| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | BX571857 | 1,034,532 | Δ4 bp | 17.1% | coding (451‑454/603 nt) | SAS0962 → | putative membrane protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BX571857 | 1034536 = | 107 (0.530) | 19 (0.110) | 17/150 | NT | 17.1% | coding (455/603 nt) | SAS0962 | putative membrane protein |
| ? | BX571857 | = 1034531 | 91 (0.520) | coding (450/603 nt) | SAS0962 | putative membrane protein | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TATATATGAGAACTGTTTTACAAAAAGAATTAACACATTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTTATATTTGTTGCACAAGTGATATTATCATTAAGTTATGAGTATACTCGACGTATAGCAACAAC > BX571857/1034440‑1034632 | gagttatatatgagaactgttttacaaaaagaattaacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattactaactgaaatttgttctagttcat < 2:1468796‑M1/1‑1 (MQ=255)gagttatatatgagaactgttttacaaaaagaattaacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattaataactgcaatttgttctagttcat > 2:1695507‑M1/97‑97 (MQ=255)gagttatatatgagaactgttttacaaaaagaattaacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattaataactgcaatttgttctagttcat > 1:2864297‑M1/97‑97 (MQ=255) agttatatatgagaactgttttacaaaaagaattaacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattaataactgcaatttgttctagttcatt > 1:1139225‑M1/96‑97 (MQ=255) tatatatgagaactgttttacaaaaagaattaacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattaataactgcaatttgttctagttcattatt > 1:2368941‑M1/93‑97 (MQ=255) tatatatgagaactgttttacaaaaagaattaacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattaataactgcaatttgttctagttcattatt > 2:730927‑M1/93‑97 (MQ=255) 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(MQ=255) caTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 1:3027085/97‑1 (MQ=255) caTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 1:1349342/97‑1 (MQ=255) caTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 2:1087180/97‑1 (MQ=255) aacacatttttcaataccgaaatgggtagctatattaataactgcaatttgttctagttcaTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTta < 2:496363‑M1/36‑1 (MQ=255) ttttttCAATACCGCAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTGCATTATTTATTTGTTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtat < 2:439904/96‑1 (MQ=255) aTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtat < 2:5734/97‑1 (MQ=255) aTTTTTCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtat < 1:1851196/97‑1 (MQ=255) tttttCAATACCGAAATGGGTAGCTATATTAATAACTGCAATTTGTTCTAGTTCATTATTTATTTATTTAGATAATTGGTGGATAGTAACATTtata > 2:1578947/1‑97 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |