| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6032808 = | 24 (0.810) | 8 (0.370) | 7/180 | NT | 36.8% | intergenic (+16/+120) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 6032890 = | 10 (0.460) | intergenic (+98/+38) | dppA‑IV/PP_5284 | dipeptide transport protein/hypothetical protein | |||||
TCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACC > NC_002947/6032662‑6032955 | tcgttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTcg < 1:731246‑M1/4‑1 (MQ=255) cgttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTcgc > 1:569671‑M1/146‑150 (MQ=255) cgttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTcgc > 2:57778‑M1/146‑150 (MQ=255) ccAGCAGCAGGCGATGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgc < 1:561002/150‑1 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctgtatcacatcatcaataggtatgtggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 1:407370‑M1/144‑150 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 2:749765‑M1/144‑150 (MQ=255) ttgaagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCgg > 1:205736‑M1/144‑150 (MQ=255) agcagcagGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg > 2:301649/1‑150 (MQ=255) agcagcagGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg < 1:301649/150‑1 (MQ=255) agcagcagGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCgg > 1:547126/1‑150 (MQ=255) aagcgggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTa > 2:596653‑M1/141‑150 (MQ=255) ggggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTcgcgggtttaccc > 2:731246‑M1/136‑144 (MQ=255) ggctggcgttgattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:92245‑M1/134‑150 (MQ=255) cTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAATGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:486383/150‑1 (MQ=255) cTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:62657/150‑1 (MQ=255) gattgatgtgcgggtgctggatcacatcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 1:34221‑M1/124‑150 (MQ=255) cTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTa < 2:713210/150‑1 (MQ=255) atcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTcgcg < 2:290757‑M1/6‑1 (MQ=255) atcatcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTcgcg > 1:290757‑M1/99‑104 (MQ=255) tgctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTAc < 1:692191/150‑1 (MQ=255) atcattggtgatggggagccgttgtcgatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggcctcTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTAc > 1:29873‑M1/96‑150 (MQ=255) gctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAgcgt < 1:79896/128‑2 (MQ=255) gctgcGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAgcgt > 2:79896/1‑127 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGt‑t > 2:463653/1‑135 (MQ=255) ccAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGt‑t < 1:463653/135‑1 (MQ=255) cAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAg > 2:789130/1‑150 (MQ=255) cAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAg > 2:129183/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCgg < 1:513136/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg > 1:111728/1‑96 (MQ=255) tCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:111728/96‑1 (MQ=255) gatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGc > 2:344898‑M1/70‑121 (MQ=255) gatggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGc < 1:344898‑M1/52‑1 (MQ=255) atggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCggg > 1:768625‑M1/69‑76 (MQ=255) atggtcgagcatgggtggattgtggtctgagggagtactgagagccttatagggtcagtacgggccctTTCGCggg < 2:768625‑M1/8‑1 (MQ=255) ggTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 1:129183/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgc < 2:288250/65‑1 (MQ=255) ccGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTcgc > 1:288250/1‑65 (MQ=255) aTTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAgg < 1:328483/150‑1 (MQ=255) 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ttatagggtcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTAc < 2:439065‑M1/55‑1 (MQ=255) tcagtacgggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGTCAAC‑TGCCAGGCTGGCGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCAc < 2:505194‑M1/136‑1 (MQ=255) ccTGTTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTCCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCag < 2:547126/150‑2 (MQ=255) cGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCGTCAGACCACACTCCACCCCTGCt > 1:99443/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTgg > 2:521005/1‑47 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTgg < 1:521005/47‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGa < 2:692812/100‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGa > 1:692812/1‑100 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGAcc > 2:784561/1‑150 (MQ=255) | TCCAGCAGCAGGCGCTGTGGGTGCCACTGGCGCACCCGACGGCGGCGACCTTGCTGCGCCAAGGCGTCGAGGGGTACCAGGTGAGCCCGTTCGGGCGGCTGGATTTCAGCAAGGTGACGGTGACCAAGTAAGCCTGTACCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTAGCGCCAGCCTGGCAGT‑TGACGCTACCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGTACTGACCCTATAAGGCTCTCAGTACTCCCTCAGACCACAATCCACCCATGCTCGACC > NC_002947/6032662‑6032955 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |