New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 359689 | 48 (1.100) | 14 (0.330) | 12/256 | 2.8 | 23.5% | intergenic (+46/+74) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 359707 | 45 (1.080) | intergenic (+64/+56) | gbdR/PP_0299 | AraC family transcriptional regulator/hypothetical protein |
GATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGAT > NC_002947/359541‑359837 | gatgCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCCCTTCGCGGAACAAGCCCGCCCCCACAGATCA‑CC > 2:895562‑M1/1‑150 (MQ=255) gATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGTCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAATCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAg > 1:165179/1‑150 (MQ=255) gATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCGGCCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCCCCCCCAGGTCC‑CCCCCTggg > 1:961939/1‑148 (MQ=255) gATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCgctggct > 2:407752‑M1/1‑143 (MQ=255) tCCGCAGGCCATGACCCCTTCGCCGCACCGCGGGGCGGTGGCGGCCCTGGGCCAGGCGCGCAATGGGTTCACATTTTGCAGTGTTAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCtt < 2:961939/150‑1 (MQ=37) cGCCGGCCATCCCCCTTTCGCCGCACACCGGTCCGATGGCGGCACTGAGCCAGGCTCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGa < 2:531115/150‑1 (MQ=38) ccATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGc > 2:432236/1‑150 (MQ=255) tGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCgctggctcaagctcagcggg < 1:77439‑M1/150‑21 (MQ=255) aCCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCgctggctcaagctcagcgggtga < 2:316282‑M1/150‑24 (MQ=255) cccTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCAAGCCCGCCCCCACAGATCA‑CCgctggctcaagctcagcgggtgac < 2:281830‑M1/150‑25 (MQ=255) gTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCgctggctcaagctcagcgggtgacctgt < 2:168152‑M1/150‑29 (MQ=255) gTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCtgt > 2:81231/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGa > 2:975503/1‑133 (MQ=255) tCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGa < 1:975503/133‑1 (MQ=255) tCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCAAGCCCGCCCCCACAGATCA‑CCgctggctcaagctcagcgggtgacctgtg < 2:260373‑M1/150‑30 (MQ=255) cgccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCCCTTCGCGGAACAAGCCCGCCCCCACAGATCA‑CCgctggctcaagctcagcgggtgacctgtg < 1:895562‑M1/150‑30 (MQ=255) gccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTggg < 1:701374/150‑1 (MQ=255) ccgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCCCCCACAGATCA‑CC‑GCTG‑GCTCAAGCTCAGCgggtgacctgtggga > 2:487467‑M2/1‑135 (MQ=255) cgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTggggg > 1:1072582/1‑150 (MQ=255) cgcACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCCCTTCGCGGAACAAGCCCGCCCCCACAGATCA‑CCgctggctcaagctcagcgggtgacctgtggga < 1:196216‑M1/150‑33 (MQ=255) acaGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CC‑GCTG‑GCTCAAGCTCAGCgggtgacctgtgggagcgg > 1:407752‑M2/1‑131 (MQ=255) cGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCtt < 2:267956/150‑1 (MQ=255) gcggcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGaa > 2:615181/1‑150 (MQ=255) gcCCTGCGCCAGGTTCGTAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTCAGTCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCTCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAggg < 1:152594/150‑1 (MQ=255) gcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CC‑GCTG‑GCTCAAGCTCAGCgggtgacctgtgg < 2:8724‑M2/127‑14 (MQ=255) gcCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CC‑GCTG‑GCTCAAGCTCAGCgggtgacctgtgg > 1:8724‑M2/1‑114 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc < 2:1072582/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGc < 2:532346/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCgctggctcaagctcagcgg > 2:345829‑M1/1‑89 (MQ=255) cAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCACCCgctggctcaagctcagcgg < 1:345829‑M1/108‑20 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 2:165179/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTgg < 2:54104/150‑1 (MQ=255) gcgcAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGTCTCCGCTCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTa < 1:510080/150‑1 (MQ=255) tGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTgg > 1:115303/1‑107 (MQ=255) tGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTgg < 2:115303/107‑1 (MQ=255) caGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGAt < 1:1044087/149‑1 (MQ=255) caaCAGTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAcg < 2:161503/148‑1 (MQ=255) gACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTAcgc < 1:820787/150‑1 (MQ=255) ccAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTCGGTACGTGGATTACGCGCGTtagt > 2:601091/1‑150 (MQ=255) cAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTttgtt < 1:432236/150‑1 (MQ=255) tgtAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGaa > 1:854391/1‑150 (MQ=255) tAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGaa < 1:991128/107‑1 (MQ=255) tAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGaa > 2:991128/1‑107 (MQ=255) tAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTTAACt > 2:187544/1‑150 (MQ=255) gCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTgcgc > 1:1027584/1‑150 (MQ=255) tctGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCa > 2:343081/1‑150 (MQ=255) tctGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCa < 2:854391/150‑1 (MQ=255) acCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg > 2:768892/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGc < 2:833154/150‑1 (MQ=255) ttCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTg > 2:889830/1‑150 (MQ=255) tCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGt > 2:904212/1‑150 (MQ=255) cgcgG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTc < 1:904212/150‑1 (MQ=255) cgG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGCGGCCGGTCCTGGGTACATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGa < 1:615181/150‑1 (MQ=255) gg‑gCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt > 2:400296/1‑150 (MQ=255) gg‑gCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGAt < 1:768892/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTCA‑GCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTg < 2:172393/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg > 2:977452/1‑125 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTg < 1:977452/125‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTg < 1:400296/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCACCCgctgagcttgagccagcggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgt > 1:407752‑M1/1‑19 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGc > 2:1078381/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGc < 1:158123/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTCACCCgctgagcttgagccagcggtgatctgtgggggcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcgg > 2:487467‑M1/1‑15 (MQ=255) tCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCggtgatctgtgggggcgggcttgttccgcgaaggggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcg < 1:196216‑M2/150‑119 (MQ=255) ccACAGGTCACCCgctgagcttgagccagcggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggc > 1:8724‑M1/1‑13 (MQ=255) ccACAGGTCACCCgctgagcttgagccagcggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggc < 2:8724‑M1/127‑115 (MQ=255) cacaGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCggtgatctgtgggggcgggcttgttccgcgaaggggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcggcg < 1:895562‑M2/150‑122 (MQ=255) cacaGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCggtgatctgtgggggcgggcttgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcggcga < 2:260373‑M2/150‑122 (MQ=255) acaGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcggcgac < 2:168152‑M2/150‑123 (MQ=255) gTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCggtgatctgtgggggcgggcttgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcggcgacaggg < 2:281830‑M2/150‑127 (MQ=255) tCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcggcgacagggt < 2:316282‑M2/150‑128 (MQ=255) tCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCACAGATGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAg < 2:748948/150‑1 (MQ=255) a‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGa > 1:96852/1‑150 (MQ=255) cccGCTGAGCTTGAGC‑CAGCgggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctggctcagggccgccatcggcccgctgtgcggcgacagggtca < 1:77439‑M2/150‑131 (MQ=255) ccGCTGAGCTTGAGC‑CAGCgggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctg > 2:345829‑M2/1‑19 (MQ=255) ccGCTGAGCTTGAGC‑CAGCgggtgacctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagaggccggcgcggtgtcagagccttacactggcaaatgtcgactcattgcgcgcctg < 1:345829‑M2/108‑90 (MQ=255) | GATGCCGATTCCGCAGGCCATGACCCTGTCGCCGCACAGCGGGCCGATGGCGGCCCTGAGCCAGGCGCGCAATGAGTCGACATTTGCCAGTGTAAGGCTCTGACACCGCGCCGGCCTCTTCGCGG‑GCACGCCCGCTCCCACAGGTCA‑CCCGCTGAGCTTGAGC‑CAGCGGTGATCTGTGGGGGCGGGCTTGTTCCGCGAAGGGGCCGGTCCTGGGTAAATGGATTACGCGCGTTTGTTGAACTGCGCCAACGCTGGCAACAGTTGCTTGTCGATGGCCTGGCGTACTGCCGGCAGGAT > NC_002947/359541‑359837 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |