| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1022041 = | 43 (1.460) | 4 (0.140) | 4/232 | NT | 8.7% | intergenic (‑52/+40) | dppB/dppA‑I | dipeptide ABC transporter permease/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1022070 = | 43 (1.540) | intergenic (‑81/+11) | dppB/dppA‑I | dipeptide ABC transporter permease/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
CCGGGGATCAGGCGTATGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGAT > NC_002947/1021895‑1022188 | aaagtgtacgatgacgaacaaccctggatcagcatggctcatccaaagatgttcaccgccatgcgtgaaaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaccgc > 2:355246‑M1/147‑150 (MQ=255) ggggATCAGGCGTATGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGccgccg < 1:100820/150‑1 (MQ=255) agtgtacgatgacgaacaaccctggatcagcatggctcatccaaagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaccgccg > 2:255023‑M1/145‑150 (MQ=255) tGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGTCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTgtgggt > 2:160625/1‑150 (MQ=255) tGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGTTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTgccg < 1:743452/133‑1 (MQ=255) tGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTgccg > 2:743452/1‑133 (MQ=255) tGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTgtgggt > 1:2785/1‑150 (MQ=255) gggcAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGt > 1:580468/4‑150 (MQ=255) cAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTgccgc > 1:131230/1‑121 (MQ=255) cAGAAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTgccgc < 2:131230/121‑1 (MQ=255) aGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGCTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgtt > 2:576035/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttg < 1:568146/150‑1 (MQ=255) cGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTc > 1:111282/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCa > 1:771624/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCa > 1:771623/1‑150 (MQ=255) aagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTc < 2:726540‑M1/41‑1 (MQ=255) aagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTc > 1:726540‑M1/102‑142 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgt > 1:98867/1‑127 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgt < 2:98867/127‑1 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtggtggt > 2:91093/1‑149 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtggtggt < 1:91093/149‑1 (MQ=255) agcagGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGaa > 1:749037/1‑150 (MQ=255) gcagGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtg > 2:384127/1‑138 (MQ=255) gcagGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtg < 1:384127/138‑1 (MQ=255) ccAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgtt < 2:2785/150‑1 (MQ=255) ggCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCagag > 1:81199/1‑150 (MQ=255) cAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAggg < 2:580468/150‑1 (MQ=255) tAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTAGCCGGCGGTCGTTGTTTTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTg > 2:151666/1‑150 (MQ=255) cTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCAc > 2:507603/1‑150 (MQ=255) tCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACg > 2:412852/1‑150 (MQ=255) cAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTCTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGt < 1:576035/150‑1 (MQ=255) accctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgt > 2:171427‑M1/56‑88 (MQ=255) accctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgt < 1:171427‑M1/33‑1 (MQ=255) aCATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAg < 1:160625/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTc > 2:144626/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAg > 1:751102/1‑144 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAg < 2:751102/144‑1 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTcc > 2:117113/1‑150 (MQ=255) ggggTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTCATCACGTAGCCCTacac > 2:44370/1‑150 (MQ=255) ttACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGAt < 2:195285/131‑1 (MQ=255) ttACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGAt > 1:195285/1‑131 (MQ=255) tACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGt < 2:749037/150‑1 (MQ=255) cTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCAc < 2:583707/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATgg > 2:326764/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCg > 1:544911/1‑150 (MQ=255) cGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCGGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGt < 1:721010/150‑1 (MQ=255) gggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAAc > 1:324897/1‑150 (MQ=255) gggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCAACAGTACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAAc < 1:412852/150‑1 (MQ=255) ggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGc > 2:362535/1‑142 (MQ=255) ggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGc < 1:362535/142‑1 (MQ=255) aTCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCtt < 2:111282/150‑1 (MQ=255) cccGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGAt > 1:53908/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCAt < 1:144626/150‑1 (MQ=255) aGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTTGGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGCGAACATCTTTGGATGATCCATGCTg > 1:49289/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGAt < 2:324897/150‑1 (MQ=255) | CCGGGGATCAGGCGTATGAGCGCGAAGGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGAT > NC_002947/1021895‑1022188 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |