Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | BX571857 | 2,220,583 | 30 bp→TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA | 12.0% | pseudogene (4082‑4111/5385 nt) | fmtB ← | putative surface anchored protein (pseudogene) |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BX571857 | = 2220582 | 172 (1.090) | 15 (0.150) +TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA |
8/112 | NT | 12.0% | pseudogene (4112/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
? | BX571857 | 2220613 = | 168 (1.060) | pseudogene (4081/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
TTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAGT > BX571857/2220517‑2220709 | ttGTCACCGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTg < 2:1435856/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa > 1:744993/1‑97 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa > 1:2228385/1‑97 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa < 1:2507128/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa < 1:884554/97‑1 (MQ=255) gTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGAt > 2:524524/1‑97 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGTTc < 1:2062416/97‑1 (MQ=255) acaGCTTGATCTACATCATTTTTAGCCTCTGATTTACACGATCTTCGGGGGTGCGTGCTGTAAAGTGAGTTACTTCCAGCGTCCTCCGCCCGATcca > 2:1498889/1‑95 (MQ=255) acaGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTa > 1:2585347/1‑97 (MQ=255) cagcttgatcaacatcatttttagcatttgatttaaccgatgttgctggttgcgtgctttgtttttttttattgatacggcgtccaccgaGATCTac < 2:2047052‑M2/7‑1 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac < 1:523264/97‑1 (MQ=255) gCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTacac < 1:2061096/97‑1 (MQ=255) cttcatcaacatcatttttagcatttgatttaacccatggtgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACAcc < 2:1017258‑M2/10‑1 (MQ=255) cTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACAcc > 2:1356927/1‑97 (MQ=255) ttGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCa > 2:2478784/1‑97 (MQ=255) tCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTat < 1:1862145/97‑1 (MQ=255) cAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc < 1:308298/97‑1 (MQ=255) cAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc > 2:1919333/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 1:804019/1‑97 (MQ=255) aCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGGTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatcat > 2:2158679/1‑97 (MQ=255) catcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGTATTCTTGCCACCGTCTCCCGCCTGATCTACACCATTatcatc < 2:2380795/97‑1 (MQ=255) catcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatcatc > 1:1200088/1‑97 (MQ=255) catcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatcatc > 1:2431640/1‑97 (MQ=255) atcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTAtcatca < 1:2087786/97‑1 (MQ=255) atcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTAtcatca > 1:2195650/1‑97 (MQ=255) tcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAg < 1:566468/97‑1 (MQ=255) tcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAg > 1:1018082/1‑97 (MQ=255) tcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAg > 1:1833160/1‑97 (MQ=255) catTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGt < 1:2609601/97‑1 (MQ=255) atTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGtt > 1:2221812/1‑97 (MQ=255) atTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGtt > 1:1926134/1‑97 (MQ=255) ttttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGc < 1:1230595/97‑1 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa > 1:2144827/1‑97 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa < 1:116366/97‑1 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa > 1:1942430/1‑97 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa > 1:725770/1‑97 (MQ=255) tttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa > 2:2509583/1‑97 (MQ=255) tAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGc < 2:1349718/97‑1 (MQ=255) cATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGt < 1:2411955/97‑1 (MQ=255) ttggtttaaccgatcttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 2:642976‑M2/34‑1 (MQ=255) ttgatttaaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgctacggcgacccccgtGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 2:1068906‑M2/34‑1 (MQ=255) ttgatttaaccgatgtggctggttgcgtgctttgtttttttttaatgatacggcgtccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 2:273096‑M2/34‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:952463/97‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:174232/97‑1 (MQ=255) gATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGCTCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAatat > 2:486977/1‑97 (MQ=255) tttcaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta < 2:1983622‑M2/38‑1 (MQ=255) tttaaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttcatgctacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta < 2:1704390‑M2/38‑1 (MQ=255) tttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta > 1:238209/1‑97 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat < 1:2402331/97‑1 (MQ=255) tAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATattatt > 2:443443/1‑97 (MQ=255) aCCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAtttt > 2:1619345/1‑97 (MQ=255) aCCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAtttt < 2:1790027/97‑1 (MQ=255) ccGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAttttt > 1:2570557/1‑97 (MQ=255) tGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTcgcg > 2:2172858/1‑97 (MQ=255) tGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTcgcg > 1:648989/1‑97 (MQ=255) gTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTCTTTTTCGCGt > 2:186266/1‑97 (MQ=255) gCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTg > 1:1811751/1‑97 (MQ=255) cTGGTTGCGTGCTTTGAATTTAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGt < 2:2622880/97‑1 (MQ=255) tGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTa < 1:1901415/97‑1 (MQ=255) tGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTa > 1:2327177/1‑97 (MQ=255) ggTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTaa > 1:2374921/1‑97 (MQ=255) ggTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTaa < 1:1282298/97‑1 (MQ=255) ggTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTaa > 2:1567663/1‑97 (MQ=255) tGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActg < 1:2113716/97‑1 (MQ=255) cGTGCTTTGATTTGTATTCTTTCCAGCGTGTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgct < 2:704561/97‑1 (MQ=255) gTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgctg < 1:1600380/97‑1 (MQ=255) cTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTg > 1:2443836/1‑97 (MQ=255) tttGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATCATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGGCTGTTACTGCTGTTGc > 2:2161667/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGcc > 2:66166/1‑96 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:1409181/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:1424176/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 2:303909/1‑97 (MQ=255) tgatttgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 2:303505/97‑1 (MQ=255) tgaattgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 1:684172/97‑1 (MQ=255) ttgaattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAttg > 2:1902528/1‑97 (MQ=255) ttgaattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAttg < 2:1542112/97‑1 (MQ=255) tgaattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAttgt > 1:1171949/1‑97 (MQ=255) ttCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGaa > 2:2027969/1‑97 (MQ=255) cTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATa > 2:445822/1‑97 (MQ=255) tttCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAg < 1:1536501/97‑1 (MQ=255) ccAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTACTTGTTGAATAgctg > 2:1677479/1‑97 (MQ=255) ccAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAgctg > 2:1054775/1‑97 (MQ=255) gCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGctt > 1:1745492/1‑97 (MQ=255) gCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGctt < 2:2582351/97‑1 (MQ=255) cggcgtccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGctt < 2:219037‑M2/84‑1 (MQ=255) cGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttc < 2:841076/97‑1 (MQ=255) ttCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttct < 1:1062502/96‑1 (MQ=255) gTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttct > 1:60872/1‑97 (MQ=255) gTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttct < 1:507296/97‑1 (MQ=255) cTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCttt > 2:914615/1‑97 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt < 1:227974/97‑1 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt < 2:79004/97‑1 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt > 1:1486984/1‑97 (MQ=255) ttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCttttt < 1:269431/97‑1 (MQ=255) cgcGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCttttt < 2:383523/95‑1 (MQ=255) tCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttc < 2:2111506/97‑1 (MQ=255) tCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttc < 1:2619589/97‑1 (MQ=255) cGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttct > 2:2236200/1‑97 (MQ=255) cGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttct < 2:689569/97‑1 (MQ=255) cTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCa < 1:943052/97‑1 (MQ=255) | TTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAGT > BX571857/2220517‑2220709 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |