| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | BX571857 | 1,034,532 | Δ4 bp | 17.1% | coding (451‑454/603 nt) | SAS0962 → | putative membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 1034536 = | 107 (0.530) | 19 (0.110) | 17/150 | NT | 17.1% | coding (455/603 nt) | SAS0962 | putative membrane protein |
| ? | BX571857 | = 1034531 | 91 (0.520) | coding (450/603 nt) | SAS0962 | putative membrane protein | |||||
CAACGGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < BX571857/1034640‑1034536‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaataaataaTGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATATAACTC < BX571857/1034531‑1034436 CAACGGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAA > 2:516550/1‑97 AACGGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAA < 1:536885/97‑1 AACGGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAA < 1:2987434/97‑1 ACGGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAAT > 1:1119596/1‑97 ACGGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAAT < 2:2358470/97‑1 GGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAA > 1:159169/1‑97 GGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAA > 1:615692/1‑97 GGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAA > 1:154164/1‑97 GGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAA > 2:2566967/1‑97 GGATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAA < 1:1136198/97‑1 GATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACAAATTATCTAAATAAA > 1:1036951/1‑97 ATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAAT < 1:1780816/97‑1 ATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAAT < 2:2490084/97‑1 ATGTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAAT < 2:382174/97‑1 GTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAA > 2:251358/1‑97 GTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAA > 2:1088467/1‑97 GTTGTTGCTATACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAA > 1:569463/1‑97 ACGTCGAGTATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAAC > 1:1512339/1‑97 TATACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCA < 2:638057/97‑1 TACTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGT > 1:491598/1‑97 CTCATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTA > 2:915363/1‑97 CATAACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCCATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATT < 2:1069839/97‑1 ACTTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATCGCAGATATTAATA > 2:1750785/1‑97 TTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATA < 1:2861976/97‑1 TTAATGATAATATCACTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATA < 2:1126645/97‑1 CTTGTGCAACAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGT < 1:818356/97‑1 CAAATATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAA > 1:1109780/1‑97 TATAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTG > 1:238746/1‑97 TAAATGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTT < 2:496363/97‑1 TGTTACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATT > 2:1904346/1‑97 ACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTT < 1:1440456/97‑1 ACTATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTT < 1:1440795/97‑1 TATCCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTT < 2:1690462/97‑1 CCACCAATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTA < 2:1394114/97‑1 AATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACA > 2:3187286/1‑97 ATTATCTAAATAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAG < 2:3321081/97‑1 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TAAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATA < 2:2635979/97‑1 AAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATAT > 2:2095945/1‑97 AAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATAT > 2:2287945/1‑97 AAATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATAT > 1:3161438/1‑97 AATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATATA > 1:2368941/1‑97 AATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATATA < 1:1389005/97‑1 AATAATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATATA > 2:730927/1‑97 AATGAACTAGAACAAATTGCAGTTATTAATATAGCTACCCATTTCGGTATTGAAAAATGTGTTAATTCTTTTTGTAAAACAGTTCTCATATATAACT > 1:1139225/1‑97 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |