New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5159824 | 25 (0.850) | 9 (0.410) | 7/184 | NT | 27.8% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5159839 | 28 (1.270) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
GGACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5159656‑5159824 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggccttttcgcgggtaaacccgctcctacaACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTCG < NC_002947/5159839‑5159692 GGACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGC > 1:258951/1‑150 ACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG < 2:83450/150‑1 ACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG > 1:477348/1‑150 CCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG < 2:10576/149‑1 CCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG > 1:10576/1‑149 AGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTA < 2:154679/150‑1 GTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGA < 2:477348/150‑1 CAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGG < 2:211030/150‑1 TGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAG > 1:502145/1‑112 TGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAG < 2:502145/112‑1 GCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGG > 2:143043/1‑102 GCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGG < 1:143043/102‑1 GTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTA > 2:143271/1‑78 GTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTA < 1:143271/78‑1 GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTC < 2:782100/150‑1 GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTC > 1:782100/1‑150 CCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCA > 2:303667/1‑150 TTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGC > 1:34824/1‑150 TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAAC < 2:451853/150‑1 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAAC < 2:262432/95‑1 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAAC > 1:262432/1‑95 CCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCT > 2:614049/1‑150 CCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGC > 1:72349/1‑130 CCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGC < 2:72349/130‑1 CCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTG > 1:610184/1‑150 CCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTG > 2:780461/1‑150 CCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCC < 2:151586/121‑1 CCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCC > 1:151586/1‑121 CCTACAACGATATCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAATCGGGCANACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACT < 1:537465/150‑1 ACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTC < 1:780461/150‑1 CAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGAGGAGCCACACCCTCCGATACAGCCCTTGCTGCGCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTCG < 1:614049/150‑1 AACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCA < 1:751113/143‑1 AACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCA > 2:751113/1‑143 GGACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5159656‑5159824 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggccttttcgcgggtaaacccgctcctacaACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTCG < NC_002947/5159839‑5159692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |