New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 428663 | 36 (1.220) | 3 (0.100) | 3/240 | NT | 7.7% | coding (347/957 nt) | PP_0351 | transmembrane sensor |
? | NC_002947 | = 428728 | 37 (1.280) | coding (282/957 nt) | PP_0351 | transmembrane sensor |
CTCGATGTCCACGGCGGTGTGGGTGTTCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGGCGCCGAGCTGGCGCCAGGCACGTGC > NC_002947/428581‑428877 | cTCGATGTCCACGGCGGTGTGGGTGTTCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGTCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCACTTAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGcc > 1:145456‑M2/1‑148 (MQ=255) aCGGCGGTGTGGGTGTTCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAAc > 1:588350/1‑150 (MQ=255) ggcggTGTGGGTGTTCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGt < 1:254366/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGGTGTTCAGGCTCAGCAGTGCGCCGTCTTCAAGTTTTAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCCGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCAGAGCAGAAACGTGcc < 1:564013/150‑1 (MQ=255) ttCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCccg > 1:255387/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCccg > 2:502776/1‑150 (MQ=255) aGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCccgccg > 1:173764/1‑150 (MQ=255) gCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCgccgcc > 2:454478/1‑150 (MQ=255) gcagTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCt > 1:798702/1‑150 (MQ=255) gtgtGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGc < 1:785493/150‑1 (MQ=255) gCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAAt < 2:588350/150‑1 (MQ=255) gCCGTCTTCTAGGCGCAAGGAGCGTCATTTACCCGTGGCGGTGTGCTGGTCGGCGAGACAGTAACTGGGTGCCAGCGACGGGGCGGCGCCCAACGCCAGCAGCGCACCGAGCAGAAGCGTGCCGGCCAGATCGCCGCGAATCTTTCTAAt > 2:325270/1‑150 (MQ=255) ccGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATg > 1:737635/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCATCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGc > 2:293956/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGc < 2:255387/150‑1 (MQ=255) tcttctAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGt > 2:117050/1‑150 (MQ=255) aGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTcgccgc > 2:194926/1‑150 (MQ=255) gcAAGGTGCGTAATTCACGCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGccgccacgggtggattacgcaccttgcgcctagaagacggcacactgctgcgcctgaa < 2:187352‑M2/150‑59 (MQ=255) aTTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGAtt > 1:58678/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTg < 2:749611/150‑1 (MQ=255) ttCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTg < 2:749628/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCTCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAAt > 1:725255/1‑105 (MQ=255) cTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCTCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAAt < 2:725255/105‑1 (MQ=255) tGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGccgccacgggtgaattacgcaccttgcgcctagaagacggcacactgctgagcctgaacacccacaccgccgtggacatcgagtacgccg < 2:305588‑M2/150‑91 (MQ=255) gccagTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTg < 2:798702/150‑1 (MQ=255) cccgTAGCTGGGTGCCAGCTACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGGCACGGCGAGCCCGCCGTGCACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCCGCCGTGCCCTTGTAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGc < 1:454478/147‑1 (MQ=255) ccagTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGc > 1:132854/1‑150 (MQ=255) tAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGccgccacgggtgaattacgcaccttgcgcctagaagacggcacactgctgagcctgaacacccacaccgccgtggacatcgagtacgccggcgcgcaacgggtga > 1:305588‑M2/1‑45 (MQ=255) tGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTaa > 2:275393/1‑150 (MQ=255) ccAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGtt < 1:117050/150‑1 (MQ=255) cAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGTTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTg < 2:317553/150‑1 (MQ=255) gCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGt < 2:132854/150‑1 (MQ=255) ggggCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATg > 2:105012/1‑150 (MQ=255) ggggCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATg > 2:466688/1‑150 (MQ=255) ggggCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATg < 1:502776/150‑1 (MQ=255) gcgcCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGgcg > 2:721777/1‑150 (MQ=255) agtggACCCCTGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCGAATGAGTCGCCCCAGGCTGGCGCGCGCTTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGgcgc < 1:8228/146‑1 (MQ=255) gcCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGGCGcc > 2:22447/1‑150 (MQ=255) aCCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGc < 2:283144/119‑1 (MQ=255) aCCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGc > 1:283144/1‑119 (MQ=255) cagcGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGGCGCCGAGCTGGCGCCAGGc < 1:22447/150‑1 (MQ=255) gcCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGGCGCCGAGCTGGCGCCAGGCAcgtgc < 2:737635/150‑1 (MQ=255) | CTCGATGTCCACGGCGGTGTGGGTGTTCAGGCTCAGCAGTGTGCCGTCTTCTAGGCGCAAGGTGCGTAATTCACCCGTGGCGGTGCGCTGGTCGGCCAGCCAGTAGCTGGGTGCCAGCGACGGGGCGCCGACCCATGCCAGCAGCGCGCCGAGCAGAAACGTGCCGGCCAGCCCGCCGCCAACCTTGCCAATGCGTCGCCGCAGGCTGGCGCGCGATTGCAGCAGCGCCTGGCGTGCCGGGCCAGCTGCCGCGCTAACGCGTTGGTCCATGGCGCCGAGCTGGCGCCAGGCACGTGC > NC_002947/428581‑428877 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |