Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | BX571857 | 2,220,583 | 30 bp→TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA | 18.7% | pseudogene (4082‑4111/5385 nt) | fmtB ← | putative surface anchored protein (pseudogene) |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BX571857 | = 2220582 | 174 (1.140) | 25 (0.250) +TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA |
18/112 | NT | 18.7% | pseudogene (4112/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
? | BX571857 | 2220613 = | 163 (1.060) | pseudogene (4081/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CAGTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTA > BX571857/2220487‑2220678 | cAGTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttg < 1:1965797/97‑1 (MQ=255) gTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaa > 1:1892603/1‑97 (MQ=255) tGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaatt > 1:1691428/1‑97 (MQ=255) tGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaatt > 1:620637/1‑97 (MQ=255) tGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaatt > 1:1306500/1‑97 (MQ=255) gTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaattg > 1:206740/1‑97 (MQ=255) tattatCAATTGCTTGATTTTGAGCTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaattga < 2:209172/97‑1 (MQ=255) attatCTATTGCTTGATTTTTATTTGTCACAGCTCGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTttgaattgaa < 2:339065/97‑1 (MQ=255) ttatCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTtgaattgaat > 1:905786/1‑97 (MQ=255) ttatCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTtgaattgaat < 1:1058526/97‑1 (MQ=255) tatCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTgaattgaatt > 2:1227466/1‑97 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGACTTc > 1:1953912/1‑97 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTc > 1:1158249/1‑97 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTc < 1:2100422/97‑1 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTc > 2:1770929/1‑97 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTc < 2:174421/97‑1 (MQ=255) atCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTc < 2:1056923/97‑1 (MQ=255) tCAATTGCTTGATTTTTAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCt < 2:1964357/97‑1 (MQ=255) catttGCTTGATTTTGAGTGGTCACAGCTTGAGCAGCGTCATTTTTAGCATTGTATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCtt < 2:626512/94‑1 (MQ=255) aaTTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCttt < 1:320553/97‑1 (MQ=255) aTTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTc < 1:831976/97‑1 (MQ=255) gCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAg > 1:1021369/1‑97 (MQ=255) cTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGc > 2:1494443/1‑97 (MQ=255) ttGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCg < 2:1803279/97‑1 (MQ=255) ttttGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCtt > 1:130581/1‑97 (MQ=255) ttGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTg < 1:1083726/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa < 2:1414880/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa > 1:606567/1‑97 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATc < 1:1883514/97‑1 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATc < 1:1320728/97‑1 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATc < 1:1152908/97‑1 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac > 1:369499/1‑97 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac > 1:1045566/1‑97 (MQ=255) gCTTGATCATCATCTTTTTTTGCATTTGATTTAGCCGGTGCTCCTGGTTGCGTGCTTTttttttttttaatgatacggcgaccaccgagatctacac < 2:1914931‑M1/97‑40 (MQ=255) ttGATCAACATCCTTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACAccc > 1:2506139/1‑96 (MQ=255) ttGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCa > 2:2536941/1‑97 (MQ=255) tGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAt < 1:47122/97‑1 (MQ=255) gATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAtt > 2:2206169/1‑97 (MQ=255) gATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAtt < 1:407705/97‑1 (MQ=255) tCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTat > 2:2142724/1‑97 (MQ=255) cAACATCATTTTTTGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc > 2:399145/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 2:1619779/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca < 1:557874/97‑1 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 2:753424/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 2:758909/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATCTGATTTACCCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTCTGAATTGAATTCTTACCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCCTTatcc > 2:251010/1‑96 (MQ=255) aCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTttttttttttaatgatacggcgaccaccgagatctacaccattatcat < 2:696489‑M1/97‑49 (MQ=255) atcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTAtcatca < 1:1135859/97‑1 (MQ=255) atcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTAtcatca < 1:1644002/97‑1 (MQ=255) tcatTTTTTGCTTTTGATTTACCCCATGCTGCTGGTTGCTTGCTTTttttttttttaatgatacggcgaccaccgagatctacaccattatcatcag < 2:1275083‑M1/97‑52 (MQ=255) atTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCACTATCATCAGtt > 2:479975/1‑97 (MQ=255) tAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGc < 1:759078/97‑1 (MQ=255) aGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCt > 2:2571387/1‑97 (MQ=255) gCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTg > 2:1350292/1‑97 (MQ=255) cATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTttttttttttattgccacggcgacccccgagatctacaccattatcatcagttgcagctgt < 2:638702‑M1/97‑62 (MQ=255) cATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGTATTCTTTACACCGTCTCTCCCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGt < 2:1813782/97‑1 (MQ=255) aTTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTa > 1:1209861/1‑97 (MQ=255) aTTTGATTTAACCGACGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAACTGAATTATTTCCAGCGCCTTTCGCCGGATCTACATCTTTAGCATCAGTGTCAGCTGTa > 2:1646654/1‑97 (MQ=255) tttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTaa > 2:1511521/1‑97 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:1350707/97‑1 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata > 1:214457/1‑97 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata > 2:278333/1‑97 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata < 1:1379798/97‑1 (MQ=255) aTTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatt > 2:1458610/1‑97 (MQ=255) tttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta > 1:1632382/1‑97 (MQ=255) tttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCACCGTCTTTCGCCTGCTCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTTTAAtatta > 2:469030/1‑97 (MQ=255) ttAACCGATGTTTCTGGTTGCGTGCTTTttttttttttaatgatacggcgaccaccgagatctacaccattatcatcagttgcagctgtaatattat < 2:418603‑M1/97‑70 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTtattttttttcttgctagcgcgactcccgagatctacaccattatcatcagttgcagctgtaatattat < 2:2232028‑M1/97‑70 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat < 1:1251737/97‑1 (MQ=255) tAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATattatt > 2:1834937/1‑97 (MQ=255) cGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTc > 1:1990581/1‑97 (MQ=255) aTGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTcgc > 1:2353261/1‑97 (MQ=255) gTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCCGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGt > 2:1221714/1‑97 (MQ=255) ttGCTGGTTGCGTGCTTTTTTTTTTTTTCTTTCCAGCGTCTTCCCCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTc < 2:587441/97‑1 (MQ=255) ttGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTc > 1:2505155/1‑97 (MQ=255) gTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAAc > 2:1166845/1‑97 (MQ=255) ttGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAAct < 2:1401138/97‑1 (MQ=255) ttGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTGCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAAct < 2:498881/97‑1 (MQ=255) tGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActg > 1:527002/1‑97 (MQ=255) gCGTGCTTTGTATTGTTTTCTTGCCAGGGCCTCCCCCGTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc < 2:865990/97‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc < 1:780829/97‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc > 1:2575864/1‑97 (MQ=255) gCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc < 1:241016/97‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc > 2:1095899/1‑97 (MQ=255) cGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgct < 1:1919341/97‑1 (MQ=255) gTGCTTTGTATTGAATTCTTTCCCGCGTCTTTCGCCTGATCTACGCCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgctg < 1:31042/97‑1 (MQ=255) gTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgctg < 1:1787427/97‑1 (MQ=255) tGCTTTGAGTTTATTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGt < 2:348373/97‑1 (MQ=255) tGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGt > 2:1699851/1‑97 (MQ=255) gCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCCGCTGTAATATTGTTTTTCGCGGCTGTAACTGCTGtt > 2:1314349/1‑97 (MQ=255) gCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGtt < 1:468806/97‑1 (MQ=255) cTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTg > 2:2360988/1‑97 (MQ=255) cTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTg > 1:2277502/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt < 1:1451983/97‑1 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 2:1885120/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:2154664/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:2545493/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:977619/1‑97 (MQ=255) tgaattgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 1:1564885/97‑1 (MQ=255) tgaattgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa > 2:83436/1‑97 (MQ=255) | CAGTTGTATTATCAATTGCTTGATTTTGAGTTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTA > BX571857/2220487‑2220678 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |