New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BX571857 | = 2057286 | 301 (1.360) | 6 (0.030) | 6/152 | NT | 2.3% | intergenic (‑168/+45) | SAS1905/SAS1906 | hypothetical phage protein/hypothetical phage protein |
? | BX571857 | 2057751 = | 245 (1.270) | coding (501/921 nt) | SAS1906 | hypothetical phage protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
GTAATGCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGTTTCTCCCA > BX571857/2057654‑2057848 | gTAATGCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCATTAGTCATTACTTCAATATAGTTTTCTCGTCCATAATTa > 2:3106382/1‑98 (MQ=255) tAATGCTGTTTCATCTTTAAGCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGGCCATCATTaa < 2:1936127/98‑1 (MQ=255) tGCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCATTATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATa > 2:2382793/1‑98 (MQ=255) tGCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATa > 1:105324/1‑98 (MQ=255) tGCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATa > 2:1786459/1‑98 (MQ=255) ccctgctatatgtcttgttttatatttgaaatgcttttgaacacgttcaaattttatacctgcctcaagtagtaacgtagtacgtccatcattAAATa > 1:1510643‑M2/94‑98 (MQ=255) gCTTTTTCTTCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATAc > 2:1114721/1‑98 (MQ=255) gCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATAc > 1:3275979/1‑98 (MQ=255) cTTTTTCTTCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACg < 1:944370/98‑1 (MQ=255) cTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACg > 1:496337/1‑98 (MQ=255) tttttCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGa > 1:2699547/1‑98 (MQ=255) tttCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGAtt < 1:2444080/98‑1 (MQ=255) ttCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATtg > 1:1804910/1‑98 (MQ=255) tCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATtgt > 2:2048866/1‑98 (MQ=255) cATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAACTACGATtgtg > 2:2217672/1‑98 (MQ=255) aTCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGc > 2:651632/1‑98 (MQ=255) aTCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGc < 1:988737/98‑1 (MQ=255) tCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCa < 1:1410895/98‑1 (MQ=255) tCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCa > 2:2517138/1‑98 (MQ=255) cTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAg > 2:3641413/1‑98 (MQ=255) cTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAg > 1:1361849/1‑98 (MQ=255) tttAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGt < 2:2834674/98‑1 (MQ=255) tttAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGt < 2:3406266/98‑1 (MQ=255) tttAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGt < 2:3309603/98‑1 (MQ=255) tAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTAc > 1:2665321/1‑98 (MQ=255) aTCGTTGCTTACTGCAGCCATTCTTGTTTATTTGGTTCAAGAGCCGTGACTTCTAGATAGTTGTCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGGACGc < 2:1660926/98‑1 (MQ=255) aTCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGc > 1:1985599/1‑98 (MQ=255) cATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCAc > 2:2667785/1‑98 (MQ=255) cATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCAc < 1:74407/98‑1 (MQ=255) cATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCAc > 2:1354603/1‑98 (MQ=255) gaCTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAAt > 1:576229/1‑98 (MQ=255) aCTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATg > 1:64897/1‑98 (MQ=255) aCTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATg > 1:2105475/1‑98 (MQ=255) cTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGt < 1:2131503/98‑1 (MQ=255) cTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGt > 1:1743272/1‑98 (MQ=255) gCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGttt > 2:3367418/1‑98 (MQ=255) cATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGtttt < 1:3057015/98‑1 (MQ=255) aTCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTc < 2:116633/98‑1 (MQ=255) tCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCt > 2:3149325/1‑98 (MQ=255) tCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCt < 1:2634145/98‑1 (MQ=255) tCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCt < 1:2957097/98‑1 (MQ=255) tCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCt > 1:152456/1‑98 (MQ=255) ccATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCtt < 1:2373094/98‑1 (MQ=255) ccATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCtt < 1:66431/98‑1 (MQ=255) cATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCttt < 1:702072/98‑1 (MQ=255) aTGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTg > 2:1891499/1‑98 (MQ=255) gCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTc > 2:3528716/1‑98 (MQ=255) gCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTc > 1:1843480/1‑98 (MQ=255) gTTTAATGGGTTCACTAGTCATGACTTCAATATGGTTAGCTCGTCCATCATTAAAGACGGTGGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGagg < 2:3173864/98‑3 (MQ=255) tttAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGt > 2:1432212/1‑98 (MQ=255) ttAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGtt > 1:3308573/1‑98 (MQ=255) aaTTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTaa < 2:2538495/98‑1 (MQ=255) ttGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAaaga > 1:3615031/1‑98 (MQ=255) tGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAaagaa < 2:1483976/98‑1 (MQ=255) gTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAaagaag > 1:3602096/1‑98 (MQ=255) tCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTc < 2:2008176/98‑1 (MQ=255) tCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAACGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTc > 2:1550172/1‑98 (MQ=255) aTAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTg > 1:3208274/1‑98 (MQ=255) tAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGt < 1:1024642/98‑1 (MQ=255) tAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGt > 1:1082680/1‑98 (MQ=255) tAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGt > 1:1229643/1‑98 (MQ=255) tAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGt > 2:1222272/1‑98 (MQ=255) aGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGtt > 1:2986652/1‑98 (MQ=255) aGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGtt > 2:2887078/1‑98 (MQ=255) aGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGtt > 1:2187073/1‑98 (MQ=255) aGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGtt > 1:3173249/1‑98 (MQ=255) aGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGtt > 1:3458749/1‑98 (MQ=255) gTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTc < 2:1312982/98‑1 (MQ=255) tCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCg > 1:3437908/1‑98 (MQ=255) tCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGAGGTTAAAGAAGTCTTGTCCg > 2:2984672/1‑98 (MQ=255) gACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCt > 1:1895957/1‑98 (MQ=255) gACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCt > 2:773948/1‑98 (MQ=255) gACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCt > 1:1290055/1‑98 (MQ=255) aCTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCtt < 1:1659588/98‑1 (MQ=255) caagtagtaacgtagtacgtccatcattAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTa < 2:1526424‑M2/70‑1 (MQ=255) cTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTa > 1:373885/1‑98 (MQ=255) ttCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTaa < 2:3047714/98‑1 (MQ=255) ttCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTaa < 1:768425/98‑1 (MQ=255) aaTATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCg < 2:2098315/98‑1 (MQ=255) atatAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGc < 1:3141772/98‑1 (MQ=255) tataGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCt < 2:927905/98‑1 (MQ=255) tataGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCt < 2:3467743/98‑1 (MQ=255) tataGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCt < 2:2173626/98‑1 (MQ=255) ataGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCtt < 2:2306465/98‑1 (MQ=255) ataGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCtt < 1:2770322/98‑1 (MQ=255) ataGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCtt < 1:815649/98‑1 (MQ=255) aGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTg > 2:2588516/1‑98 (MQ=255) gTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGa < 1:3521996/98‑1 (MQ=255) ttATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGAt < 2:3557157/98‑1 (MQ=255) ttATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGAt < 1:1544724/98‑1 (MQ=255) tATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTTGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTACTCGCTTTGATa > 2:1707933/1‑98 (MQ=255) ctcGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGt < 1:223848/98‑1 (MQ=255) cgtccatcattAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTcc > 2:2760557‑M2/12‑98 (MQ=255) tccatcattAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTg > 2:862212‑M2/10‑98 (MQ=255) ccatcattAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGt < 1:2296185‑M2/90‑1 (MQ=255) atcattAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGttt < 1:2480064‑M2/92‑1 (MQ=255) cattAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGTTtct > 1:2889518‑M2/5‑98 (MQ=255) attAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGTTtctc < 2:521674‑M2/95‑1 (MQ=255) tAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGTTTCTccc < 1:349566‑M2/97‑1 (MQ=255) aaaTACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGTTTCTCCCa > 1:90788/1‑98 (MQ=255) | GTAATGCTTTTTCATCTTTAATCATTGATGACTGCATCCATGCTTGTTTAATTTGTTCAATAGTCATGACTTCAATATAGTTATCTCGTCCATCATTAAATACGATTGTGCAGTACGCACCGATAATGTTTTCTTTGTCGATGTTAAAGAAGTCTTGTTCGTGCTTAATCGCTTTGATACGTCCTGTTTCTCCCA > BX571857/2057654‑2057848 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |