagga < 2:1048241/76‑1 (MQ=255) ttAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCagga > 2:1854275/1‑76 (MQ=255) tAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCaggag > 2:1467893/1‑76 (MQ=255) aaaaaaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCaggagg < 1:816119/76‑1 (MQ=255) aaaaaaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCaggagg < 1:816132/76‑1 (MQ=255) aaCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTaa > 1:28203/1‑76 (MQ=255) aCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTaaa > 1:6249/1‑76 (MQ=255) aCCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTaaa < 1:175404/76‑1 (MQ=255) ccAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAAc > 2:1541010/1‑76 (MQ=255) aGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGt < 1:77262/76‑1 (MQ=255) gAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTaa > 1:20283/1‑76 (MQ=255) gAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTaa < 1:1560056/76‑1 (MQ=255) gaaTATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACATAAt < 2:1746637/75‑1 (MQ=255) aaTATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAtt > 2:160800/1‑76 (MQ=255) atatCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttt < 1:1183198/76‑1 (MQ=255) atatCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttt > 2:1823822/1‑76 (MQ=255) atCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAAttttt > 1:281499/1‑76 (MQ=255) ccACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAg > 1:576195/1‑76 (MQ=255) acaGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAA‑TTTTAGTtg < 1:1808415/76‑1 (MQ=255) caGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTtg > 1:819453/1‑76 (MQ=255) ggTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTtgtg > 2:1841396/1‑76 (MQ=255) tAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTggg < 1:1864185/76‑1 (MQ=255) | ATTCAACGATCGGACAATACTTGTGAACTTACCATTAATGAACCGTTAAAAAACCAGGAAATATCCACAGGTAATATCAATATTAATTGCCCATTAAAAGATATTTACAATGAAATCAGGAGGTTAAACGTAATTTTTAGTTGTGGG > REL606/3201740‑3201886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |