New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1287084 | 11 (0.160) | 40 (0.700) | 22/176 | 1.3 | 59.7% | noncoding (153/171 nt) | rttR | rtT sRNA, processed from tyrT transcript |
? | NC_000913 | 1287557 = | 45 (0.780) | noncoding (66/85 nt) | tyrT | tRNA‑Tyr |
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGC > NC_000913/1287427‑1287691 | cGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTc > 1:90959/1‑139 (MQ=255) ctctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAg < 2:638014/139‑1 (MQ=255) ctcGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTc > 1:123986/1‑139 (MQ=255) cgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtggggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:375049‑M2/23‑1 (MQ=255) cGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 1:126502/139‑1 (MQ=255) cgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGc < 2:399570‑M2/24‑1 (MQ=255) cgagccgaaccttaatcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGc < 2:828817‑M2/24‑1 (MQ=255) cTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 1:1532333/139‑1 (MQ=255) aaGGTTCTTACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCtt > 2:1501804/1‑139 (MQ=255) ggTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTg > 2:370952/1‑139 (MQ=255) ctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTgg > 2:453566‑M2/92‑139 (MQ=255) tcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGc > 2:824569‑M2/91‑139 (MQ=255) cttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTc < 1:824569‑M2/54‑1 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtggggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCg < 1:430611‑M2/55‑1 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 1:490855‑M2/38‑1 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 2:490855‑M2/84‑121 (MQ=255) tccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCgg > 1:963475‑M2/84‑139 (MQ=255) ccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagaggtcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:550541‑M2/57‑1 (MQ=255) ttCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGa > 1:1592543/1‑139 (MQ=255) cccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 1:401440‑M2/21‑1 (MQ=255) tCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa > 2:351386/1‑139 (MQ=255) ccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa > 2:673582‑M2/81‑139 (MQ=255) ccccGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:1218715/1‑139 (MQ=255) gcatgggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 2:586160‑M2/61‑1 (MQ=255) ccGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAccc < 2:90959/139‑1 (MQ=255) aatccgcaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCcca > 2:543924‑M2/76‑139 (MQ=255) gggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccac > 2:631744‑M2/75‑139 (MQ=255) tGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCg < 2:1245452/83‑1 (MQ=255) ggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:1199664‑M2/38‑1 (MQ=255) ggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:1199664‑M2/74‑111 (MQ=255) ggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:1653504‑M2/38‑1 (MQ=255) ggcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg > 1:1653504‑M2/74‑111 (MQ=255) gcagaatatttgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacca > 2:143851‑M2/73‑139 (MQ=255) aGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt < 1:361754/78‑1 (MQ=255) aGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCt > 2:361754/1‑78 (MQ=255) gTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACg < 2:1592543/139‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 2:84382/92‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTg < 2:485488/107‑1 (MQ=255) tGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACgg > 1:1534826/1‑139 (MQ=255) cAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACgggg > 1:1204729/1‑139 (MQ=255) tgattgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCA‑GGGGTaattc > 2:509188‑M2/63‑137 (MQ=255) tgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:1287093‑M2/59‑118 (MQ=255) tgcggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 1:1287093‑M2/60‑1 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg < 2:891884‑M2/23‑1 (MQ=255) cggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACgg > 1:891884‑M2/57‑79 (MQ=255) ggattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACca‑ggggtaattcaaatttt > 2:1636617‑M2/56‑130 (MQ=255) tctcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATCCTTTTTAc > 1:983449/1‑139 (MQ=255) gattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 2:1381509‑M2/60‑1 (MQ=255) gattcgcttgagagttcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 1:1381509‑M2/55‑114 (MQ=255) tcACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTg > 2:1256051/1‑139 (MQ=255) gTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTc > 2:1500994/1‑139 (MQ=255) tcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCg > 1:123768‑M2/40‑49 (MQ=255) tcagggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCg < 2:123768‑M2/10‑1 (MQ=255) agggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 2:1191414‑M2/60‑1 (MQ=255) agggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 1:1191414‑M2/38‑97 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt > 2:1534295/1‑70 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 1:1534295/70‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAccc < 2:378720/97‑1 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAccc > 1:378720/1‑97 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCccacca > 1:248724/1‑102 (MQ=255) tCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGAAACCccacca < 2:248724/102‑1 (MQ=255) ggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGa > 2:448095‑M2/36‑55 (MQ=255) ggacttttgaaagtgatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGa < 1:448095‑M2/20‑1 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 1:830198/1‑55 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc < 2:299218/55‑1 (MQ=255) cGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGAc > 1:299218/1‑55 (MQ=255) gCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 2:1328518/94‑1 (MQ=255) gCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 1:1328518/1‑94 (MQ=255) tgtgGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAg < 2:1204729/139‑1 (MQ=255) tggtgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTa > 1:279095/1‑60 (MQ=255) tgAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg < 1:1218715/139‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGTCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGgcg > 2:1228014/1‑139 (MQ=255) gatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 2:961769‑M2/22‑81 (MQ=255) gatggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 1:961769‑M2/60‑1 (MQ=255) atggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc > 1:1213366‑M2/21‑80 (MQ=255) atggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAc < 2:1213366‑M2/60‑1 (MQ=255) tggtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGcatca > 2:223308‑M2/20‑139 (MQ=255) gtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 1:777539‑M2/18‑42 (MQ=255) gtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 2:777539‑M2/25‑1 (MQ=255) gtggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCata > 2:897114‑M2/18‑139 (MQ=255) tggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt > 1:91803‑M2/17‑51 (MQ=255) tggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGt < 2:91803‑M2/35‑1 (MQ=255) tggtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCatat > 1:614531‑M2/17‑139 (MQ=255) gtgggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCa > 1:234750‑M2/15‑139 (MQ=255) gggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa > 2:1570145‑M2/13‑37 (MQ=255) gggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCa < 1:1570145‑M2/25‑1 (MQ=255) ggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTaa < 1:967921‑M2/75‑1 (MQ=255) ggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTaa > 2:33155‑M2/12‑86 (MQ=255) ggggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTaa < 1:33155‑M2/75‑1 (MQ=255) ggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg < 1:199933‑M2/113‑1 (MQ=255) ggaaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCgggg > 2:199933‑M2/10‑122 (MQ=255) aaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 2:886143‑M2/61‑1 (MQ=255) aaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 1:886143‑M2/8‑68 (MQ=255) aaggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGTCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGAcg < 1:1228014‑M2/132‑1 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTCACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc < 2:663757‑M2/61‑1 (MQ=255) aggattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTCACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAcc > 1:663757‑M2/7‑67 (MQ=255) gattCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACgcgc < 1:370952‑M2/135‑1 (MQ=255) tCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg > 1:602062‑M2/2‑58 (MQ=255) tCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCggg < 2:602062‑M2/57‑1 (MQ=255) tCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGaa < 1:594014‑M2/59‑1 (MQ=255) | CGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGC > NC_000913/1287427‑1287691 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |