| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 4459858 = | 179 (2.860) | 3 (0.050) | 3/140 | 6.8 | 1.9% | coding (1145/1653 nt) | yjgL | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 4460139 = | 142 (2.430) | coding (1426/1653 nt) | yjgL | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AAGTGGTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAGATGG > REL606/4460064‑4460214 | aaGTGCTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATg < 2:1970290/76‑1 (MQ=255) gTGGTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGt > 2:1682861/1‑76 (MQ=255) tGGTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTa < 1:727687/76‑1 (MQ=255) ggTACTTCTATCAATTACTTAAGAATTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTaa > 1:299011/1‑76 (MQ=255) gTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAAt > 1:185620/1‑76 (MQ=255) gTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAAt < 2:399689/76‑1 (MQ=255) tACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATg > 2:1218825/1‑76 (MQ=255) aCTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATga < 1:1027253/76‑1 (MQ=255) aCTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATga < 2:630867/76‑1 (MQ=255) cTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATgaa < 1:1206100/76‑1 (MQ=255) tCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATgaaga > 1:464424/1‑76 (MQ=255) tCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATgaaga < 1:760626/76‑1 (MQ=255) tCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATgaaga > 2:215585/1‑76 (MQ=255) cTATCGATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATgaagaa < 2:1984521/76‑1 (MQ=255) cTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATgaagaa < 1:1823746/76‑1 (MQ=255) tATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaa > 1:358730/1‑76 (MQ=255) aTCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaa < 2:1055943/76‑1 (MQ=255) aTCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaa > 1:1308978/1‑76 (MQ=255) aTCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaa > 1:1031869/1‑76 (MQ=255) aTCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaa > 1:1298513/1‑76 (MQ=255) tcgaTTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaaa > 1:861362/4‑76 (MQ=255) tCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaaa < 2:278591/76‑1 (MQ=255) tCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaaa < 2:462188/76‑1 (MQ=255) cAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGaaaaaa < 2:547166/76‑1 (MQ=255) tACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACaaa < 2:699504/76‑1 (MQ=255) cTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATg < 1:26206/76‑1 (MQ=255) cTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATg > 2:1248024/1‑76 (MQ=255) cTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATg > 2:1248010/1‑76 (MQ=255) cTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATg > 2:1154683/1‑76 (MQ=255) cTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATg < 2:277744/76‑1 (MQ=255) ttAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGa < 2:343699/76‑1 (MQ=255) ttAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGa > 1:1859151/1‑76 (MQ=255) ttAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGa < 1:1553938/76‑1 (MQ=255) tAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGaa < 2:359784/76‑1 (MQ=255) aagaagTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGaaa > 2:1734707/1‑76 (MQ=255) aagaagTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGaaa < 1:583097/76‑1 (MQ=255) aagaagTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGaaa > 1:1089388/1‑76 (MQ=255) aagaagTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGaaa > 1:532103/1‑76 (MQ=255) agaagTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAAt < 1:118712/76‑1 (MQ=255) aagTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTg > 1:1437236/1‑76 (MQ=255) gTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTa < 1:244108/76‑1 (MQ=255) gTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTa > 1:1188048/1‑76 (MQ=255) gTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTa < 1:158724/76‑1 (MQ=255) tATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaa < 1:629410/76‑1 (MQ=255) aTGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaa < 1:1791800/76‑1 (MQ=255) aTGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaa < 2:692232/76‑1 (MQ=255) aTGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaa > 2:1099182/1‑76 (MQ=255) aTGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaa < 2:1161237/76‑1 (MQ=255) tGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaaa < 2:996876/76‑1 (MQ=255) aGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaaaaa < 1:1434157/76‑1 (MQ=255) ggCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAAc < 1:322470/76‑1 (MQ=255) gCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaaataagg < 2:315341/76‑3 (MQ=255) gCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTaaaataagg < 2:315340/76‑3 (MQ=255) cGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACAt < 1:1529677/76‑1 (MQ=255) cGAACAGCTGTATCTTAAGGAGTTAGGATATGTTTATGGTAAGGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACAt < 1:1330721/76‑1 (MQ=255) gAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATc > 2:1683566/1‑76 (MQ=255) cTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGtt > 1:989973/1‑76 (MQ=255) tGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTa > 1:882555/1‑76 (MQ=255) tGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTa > 2:399444/1‑76 (MQ=255) tGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTa > 2:10060/1‑76 (MQ=255) gTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTAt > 1:425687/1‑76 (MQ=255) cTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCg > 2:597590/1‑76 (MQ=255) cTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCg > 1:1494636/1‑76 (MQ=255) tAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGtt > 1:216062/1‑76 (MQ=255) tAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGtt > 1:373706/1‑76 (MQ=255) aaTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTg > 1:918736/1‑76 (MQ=255) aaTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTg < 1:551843/76‑1 (MQ=255) aaTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTg > 1:328871/1‑76 (MQ=255) aTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAATAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTga > 1:1536972/1‑76 (MQ=255) aTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGttca < 1:1011196/76‑3 (MQ=255) aTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTga < 1:1011200/76‑1 (MQ=255) aTGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTga > 1:1536994/1‑76 (MQ=255) tGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTgag < 2:112119/76‑1 (MQ=255) tGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTgag < 2:948235/76‑1 (MQ=255) gTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGAtt < 2:1453851/76‑1 (MQ=255) ttAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGAttt < 2:1703609/76‑1 (MQ=255) tAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGAtttt > 1:933519/1‑76 (MQ=255) aGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGAttttt > 2:855060/1‑76 (MQ=255) aGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGAttttt > 2:1024770/1‑76 (MQ=255) ggATATGTTTCTGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTg < 2:1391022/76‑1 (MQ=255) ggATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTg > 2:1504707/1‑76 (MQ=255) gATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTga < 1:967007/76‑1 (MQ=255) gATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTga < 1:1316821/76‑1 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGCGATTTTTgaa > 2:1372079/1‑76 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaa > 2:1486529/1‑76 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaa > 1:3647/1‑76 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaa > 2:93429/1‑76 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaa < 1:1865713/76‑1 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaa < 1:1244792/76‑1 (MQ=255) atatGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaa > 2:637565/1‑76 (MQ=255) gTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGaaa > 1:1368199/1‑76 (MQ=255) tttATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGaaan < 1:291831/76‑2 (MQ=255) ttATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGGAGAAAAg < 1:1243911/76‑1 (MQ=255) ttATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAg < 1:1659547/76‑1 (MQ=255) tATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAGa > 1:1504360/1‑76 (MQ=255) aTGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaaga > 2:860029/1‑70 (MQ=255) aTGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTgaaga < 1:860029/70‑1 (MQ=255) aTGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAGAt < 2:1000968/76‑1 (MQ=255) tGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAGATg < 1:1967416/76‑1 (MQ=255) ggTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAGATgg < 1:1693658/76‑1 (MQ=255) | AAGTGGTACTTCTATCAATTACTTAAGAAGTATGAGGGCGAACAGCTGTATCTTAATGAGTTAGGATATGTTTATGGTAATGAAGAAAAAACAAATGAAATTGTAAAAAAACATCCGGGTTATGTCGTTGAGATTTTTGAAGAAAAGATGG > REL606/4460064‑4460214 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |