| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 4097350 = | 24 (0.490) | 59 (1.280) | 44/142 | 0.1 | 73.9% | coding (223/846 nt) | glpF | glycerol facilitator |
| ? | REL606 | = 4097374 | 19 (0.410) | coding (199/846 nt) | glpF | glycerol facilitator | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AAACGATAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTCCCA > REL606/4097299‑4097449 | cttgtcgaaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAg < 2:343460‑M1/25‑1 (MQ=255) aCGATAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGat < 2:1327145‑M2/76‑3 (MQ=255) aCGATAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGat > 2:170852‑M2/1‑74 (MQ=255) tcgaaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATgc < 1:1094156‑M1/29‑1 (MQ=255) cgaaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATgcg < 1:373887‑M1/30‑1 (MQ=255) aTAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgca < 2:1472146‑M2/76‑6 (MQ=255) aTAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgca > 1:127833‑M2/1‑71 (MQ=255) aTAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgca > 1:876218‑M2/1‑71 (MQ=255) aaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATgcgcg > 2:1445196‑M1/45‑76 (MQ=255) aaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATgcgcg < 2:982175‑M1/32‑1 (MQ=255) aaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATgcgcg < 2:216568‑M1/32‑1 (MQ=255) aaacaggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATgcgcg < 2:1281688‑M1/32‑1 (MQ=255) aGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggt > 1:628439‑M2/1‑66 (MQ=255) aGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggt < 2:1104399‑M2/76‑11 (MQ=255) ggAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggta > 2:541374‑M2/1‑65 (MQ=255) aggcaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCgg < 1:927943‑M1/36‑1 (MQ=255) gAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaa > 1:211729‑M2/1‑64 (MQ=255) gAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaa < 1:1539730‑M2/76‑13 (MQ=255) caaacagccacaatgcaatggtaatagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGaaa > 1:290682‑M1/38‑76 (MQ=255) caaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGTGCCGGaaa > 1:628461‑M1/38‑76 (MQ=255) caaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGaaa < 2:197091‑M1/39‑1 (MQ=255) aaaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGaaa > 1:792890‑M1/38‑76 (MQ=255) aTAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaaca > 2:1548193‑M2/1‑62 (MQ=255) aaacagccacaatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATAGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAAc < 2:1222524‑M1/40‑1 (MQ=255) ttGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcggga < 1:344340‑M2/76‑21 (MQ=255) gcgcTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggatt > 2:939838‑M2/1‑54 (MQ=255) gcgcTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggatt < 1:532723‑M2/76‑23 (MQ=255) cgcTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggatta > 1:1496774‑M2/1‑53 (MQ=255) gcTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaa > 2:984291‑M2/1‑52 (MQ=255) cTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaag < 2:343460‑M2/76‑26 (MQ=255) aatgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTc > 2:891107‑M1/27‑76 (MQ=255) atgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCa < 2:1413279‑M1/51‑1 (MQ=255) atgcaatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCAGAAACCCCTGCGGTCa > 1:1123727‑M1/26‑76 (MQ=255) tGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCCGCCAg > 1:1133302/1‑76 (MQ=255) caatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGt > 2:822166‑M1/23‑76 (MQ=255) cGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcg < 1:373887‑M2/76‑31 (MQ=255) aatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTa > 1:1087507‑M1/22‑76 (MQ=255) aatggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTa > 2:636262‑M1/22‑76 (MQ=255) aaaCAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcg < 2:982175‑M2/76‑33 (MQ=255) aaaCAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcg > 2:1445196‑M2/1‑44 (MQ=255) aaaCAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcg < 2:216568‑M2/76‑33 (MQ=255) aaaCAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcg < 2:1281688‑M2/76‑33 (MQ=255) ggtaacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAgag < 1:617849‑M1/58‑2 (MQ=255) cAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccg < 2:673154‑M2/76‑36 (MQ=255) aacagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGc < 2:874313‑M1/61‑1 (MQ=255) aGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccgg < 1:927943‑M2/76‑37 (MQ=255) acagcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGcc > 2:980807‑M1/15‑76 (MQ=255) gCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaa > 2:379467‑M2/1‑38 (MQ=255) cAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgtgccggaaa > 1:628461‑M2/1‑37 (MQ=255) cAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaa > 2:573455‑M2/1‑37 (MQ=255) cAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaa < 2:197091‑M2/76‑40 (MQ=255) aaaacAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaa > 1:792890‑M2/2‑37 (MQ=255) gcgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAACCCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCAtt > 2:996624‑M1/12‑76 (MQ=255) aaaCAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatagtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaac < 2:1222524‑M2/76‑41 (MQ=255) cgggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTg < 2:296119‑M1/66‑1 (MQ=255) gggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCGTTg > 1:1141641‑M1/10‑75 (MQ=255) gggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCGTTg < 2:1141641‑M1/66‑1 (MQ=255) gggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTg < 2:1216791‑M1/66‑1 (MQ=255) gggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTg > 1:1216791‑M1/10‑75 (MQ=255) ggattaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGcc < 1:579719‑M1/68‑1 (MQ=255) ttaagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAcc > 1:1046699‑M1/6‑76 (MQ=255) taagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAccc < 1:1318386‑M1/72‑1 (MQ=255) aagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAcccc < 2:1275265‑M1/73‑1 (MQ=255) aagATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAcccc < 2:298920‑M1/73‑1 (MQ=255) agATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAccccc > 1:174476‑M1/3‑76 (MQ=255) agATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAccccc > 2:1183121‑M1/3‑76 (MQ=255) agATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAccccc > 2:928290‑M1/3‑76 (MQ=255) agATGCAATGGGAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCAccccc < 1:1429932‑M1/74‑1 (MQ=255) atgcaatgGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccagaaacccctgcggtca > 1:1123727‑M2/1‑25 (MQ=255) aatgGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggta > 2:636262‑M2/1‑21 (MQ=255) aatgGTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggta > 1:1087507‑M2/1‑21 (MQ=255) gTAACAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatg > 2:199624‑M2/1‑17 (MQ=255) aaCAGCGGGATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggc < 2:874313‑M2/76‑62 (MQ=255) aCAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGa < 1:790964/76‑1 (MQ=255) cagcagGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGac < 2:1479408/76‑1 (MQ=255) gggATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccgttg < 2:1141641‑M2/75‑67 (MQ=255) gggATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattg > 1:1216791‑M2/1‑9 (MQ=255) gggATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattg < 2:1216791‑M2/75‑67 (MQ=255) gggATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTg < 2:837187/76‑1 (MQ=255) ggATTAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgcc < 1:579719‑M2/76‑69 (MQ=255) ggATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGa > 2:437655/1‑76 (MQ=255) gATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGan < 1:1460230/76‑2 (MQ=255) gATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGAt < 1:244544/76‑1 (MQ=255) ttAAGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgccacc > 1:1046699‑M2/1‑5 (MQ=255) ttAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGAttt < 2:57210/76‑1 (MQ=255) tAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTc > 1:766413/1‑76 (MQ=255) tAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTc < 1:911187/76‑1 (MQ=255) tAAGATACGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTc > 1:1324596/1‑76 (MQ=255) aaGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgccacccc < 1:1470274‑M2/76‑74 (MQ=255) aaGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgccacccc < 2:298920‑M2/76‑74 (MQ=255) aaGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGCTTTcc > 2:595156/1‑76 (MQ=255) aaGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTcc > 1:342658/1‑76 (MQ=255) aGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgccaccccc > 2:928290‑M2/1‑2 (MQ=255) aGatgcaatggtaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgccaccccc > 1:884963‑M2/1‑2 (MQ=255) aGatgcaatgggaacagcgggattaagatgcgcgccggaaacccctgcggtcaggtagatggccattgccaccccc < 1:1429932‑M2/76‑75 (MQ=255) aGATGCGCGCCGGAAGCCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTccc < 2:709647/76‑1 (MQ=255) aGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCTGTCCCCAAATGACACTGATTTccc < 1:281298/76‑1 (MQ=255) aGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTccc < 2:709638/76‑1 (MQ=255) aGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTccc < 2:56134/76‑1 (MQ=255) gATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTCCCa < 1:324609/76‑1 (MQ=255) | AAACGATAAAAGGAATAACTTTGCGCTTGTCGAAACAGGCAAACAGCCACAATGCAATGGTAACAGCGGGATTAAGATGCGCGCCGGAAACCCCTGCGGTCAGGTAGATGGCCATTGCCACCCCCAGTCCCCAAATGACACTGATTTCCCA > REL606/4097299‑4097449 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |