| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5159824 | 25 (0.850) | 9 (0.410) | 7/184 | NT | 27.8% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5159839 | 28 (1.270) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
GGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATC > NC_002947/5159681‑5159971 | gggCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGtt > 1:540239/1‑150 (MQ=255) gAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCt > 1:303667/1‑150 (MQ=255) aaTTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGAACGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTCAACACGCTCCTACACAGGGTCGCTa > 2:122762/1‑150 (MQ=255) cGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGCGCAGCAAGGGCTGTATCGGAGGGTGTGGCTCCTCCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtg < 1:614049‑M2/150‑3 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgt < 1:780461‑M2/150‑4 (MQ=255) agagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgta < 2:154679‑M1/150‑20 (MQ=255) agTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTNTGCCCGATTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGATATCGTtgtagg < 1:537465‑M2/150‑7 (MQ=255) gTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtagga < 2:477348‑M1/150‑23 (MQ=255) tGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt > 2:751113‑M2/1‑142 (MQ=255) tGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTt < 1:751113‑M2/143‑2 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 2:211030‑M1/150‑27 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 2:780461‑M2/1‑139 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:610184‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 2:614049‑M2/1‑138 (MQ=255) gTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcga < 2:451853‑M2/150‑24 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:34824‑M2/1‑124 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaagg > 2:303667‑M2/1‑122 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcc > 1:782100‑M2/1‑120 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcc < 2:782100‑M2/150‑31 (MQ=255) gcagcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg < 2:72349‑M2/130‑13 (MQ=255) gcagcaAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcggg > 1:72349‑M2/1‑118 (MQ=255) ggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg < 2:151586‑M2/121‑12 (MQ=255) ggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgg > 1:151586‑M2/1‑110 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtag < 2:502145‑M1/112‑21 (MQ=255) tGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtag > 1:502145‑M1/1‑92 (MQ=255) tttccccGGTTGGGGCACCACCAGACCGGGGGTTTTGTCGGGGTCGATGGCCACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAAcaca < 2:775495/146‑1 (MQ=38) tGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGa > 1:302613/1‑150 (MQ=255) gCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGTCAGGA‑AGAACGGGCCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGag > 1:775495/1‑149 (MQ=255) cccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGAGTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAGGCCCGATGCTACACAGGTTCGCCAGCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtc > 1:453669/1‑150 (MQ=38) ccGCTTGTTGCACCACCAGTCCGGAGTTTTTGTCGGGCTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGTTCCTCCACAGTTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtct < 2:348353/150‑1 (MQ=37) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 2:143043‑M1/1‑76 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTGTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 1:143043‑M1/102‑27 (MQ=255) caccacCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcg > 1:34114/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgta > 2:143271‑M1/1‑59 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgta < 1:143271‑M1/78‑20 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgc > 1:262432‑M2/1‑74 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgc < 2:262432‑M2/95‑22 (MQ=255) tttGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATccc < 2:540239/150‑1 (MQ=255) gggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCGCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGcc > 1:487458/1‑150 (MQ=255) cGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCtt > 1:423167/1‑150 (MQ=255) cagcTGCGCGGCGGTTGGTCGAGTTAACCCGCTCCTAAACAGGTTCCCTATCGTTGT‑AGGAACGGAGTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAAATATCTCAATCCCGGCGGTAGGGCAACATACCCCGCGCCTCTTCGGcctg > 2:572608/4‑147 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAccc > 2:278719/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCtt < 2:423167/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctc > 1:782100‑M1/1‑30 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctc < 2:782100‑M1/150‑121 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCTGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg > 2:783390/1‑106 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCTGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg < 1:783390/106‑1 (MQ=255) ggCCTTTTCGAAGGTAACCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑ATGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGAc < 1:122762/150‑1 (MQ=255) ccTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctcca > 2:303667‑M1/1‑28 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagc > 1:34824‑M1/1‑26 (MQ=255) ttttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTTACCCCt > 1:257724/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaac < 2:451853‑M1/150‑128 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaac > 1:262432‑M1/1‑21 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaac < 2:262432‑M1/95‑75 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgc > 1:182564/1‑149 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgc < 2:182564/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggct > 2:614049‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgc > 1:72349‑M1/1‑12 (MQ=255) cccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgc < 2:72349‑M1/130‑119 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATACCCCCTACCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGACTATTCGGCATGCGCCTTGACCCCTTCCCGTTTCTgcag > 1:336963/1‑150 (MQ=37) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg > 2:780461‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg > 1:610184‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc > 1:151586‑M1/1‑11 (MQ=255) ccGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcc < 2:151586‑M1/121‑111 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaacaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgc < 1:143043‑M2/102‑77 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctg < 2:211030‑M2/150‑125 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgc > 2:143043‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACGGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGt < 1:593617/141‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACGGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGt > 2:593617/1‑141 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCACGTTCCTgcagc > 2:141705/1‑150 (MQ=255) tCCTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccac < 2:477348‑M2/150‑129 (MQ=255) ccTACAacgatatcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaatcgggcanacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccact < 1:537465‑M1/150‑145 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcataca > 1:502145‑M2/1‑20 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcataca < 2:502145‑M2/112‑93 (MQ=255) tACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactct < 2:154679‑M2/150‑132 (MQ=255) tACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaac < 1:143271‑M2/78‑60 (MQ=255) tACACAGGTTCGCTATCGTtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaac > 2:143271‑M2/1‑19 (MQ=255) acacAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtc < 2:258951/150‑1 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc < 1:780461‑M1/150‑148 (MQ=255) cAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggaggagccacaccctccgatacagcccttgctgcgccagcaactcactgtggctgccactctcg < 1:614049‑M1/150‑149 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgcca > 2:751113‑M1/1‑1 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgcca < 1:751113‑M1/143‑143 (MQ=255) | GGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCGTTGT‑AGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATC > NC_002947/5159681‑5159971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |