Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC | BX571857 | 2,220,583 | 30 bp→TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA | 18.7% | pseudogene (4082‑4111/5385 nt) | fmtB ← | putative surface anchored protein (pseudogene) |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BX571857 | = 2220582 | 174 (1.140) | 25 (0.250) +TTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCACCGA |
18/112 | NT | 18.7% | pseudogene (4112/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
? | BX571857 | 2220613 = | 163 (1.060) | pseudogene (4081/5385 nt) | fmtB | putative surface anchored protein (pseudogene) |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
TTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAGT > BX571857/2220517‑2220709 | ttGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTg < 1:1083726/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGGTGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa < 2:2519647/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa < 2:1414880/97‑1 (MQ=255) tGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGa > 1:1468073/1‑97 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATc < 2:489951/97‑1 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATc < 1:1320691/97‑1 (MQ=255) tCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATc < 1:1883514/97‑1 (MQ=255) caGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTac > 1:369499/1‑97 (MQ=255) aGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTaca > 1:2430935/1‑97 (MQ=255) cttgttcatcttcatttttagcttttgatttaacctatgttgctggttgcgtgctttttttttttttattgctacggcgtccaccgtGATCTACAcc < 2:716976‑M2/10‑1 (MQ=255) cTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACAcc > 1:956449/1‑97 (MQ=255) tGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGTATTGTATTCTTGCCAGCGCGTCCCGCGAGATCTACACCAt < 2:2056629/97‑1 (MQ=255) tGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAt < 1:47122/97‑1 (MQ=255) tGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAt > 1:310912/1‑97 (MQ=255) gATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAtt > 2:2206169/1‑97 (MQ=255) gATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAtt < 1:407705/97‑1 (MQ=255) tcaacatcatttttagcatttgatttaaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttcttgccaccgcctcccccgaGATCTACACCATTat < 2:1176553‑M2/15‑1 (MQ=255) tCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTat > 2:2142724/1‑97 (MQ=255) cAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc < 1:538861/97‑1 (MQ=255) cAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatc > 1:1026918/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 2:758909/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 2:1619779/1‑97 (MQ=255) aaCATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTatca > 2:753424/1‑97 (MQ=255) catcattttttgcttttgatttaacccatgttgctggtttcctgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTatcatc < 2:275400‑M2/19‑1 (MQ=255) catcattttttgcatttggtttaaccggtgttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTatcatc < 2:1891007‑M2/19‑1 (MQ=255) catcaaTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCAGGTTGCGCGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGTTCTACACCATAatcatc > 2:1816425/1‑97 (MQ=255) atcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTAtcatca < 1:1644002/97‑1 (MQ=255) atcatTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTCGCGTGCATTGATTTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCAGTAtcgtca > 2:1500073/1‑97 (MQ=255) tcattttttgcttttgatttaccccatgctgctggttgcttgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAg < 2:1275083‑M2/21‑1 (MQ=255) ttttAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGc > 1:1449358/1‑97 (MQ=255) tttagcatttgatttcaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCa < 2:63109‑M2/26‑1 (MQ=255) gcgtttGATTTAACCGAAGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGCATGGAGTTCTTTCCAGCGTATTTCGTCTTGTCTACTCCATTTTCATCTGTTGGTGCTg > 2:513008/4‑97 (MQ=255) gcatttgatttaaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttcatgccaccgccacccccgtGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTg < 2:668782‑M2/30‑1 (MQ=255) aTTTGATTTAACCGACGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAACTGAATTATTTCCAGCGCCTTTCGCCGGATCTACATCTTTAGCATCAGTGTCAGCTGTa > 2:1646654/1‑97 (MQ=255) tttgatttagccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTaa < 2:1881526‑M2/33‑1 (MQ=255) tttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTaa > 2:1982480/1‑97 (MQ=255) tttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTaa > 2:1511521/1‑97 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:1350707/97‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:1256680/97‑1 (MQ=255) ttGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAat < 1:2324431/97‑1 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata > 1:1114202/1‑97 (MQ=255) tGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAata > 1:214457/1‑97 (MQ=255) tgttacccgttcttgcttgtttcgttctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatt < 2:290454‑M2/37‑1 (MQ=255) aTTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatt > 2:1458610/1‑97 (MQ=255) aTTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatt < 1:1956324/97‑1 (MQ=255) tttaaccgatgttgctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgtccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta < 2:1033527‑M2/38‑1 (MQ=255) tttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtatta > 1:1632382/1‑97 (MQ=255) tttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCACCGTCTTTCGCCTGCTCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTTTAAtatta > 2:469030/1‑97 (MQ=255) ttaaccgatgtttctggttgcgtgctttttttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat < 2:418603‑M2/39‑1 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCTGTTGCAGCGGTAAtattct > 2:1719074/1‑95 (MQ=255) ttAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAAtattat < 1:1251727/97‑1 (MQ=255) tAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATattatt > 2:1834937/1‑97 (MQ=255) tAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATattatt > 1:611205/1‑97 (MQ=255) aaCCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGATTTGTATTCTTGCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTAttt < 2:1792307/97‑1 (MQ=255) cGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTc > 1:1990581/1‑97 (MQ=255) gATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTcg > 1:1146091/1‑97 (MQ=255) tGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTcgcg < 2:1924108/97‑1 (MQ=255) gTTGCTGGTTGCGTGCTTTGTTTTGTGTTCTTGCCAGGGCGTCCAGCGAGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGt < 2:895893/97‑1 (MQ=255) ttGCTGGTTGCGTGCTTTTTTTTTTTTTCTTTCCAGCGTCTTCCCCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTc < 2:587441/97‑1 (MQ=255) ttGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTc > 1:2505167/1‑97 (MQ=255) ggTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTaa > 2:2571390/1‑97 (MQ=255) ttGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAAct < 2:1401138/97‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTGTATTGTTTTCTTGCCAGGGCCTCCCCCGTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc < 2:865990/97‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc < 1:780829/97‑1 (MQ=255) gCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAActgc > 1:2575864/1‑97 (MQ=255) gCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGtt < 1:468806/97‑1 (MQ=255) cTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTg > 2:2360988/1‑97 (MQ=255) tttGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGc > 2:1227200/1‑97 (MQ=255) ttgaattgaaTTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCt > 1:2545493/1‑97 (MQ=255) tgtttttttttaatgatacggcgaccaccgaGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 2:409427‑M2/66‑1 (MQ=255) tgaattgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa > 2:83436/1‑97 (MQ=255) tgaattgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 1:2375326/97‑1 (MQ=255) tgaattgaatTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTa < 1:1564885/97‑1 (MQ=255) attgaattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAtt < 1:1836828/97‑1 (MQ=255) ttgaattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAttg < 2:1316368/97‑1 (MQ=255) tgaattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAttgt > 1:2206995/1‑97 (MQ=255) aattCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAAttgttg > 1:210207/1‑97 (MQ=255) ttCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGaa > 1:1335878/1‑97 (MQ=255) tCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAAt < 1:753817/97‑1 (MQ=255) tCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAAt < 1:2282397/97‑1 (MQ=255) cAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAgctgc > 1:190670/1‑97 (MQ=255) aGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAgctgct < 1:579817/97‑1 (MQ=255) cGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttc > 2:1313768/1‑97 (MQ=255) tCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttctt < 1:602423/97‑1 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCGTTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt < 1:7727/97‑1 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt > 1:1184403/1‑97 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt > 2:1825361/1‑97 (MQ=255) tttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCtttt < 1:2262175/97‑1 (MQ=255) ttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGcttcttctt > 2:1073627/1‑97 (MQ=255) ttCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCttttt > 2:2279301/1‑97 (MQ=255) tCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttc < 1:1923253/97‑1 (MQ=255) cGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttct < 2:1686108/97‑1 (MQ=255) gCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttctt < 1:2007463/97‑1 (MQ=255) gCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttctt > 2:2304185/1‑97 (MQ=255) ccgtGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttctt < 2:370609/94‑1 (MQ=255) cTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTttcttct > 2:2437631/1‑96 (MQ=255) tGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAg < 1:1810368/97‑1 (MQ=255) tGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCGGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAg > 2:255808/1‑97 (MQ=255) tGATCTACACCATTAGCGTGAGTTGTAGCTGTGATATTATGTGTAGCGTGGGTAACTGCTGTTGCTGAGTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAg > 2:825965/1‑97 (MQ=255) gATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAGt < 1:997903/97‑1 (MQ=255) | TTGTCACAGCTTGATCAACATCATTTTTAGCATTTGATTTAACCGATGTTGCTGGTTGCGTGCTTTGAATTGAATTCTTTCCAGCGTCTTTCGCCTGATCTACACCATTATCATCAGTTGCAGCTGTAATATTATTTTTCGCGTCTGTAACTGCTGTTGCTAATTGTTGAATAGCTGCTTCTTTTTCTTCAGT > BX571857/2220517‑2220709 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |