| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3739626 | 80 (1.290) | 11 (0.190) | 6/140 | 6.0 | 13.1% | coding (340/1026 nt) | waaW | UDP‑galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2‑galactosyltransferase |
| ? | REL606 | = 3739937 | 71 (1.230) | coding (29/1026 nt) | waaW | UDP‑galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2‑galactosyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAAAAGTTACGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTAATTTT > REL606/3739862‑3740012 | aaaaaGTTACGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGAttt > 1:739287/1‑76 (MQ=255) aaaaGTTACGGTGAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGTTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTc < 2:1617464/76‑1 (MQ=255) gTTACGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCaacg < 2:1108679/76‑4 (MQ=255) ttACGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTat < 2:1016755/76‑2 (MQ=255) ttACGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTaa < 2:74535/76‑1 (MQ=255) aCGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATa < 2:215805/76‑1 (MQ=255) aCGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATa < 2:152183/76‑1 (MQ=255) aCGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATa < 1:1527932/76‑1 (MQ=255) ggTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATAct > 1:1730113/1‑76 (MQ=255) tCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATActct < 2:1936604/76‑1 (MQ=255) tCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATActct > 1:163572/1‑76 (MQ=255) tCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATActct < 1:76745/76‑1 (MQ=255) cAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACtctc < 2:1586707/76‑1 (MQ=255) aCCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCt > 2:975012/1‑76 (MQ=255) aCCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCt > 2:1988134/1‑76 (MQ=255) ccGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCta < 2:94702/76‑1 (MQ=255) ccGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCta < 1:1402973/76‑1 (MQ=255) ccGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCta < 2:1635206/76‑1 (MQ=255) cGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaa < 2:1993514/76‑1 (MQ=255) gTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaat < 2:1217957/76‑1 (MQ=255) gTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaat < 1:1328349/76‑1 (MQ=255) tAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaata < 1:245849/76‑1 (MQ=255) tAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaata < 1:1137236/76‑1 (MQ=255) tAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaata > 2:199795/1‑76 (MQ=255) tAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaata < 1:1667234/76‑1 (MQ=255) aaGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaataa < 1:622362/76‑1 (MQ=255) aaGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaataa < 2:506625/76‑1 (MQ=255) aaGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCtaataa > 2:1985060/1‑76 (MQ=255) aGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATaaa < 2:1372077/76‑1 (MQ=255) aGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATaaa < 1:821387/76‑1 (MQ=255) atatTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCa > 1:1206204/1‑76 (MQ=255) tatTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCAt > 2:374286/1‑76 (MQ=255) atTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATg < 1:291264/76‑1 (MQ=255) atTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATg > 2:1399444/1‑76 (MQ=255) aaCACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTgg > 2:1028752/1‑76 (MQ=255) cacacGTTCGGTGGTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGtt < 2:1826452/76‑1 (MQ=255) acacGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTc < 1:744495/76‑1 (MQ=255) acGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCg > 2:1548006/1‑76 (MQ=255) aTCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGttt > 2:1508575/1‑76 (MQ=255) aTCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGttt > 2:1508561/1‑76 (MQ=255) aTCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGttt < 2:1439521/76‑1 (MQ=255) aTCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGttt > 1:1904649/1‑76 (MQ=255) aTCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGttt < 2:1004242/76‑1 (MQ=255) cGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTg < 1:1151753/76‑1 (MQ=255) ggTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGa > 1:1042495/1‑76 (MQ=255) gtTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACtg > 2:1842467/1‑76 (MQ=255) gtTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACtg > 2:151898/1‑76 (MQ=255) gCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACtgtgtg < 2:1288232/76‑1 (MQ=255) cAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTgg > 2:1028091/1‑76 (MQ=255) tttCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGttt > 2:1236876/1‑76 (MQ=255) tCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTAc < 2:1893771/76‑1 (MQ=255) tCCACAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGGTTTGACTGTGTGGTTTAc < 1:1495292/76‑1 (MQ=255) ccccAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACg > 1:1153161/1‑76 (MQ=255) cAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCtt > 1:363861/1‑76 (MQ=255) agagACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCttt < 1:1885145/76‑1 (MQ=255) agagACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCttt < 2:1093221/76‑1 (MQ=255) agagACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCttt < 1:90271/76‑1 (MQ=255) gcgaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCTATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCCTTg < 1:937760/74‑1 (MQ=255) gagaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTg < 1:937781/76‑1 (MQ=255) gagaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTg < 2:1300034/76‑1 (MQ=255) gagaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTg < 1:1356617/76‑1 (MQ=255) agaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGc < 1:1673096/76‑1 (MQ=255) agaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGc < 1:1821557/76‑1 (MQ=255) agaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGc > 2:1361586/1‑76 (MQ=255) gaCAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGcc > 2:546536/1‑76 (MQ=255) cAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCtt < 2:1088416/76‑1 (MQ=255) cAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCtt > 2:279584/1‑76 (MQ=255) cAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCAAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCtt < 2:1101628/76‑1 (MQ=255) aGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCttt < 2:1577578/76‑1 (MQ=255) cGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTa < 1:66604/76‑1 (MQ=255) gATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTaa < 2:1458548/76‑1 (MQ=255) gATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTaa < 2:1458532/76‑1 (MQ=255) aTTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTAAt > 2:190646/1‑76 (MQ=255) aTTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTAAt < 2:668599/76‑1 (MQ=255) tCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTAAtttt > 1:737383/1‑76 (MQ=255) | AAAAAGTTACGGTCAATACCGTAAGCGATATTTAACACACGATCGGTGTTAGCAATTTCCCCAGAGACAGCGATTTCAGTAATACTCTCAGCTAATAAATCCATGTTGGTTCCGTTTTGACTGTGTGGTTTACGCTTTGCCTTTTAATTTT > REL606/3739862‑3740012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |