| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | BX571857 | 1,034,532 | Δ4 bp | 17.1% | coding (451‑454/603 nt) | SAS0962 → | putative membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 1034536 = | 107 (0.530) | 19 (0.110) | 17/150 | NT | 17.1% | coding (455/603 nt) | SAS0962 | putative membrane protein |
| ? | BX571857 | = 1034531 | 91 (0.520) | coding (450/603 nt) | SAS0962 | putative membrane protein | |||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GAGTTATATATGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCGACGTATAGC > BX571857/1034436‑1034626 | gAGTTATATATGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAt > 1:2864297‑M2/1‑96 (MQ=255) aGTTATATATGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAtt > 1:1139225‑M2/1‑95 (MQ=255) tatataTGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatt > 1:2368941‑M2/1‑92 (MQ=255) tatataTGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatt > 2:730927‑M2/1‑92 (MQ=255) tatataTGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatt < 1:1389005‑M2/97‑6 (MQ=255) tatatGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttattta < 2:2635979‑M2/97‑8 (MQ=255) tatatGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttattta > 2:1346012‑M2/1‑90 (MQ=255) tGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttattta > 1:988621‑M2/1‑86 (MQ=255) gagaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttat > 1:1095098/1‑97 (MQ=255) agaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGTAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATtatttatttatt > 2:1878296/1‑97 (MQ=255) agaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttaga < 2:2025626‑M2/97‑14 (MQ=255) agaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATtatttatttatt > 2:769237/1‑97 (MQ=255) agaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATtatttatttatt < 2:2668934/97‑1 (MQ=255) gaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagat < 1:3055050‑M2/97‑15 (MQ=255) gaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagat > 1:2694719‑M2/1‑83 (MQ=255) gaACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTatttatttattt < 2:82943/97‑1 (MQ=255) aaCTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagata > 2:2199677‑M2/1‑82 (MQ=255) aaCTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTAtttatttattta > 2:2506508/1‑97 (MQ=255) gcTGTTTTACAAAAAGAATTAACACGTTTTTGAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAg < 2:1159909/96‑1 (MQ=255) cTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataat < 2:3321081‑M2/97‑18 (MQ=255) cTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGa > 1:2885420/1‑97 (MQ=255) tGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataatt > 2:3187286‑M2/1‑79 (MQ=255) gTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATa > 1:2380683/1‑97 (MQ=255) ttttACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATTACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATaa < 2:1229104/97‑1 (MQ=255) tACGAAAAGAAGTAGCGCATTTTTCGGTACCGATGTGGGTAGCTGTATTAATGACGGCAATTGGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATtg < 2:1427427/97‑1 (MQ=255) aaaaaGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggata < 2:1690462‑M2/97‑27 (MQ=255) aaaGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagt < 1:1440456‑M2/97‑29 (MQ=255) aaaGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGa < 1:3285196/97‑1 (MQ=255) aaTTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGt < 2:2209500/97‑1 (MQ=255) aaTTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGt > 1:1477514/1‑97 (MQ=255) ttAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTaa < 1:2092315/97‑1 (MQ=255) tAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAAc < 2:15436/97‑1 (MQ=255) tAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAAc > 2:2114361/1‑97 (MQ=255) aaCACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacattta < 2:496363‑M2/97‑37 (MQ=255) aaCACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACa > 2:2521745/1‑97 (MQ=255) cacaTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACAtt > 2:1503134/1‑97 (MQ=255) acaTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACAttt > 2:2425539/1‑97 (MQ=255) caTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 2:1087180/97‑1 (MQ=255) caTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 1:3027085/97‑1 (MQ=255) caTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 1:1349342/97‑1 (MQ=255) aTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtat < 1:1851196/97‑1 (MQ=255) aTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtat < 2:5734/97‑1 (MQ=255) tttttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttg > 1:1109780‑M2/1‑55 (MQ=255) tttttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtata > 2:2802046/1‑97 (MQ=255) tttttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtata > 2:1578947/1‑97 (MQ=255) ttttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTatat < 1:2793936/97‑1 (MQ=255) tttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATAtt < 2:2217363/97‑1 (MQ=255) tttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATAtt > 2:2120037/1‑97 (MQ=255) ttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATAttt > 1:2041615/1‑97 (MQ=255) cAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATttgt < 1:1191477/97‑1 (MQ=255) aTACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATttgttg < 1:1504802/97‑1 (MQ=255) tACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGc > 1:2001347/1‑97 (MQ=255) ccGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGcac > 2:1889621/1‑97 (MQ=255) ccGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGcac < 1:1535348/97‑1 (MQ=255) gAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACaa > 1:1922050/1‑97 (MQ=255) gAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACaa < 2:497334/97‑1 (MQ=255) gAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACaa > 1:737656/1‑97 (MQ=255) aaTGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGt > 1:20081/1‑97 (MQ=255) aaTGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGt < 1:486382/97‑1 (MQ=255) aTGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTg > 1:3168813/1‑97 (MQ=255) tGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGa < 2:1167108/97‑1 (MQ=255) gggTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGat > 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1:2744635/97‑1 (MQ=255) cTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATc > 1:2925877/1‑97 (MQ=255) cTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATc < 1:3280658/97‑1 (MQ=255) tataTTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaa < 1:2861976‑M2/97‑67 (MQ=255) tataTTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCa > 1:2415611/1‑97 (MQ=255) tataTTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCa > 1:185849/1‑97 (MQ=255) tataTTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCa > 2:1037279/1‑97 (MQ=255) tataTTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCa < 2:2592971/97‑1 (MQ=255) tatTAATATCTGCGATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaagt > 2:1750785‑M2/1‑29 (MQ=255) tatTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCAtt < 2:495441/97‑1 (MQ=255) atTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTa < 2:2462202/97‑1 (MQ=255) aataaCTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataatgggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaagttatg < 2:1069839‑M2/97‑73 (MQ=255) taaCTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaagttatgag > 2:915363‑M2/1‑23 (MQ=255) aCTGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaagttatgagta > 1:491598‑M2/1‑21 (MQ=255) aCTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATg > 2:3294947/1‑97 (MQ=255) aCTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATg > 2:172953/1‑97 (MQ=255) tGCAATTTGTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaagttatgagtata < 2:638057‑M2/97‑79 (MQ=255) tGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGCTAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAg > 2:886251/1‑97 (MQ=255) gCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGt < 1:527330/97‑1 (MQ=255) cactttGCTCTCGTTCATTATTTATCTATTTAGATAATGGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACACGTGATATTATCATTAAGTTACGAGta > 2:3142483/4‑97 (MQ=255) cAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGta < 1:2441697/97‑1 (MQ=255) aaTTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGtat < 2:1424878/97‑1 (MQ=255) aTTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATGGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGtata < 1:194530/97‑1 (MQ=255) tttGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATAc < 1:156420/97‑1 (MQ=255) tGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTc > 1:3195651/1‑97 (MQ=255) tGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTc > 2:2009379/1‑97 (MQ=255) gTTCTAGTTCAttatttatttagataattggtggatagtaacatttatatttgttgcacaagtgatattatcattaagttatgagtatactcgacgt > 1:1512339‑M2/1‑11 (MQ=255) gTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCg < 1:1342095/97‑1 (MQ=255) cTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCGACg > 2:2617222/1‑97 (MQ=255) gTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCGACGtat > 2:2933034/1‑97 (MQ=255) cATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCGACGTATAGc > 1:9861/1‑97 (MQ=255) | GAGTTATATATGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCGACGTATAGC > BX571857/1034436‑1034626 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |