Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | BX571857 | 2,220,583 | 30 bp→TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA | 12.0% | pseudogene (4082‑4111/5385 nt) | fmtB ← | putative surface anchored protein (pseudogene) |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BX571857 | = 2220582 | 172 (1.090) | 15 (0.150) +TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA |
8/112 | NT | 12.0% | pseudogene (4112/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
? | BX571857 | 2220613 = | 168 (1.060) | pseudogene (4081/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CCAGTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTA > BX571857/2220486‑2220678 | aGTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttga < 2:1759693/97‑1 (MQ=255) tGTATTATCAATTGCTTGCTTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGCTGTTGCTGGTTGCGTGCTttgcatt > 1:2454548/1‑97 (MQ=255) attatGAATTGGTTGATTTTGAGTTGTCTCAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGCTGCTTCTGGTTGCGTGCCatgaattgaa < 2:1892558/97‑1 (MQ=255) attatCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaattgaa < 2:298324/97‑1 (MQ=255) tatCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTgaattgaatt > 2:723807/1‑97 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTc > 2:1266394/1‑97 (MQ=255) tCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCt < 1:1844019/97‑1 (MQ=255) cAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCtt < 1:2488408/97‑1 (MQ=255) aaTTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCttt > 1:1830229/1‑97 (MQ=255) ttGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTcc > 1:2139862/1‑97 (MQ=255) tGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCa < 1:822577/97‑1 (MQ=255) tGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCa > 1:1697788/1‑97 (MQ=255) gCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAg > 2:2566408/1‑97 (MQ=255) cTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGc > 1:1207767/1‑97 (MQ=255) tGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGt > 1:993898/1‑97 (MQ=255) tGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGt > 1:1726562/1‑97 (MQ=255) gATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTc < 2:1057323/97‑1 (MQ=255) aTTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCt < 1:198516/97‑1 (MQ=255) tttGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCttt > 1:477986/1‑97 (MQ=255) ttGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTc > 1:1846399/1‑97 (MQ=255) ttGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTc > 2:2454447/1‑97 (MQ=255) gAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGc < 2:418031/97‑1 (MQ=255) gTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCt > 2:462448/1‑97 (MQ=255) gTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCt < 2:2505589/97‑1 (MQ=255) ttGTCACCGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTg < 2:1435856/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa < 1:884554/97‑1 (MQ=255) cacaGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCt < 1:1779822/97‑1 (MQ=255) acaGCTTGATCTACATCATTTTTAGCCTCTGATTTACACGATCTTCGGGGGTGCGTGCTGTAAAGTGAGTTACTTCCAGCGTCCTCCGCCCGATcca > 2:1498889/1‑95 (MQ=255) acaGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTa > 1:2585347/1‑97 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTgtttttttttattgatacggcgtccaccgagatctac < 2:2047052‑M1/97‑38 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac < 1:523264/97‑1 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac < 1:2063654/97‑1 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac < 1:1462809/97‑1 (MQ=255) cTTTATCAACATCTTTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTttttttttttaatgatacggcgaccaccgagatctacacc < 2:1182194‑M1/97‑41 (MQ=255) cTTGGTCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACAcc > 1:1531348/1‑97 (MQ=255) ttGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGCTGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCa > 2:1699267/1‑97 (MQ=255) ttGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCa > 2:2479022/1‑97 (MQ=255) tGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAt > 1:2279814/1‑97 (MQ=255) cAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc < 2:161601/97‑1 (MQ=255) cAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc > 2:1919333/1‑97 (MQ=255) aCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGGTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatcat > 2:2158679/1‑97 (MQ=255) catcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGTATTCTTGCCACCGTCTCCCGCCTGATCTACACCATTatcatc < 2:2380795/97‑1 (MQ=255) tcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAg > 1:1018082/1‑97 (MQ=255) tcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAg > 2:1554881/1‑97 (MQ=255) tcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAg < 1:566468/97‑1 (MQ=255) catTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGt < 1:2609601/97‑1 (MQ=255) atTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGtt > 1:1926134/1‑97 (MQ=255) ttttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGc < 1:1230595/97‑1 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa < 1:116366/97‑1 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa > 1:1942430/1‑97 (MQ=255) tAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGc > 2:644900/1‑97 (MQ=255) tAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGc < 1:2033489/97‑1 (MQ=255) cATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGt < 1:2411955/97‑1 (MQ=255) tttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTaa > 2:1391744/1‑97 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTttttttttttaatgctacggcgacccccgtgatctacaccattatcatcagttgcagctgtaat < 2:1068906‑M1/97‑65 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGTATTCTTGCCAGCGCCTTTCGCGTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 2:1656724/97‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:174232/97‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:952463/97‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTGGCTGGTTGCGTGCTTTgtttttttttaatgatacggcgtccaccgagatctacaccattatcatcagttgcagctgtaat < 2:273096‑M1/97‑65 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata < 1:77884/97‑1 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata < 1:216612/97‑1 (MQ=255) gATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGCTCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAatat > 2:486977/1‑97 (MQ=255) gATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAatat < 1:2093457/97‑1 (MQ=255) aTTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatt < 1:2061753/97‑1 (MQ=255) tttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta > 1:238209/1‑97 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat > 2:676855/1‑97 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat < 1:2402331/97‑1 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat > 2:1939307/1‑97 (MQ=255) tAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATattatt > 2:443443/1‑97 (MQ=255) tAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATattatt > 1:1869463/1‑97 (MQ=255) aaCCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAttt < 1:709981/97‑1 (MQ=255) aaCCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAttt > 1:1743839/1‑97 (MQ=255) ccGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAttttt > 1:2570557/1‑97 (MQ=255) ccGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAttttt > 1:265427/1‑97 (MQ=255) cGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTc > 2:1351391/1‑97 (MQ=255) tGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTcgcg > 1:648989/1‑97 (MQ=255) tGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAACATTATTTTCcgcg > 2:2080114/1‑97 (MQ=255) gTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTCTTTTTCGCGt > 2:186266/1‑97 (MQ=255) 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ggTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTaa > 1:2374921/1‑97 (MQ=255) ggTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTaa < 1:1282298/97‑1 (MQ=255) gTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAAc > 1:2206662/1‑97 (MQ=255) tGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActg < 1:154854/97‑1 (MQ=255) cGTTCTTTttttttttttaatgatacggcgacccccgagatctacaccattatcatcagttgcagctgtaatattatttttcgcgtctgtaactgct < 2:2223976‑M1/97‑90 (MQ=255) cGTGCTTTGATTTGTATTCTTTCCAGCGTGTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgct < 2:704561/97‑1 (MQ=255) cGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATGATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgct < 1:1420182/97‑1 (MQ=255) tGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGt > 1:1177294/1‑97 (MQ=255) cTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTg > 1:2443836/1‑97 (MQ=255) cTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTg > 1:925768/1‑97 (MQ=255) tttGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATCATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGGCTGTTACTGCTGTTGc > 2:2161667/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:734916/1‑97 (MQ=255) tgatttgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 2:303505/97‑1 (MQ=255) tgaattgtatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 2:80882/97‑1 (MQ=255) | CCAGTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTA > BX571857/2220486‑2220678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |