| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1022041 = | 43 (1.460) | 4 (0.140) | 4/232 | NT | 8.7% | intergenic (‑52/+40) | dppB/dppA‑I | dipeptide ABC transporter permease/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | 1022070 = | 43 (1.540) | intergenic (‑81/+11) | dppB/dppA‑I | dipeptide ABC transporter permease/dipeptide ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
GGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAT > NC_002947/1021921‑1022219 | gggcAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGt > 1:580468/4‑150 (MQ=255) aGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGCTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgtt > 2:576035/1‑150 (MQ=255) gCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttg < 1:568146/150‑1 (MQ=255) cGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTc > 1:111282/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCa > 1:771624/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCa > 1:771623/1‑150 (MQ=255) aagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTc > 1:726540‑M1/102‑142 (MQ=255) aagatgttcaccgccatgcgtgacaacgtggagggctacgtgatcaaccctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTc < 2:726540‑M1/41‑1 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgt < 2:98867/127‑1 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgttgt > 1:98867/1‑127 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtggtggt < 1:91093/149‑1 (MQ=255) gTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtggtggt > 2:91093/1‑149 (MQ=255) agcagGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGaa > 1:749037/1‑150 (MQ=255) gcagGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtg < 1:384127/138‑1 (MQ=255) gcagGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTtg > 2:384127/1‑138 (MQ=255) ccAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAgttgtt < 2:2785/150‑1 (MQ=255) ggCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCagag > 1:81199/1‑150 (MQ=255) cAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAggg < 2:580468/150‑1 (MQ=255) tAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTAGCCGGCGGTCGTTGTTTTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTg > 2:151666/1‑150 (MQ=255) cTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCAc > 2:507603/1‑150 (MQ=255) tCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACg > 2:412852/1‑150 (MQ=255) cAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTCTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGt < 1:576035/150‑1 (MQ=255) accctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgt < 1:171427‑M1/33‑1 (MQ=255) accctctgaccaacaacaacttcgccaccaccaaggtgaagtagaacaacaacgaCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCgt > 2:171427‑M1/56‑88 (MQ=255) aCATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAg < 1:160625/150‑1 (MQ=255) gTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTc > 2:144626/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAg > 1:751102/1‑144 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAg < 2:751102/144‑1 (MQ=255) tCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTcc > 2:117113/1‑150 (MQ=255) ggggTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTCATCACGTAGCCCTacac > 2:44370/1‑150 (MQ=255) ttACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGAt > 1:195285/1‑131 (MQ=255) ttACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGAt < 2:195285/131‑1 (MQ=255) tACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGt < 2:749037/150‑1 (MQ=255) cTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCAc < 2:583707/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATgg > 2:326764/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCg > 1:544911/1‑150 (MQ=255) cGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCGGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGt < 1:721010/150‑1 (MQ=255) gggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAAc > 1:324897/1‑150 (MQ=255) gggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCAACAGTACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAAc < 1:412852/150‑1 (MQ=255) ggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGc > 2:362535/1‑142 (MQ=255) ggCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGc < 1:362535/142‑1 (MQ=255) aTCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCtt < 2:111282/150‑1 (MQ=255) cccGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGAt > 1:53908/1‑150 (MQ=255) gaacaacaacgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCtt < 2:726540‑M2/101‑1 (MQ=255) gaacaacaacgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCtt > 1:726540‑M2/42‑142 (MQ=255) cGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCAt < 1:144626/150‑1 (MQ=255) acgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGt < 1:171427‑M2/55‑1 (MQ=255) acgaccgccggccacccacacggggaccggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGt > 2:171427‑M2/34‑88 (MQ=255) aGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTTGGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGCGAACATCTTTGGATGATCCATGCTg > 1:49289/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGAt < 2:324897/150‑1 (MQ=255) CGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCa > 2:81199‑M1/1‑150 (MQ=255) CCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGc > 2:220954‑M1/1‑93 (MQ=255) CCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGc < 1:220954‑M1/93‑1 (MQ=255) gtgtGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGt < 2:457412/109‑1 (MQ=255) gtgtGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGt > 1:457412/1‑109 (MQ=255) gggtggCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATc < 1:326764/150‑1 (MQ=255) cggcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACt > 2:255023‑M2/7‑150 (MQ=255) gcggTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTTTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACttt > 2:355246‑M2/5‑150 (MQ=255) tCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTTTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAt < 1:355246/150‑1 (MQ=255) tCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAt < 2:771623/150‑1 (MQ=255) tCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAt < 2:771624/150‑1 (MQ=255) | GGTCAGCAAGGTGATGCCGAAAAAGGTCGGTATCAGCAGGCCAAGGCGCCGGGCAATAAAACTCAACATTGTCGGGGTTACCTCATCAGGCCGTGGGGCGATCAGCCCGGTACGGCAGTGCCGCCGGTCCCCGTGTGGGTGGCCGGCGGTCGTTGTTGTTCTACTTCACCTTGGTGGTGGCGAAGTTGTTGTTGGTCAGAGGGTTGATCACGTAGCCCTCCACGTTGTCACGCATGGCGGTGAACATCTTTGGATGAGCCATGCTGATCCAGGGTTGTTCGTCATCGTACACTTTCAAT > NC_002947/1021921‑1022219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |