New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5168706 = | 29 (0.980) | 4 (0.140) | 4/236 | NT | 11.8% | coding (276/1365 nt) | PP_4547 | glutamine synthetase |
? | NC_002947 | 5168744 = | 32 (1.130) | coding (314/1365 nt) | PP_4547 | glutamine synthetase |
TGGCCGTGTACCAGACAGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATG > NC_002947/5168561‑5168850 | tgGCCGTGTACCAGACAGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACCCCGGCCTGATATGGCAAGTCTGCTCCATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCCCCCTGGTGCGCCTGc > 2:108138/1‑150 (MQ=255) ccGTGTACCAGACAGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCGGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTCCCCGCTTGACGGCAAGCTGGTGCGCCTGCCCt > 1:242754/1‑150 (MQ=255) cGTGTACCAGACAGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTAGCCGCTGGAGGTCAGCCTGGTGCGCCTACCCta > 2:130920/1‑149 (MQ=255) ccAGACAGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCg > 1:104493/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGcc < 2:466021/150‑1 (MQ=255) aGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAg < 2:104493/150‑1 (MQ=255) aggccatcaccgggtgataaccatcggccttcaacgcttagctggtgcgcagcagcacatggcgtgggtccgcgatgctggccggcagaccctcgctggggtgcatgctcaCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGt < 1:139528‑M1/39‑1 (MQ=255) aggccatcaccgggtgataaccatcggccttcaacgcttagatggtgcgcagcagcacatggcgtgggtccgcgatgctggccggcagaccctcgctggggtgcatgctcaCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGt > 2:139528‑M1/112‑150 (MQ=255) ccATCCTTGGTCTGATCATCAAGGGCACCAACGTCGCAACCTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGTCGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGa < 2:130649/150‑1 (MQ=255) ccATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCAACCTCCGCAGTTCATGTGa < 2:593231/150‑1 (MQ=255) gacgTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGcc < 2:599055/150‑1 (MQ=255) gTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGc > 1:279968/1‑150 (MQ=255) gAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATc > 2:297329/1‑150 (MQ=255) aaaaCTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATcg > 2:254888/1‑150 (MQ=255) cTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCa < 2:74563/122‑1 (MQ=255) cTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCa > 1:74563/1‑122 (MQ=255) cTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGc < 1:659991/150‑1 (MQ=255) tGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGcc > 1:501695/1‑150 (MQ=255) gggtgGGACGTCGGCGACATTGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAACCTGGTGCGCCTGTCCTGGCGCCGGTTGCCCACCGCCGCATTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCAt < 2:148299/148‑1 (MQ=255) tCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCCGCATCGCGGACCCACGCCATGtgctgctgc < 1:743939/150‑1 (MQ=255) gACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCAcc > 1:90211/1‑150 (MQ=255) gACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCAcc > 1:587799/1‑150 (MQ=255) cTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGc < 1:175040/150‑1 (MQ=255) tggccggcagaccctcgctggggtgcatgctcaCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGa > 1:339964‑M1/34‑74 (MQ=255) tggccggcagaccctcgctggggtgcatgctcaCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGa < 2:339964‑M1/41‑1 (MQ=255) tgcctgccCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATCTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGaa < 1:108138/150‑1 (MQ=255) tGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGGCCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGaa < 2:316314/150‑1 (MQ=255) ccTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAgg < 1:254888/150‑1 (MQ=255) ccGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCg < 1:634763/138‑1 (MQ=255) ccGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCg > 2:634763/1‑138 (MQ=255) cGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATg < 1:788150/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATc < 1:130920/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGt > 1:448621/1‑150 (MQ=255) ggTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGAt > 2:1478/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATg < 2:279968/150‑1 (MQ=255) gcCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATc > 2:237320/1‑110 (MQ=255) gcCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATc < 1:237320/110‑1 (MQ=255) | TGGCCGTGTACCAGACAGGCCGGCCACTGCCCAGCACCATCCTTGGCCTGACCCTCAACGGCGACGACGTGGAAAACTCCGGCCTGGTGTGGGACGTCGGCGACATCGACTGCCGTGCCTACCCGCTTGACGGCAGCCTGGTGCGCCTGCCCTGGCGCCGGGTGCCCACCGCCGCAGTGCAGGTGAGCATGCACCCCAGCGAGGGTCTGCCGGCCAGCATCGCGGACCCACGCCATGTGCTGCTGCGCACCATCGAAGCGTTGAAGGCCGATGGTTATCACCCGGTGATG > NC_002947/5168561‑5168850 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |