New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1928935 = | 42 (1.420) | 4 (0.140) | 4/234 | NT | 9.6% | coding (1199/2154 nt) | PP_1728 | membrane protein |
? | NC_002947 | 1928987 = | 35 (1.250) | coding (1147/2154 nt) | PP_1728 | membrane protein |
GCCCCACACGCGCAGGCCCAACTCGATGAACACCAGCCAGATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGAATGAACCAGAAGCTGCCGA > NC_002947/1928841‑1929130 | gCCCCACACGCGCAGGCCCAACTCGATGAACACCAGCCAGATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGtt > 2:455230/1‑150 (MQ=255) acGCGCAGGCCCAACTCGATGAACACCAGCCAGATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCAcc < 2:573988/150‑1 (MQ=255) gCCCAACTCGATGAACACCAGCCAGATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCacac < 2:395299/150‑1 (MQ=255) tGAACACCAGCCAGATGAACAGGTGCACCCGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCAACAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGcc > 2:363386/1‑149 (MQ=255) cacCAGCCAGATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGt < 1:510356/150‑1 (MQ=255) cagccagATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGca < 2:421883/150‑1 (MQ=255) gccagATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCCGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTAcaaa > 1:83673/1‑148 (MQ=255) ccagATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACAt > 1:629813/1‑150 (MQ=255) gATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAg > 1:291074/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGAc < 1:273307/150‑1 (MQ=255) gTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGca < 2:727828/114‑1 (MQ=255) gTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGca > 1:727828/1‑114 (MQ=255) ccAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAggg > 2:586769/1‑150 (MQ=255) cagcagGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGc > 1:434693/1‑150 (MQ=255) agcagGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCg > 1:472914/1‑150 (MQ=255) gTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCa < 2:635344/128‑1 (MQ=255) gTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCa > 1:635344/1‑128 (MQ=255) gTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCt < 2:377022/150‑1 (MQ=255) tAGCCGCAGTTGCGCAGGCGTTCGGCCTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTg > 2:8776/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCAt > 2:120932/1‑96 (MQ=255) gCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCAt < 1:120932/96‑1 (MQ=255) ccGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGgtg < 1:84071/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGt > 2:414689/1‑111 (MQ=255) gTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGt < 1:414689/111‑1 (MQ=255) tGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACTGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCcgg < 2:291074/150‑1 (MQ=255) gCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGc > 1:533459/1‑76 (MQ=255) gCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGc < 2:533459/76‑1 (MQ=255) tCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAg > 1:755395/1‑150 (MQ=255) ggTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGt < 2:629813/150‑1 (MQ=255) gcctggtgcgacgccatgccgccaaccccaagcgggccagcaagcgccaggcCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGAc < 2:263663‑M2/47‑1 (MQ=255) gcctggtgcgacgccatgccgccaaccccaagcgggccagcaagcgccaggcCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGAc > 1:263663‑M2/53‑99 (MQ=255) CTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATg > 2:119440‑M1/1‑64 (MQ=255) CTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATg < 1:119440‑M1/64‑1 (MQ=255) gtgcgacgccatgccgccaaccccaagcgggccagcaagcgccaggcCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTc > 1:38798‑M2/48‑117 (MQ=255) gtgcgacgccatgccgccaaccccaagcgggccagcaagcgccaggcCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTc < 2:38798‑M2/70‑1 (MQ=255) cccGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACACCACCCACGTCGGCCGGGCGGTGCGGGTGGCGCAGGCGGAGAAGAAGCTGTCGTAAAGCGAAGTGGCCACCAGaa > 1:613119/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCacac < 2:709120/54‑1 (MQ=255) ccGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCacac > 1:709120/1‑54 (MQ=255) tGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGaa < 1:441130/150‑1 (MQ=255) ggcggcATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGAAt < 2:472914/150‑1 (MQ=255) gcATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGAATGAAc < 2:755395/150‑1 (MQ=255) gCGTCGCACCAGGCAGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGAATGAACCAGaa < 1:363386/150‑1 (MQ=255) ccaggcCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGAATGAACCAGAAGCTGCCGa < 1:455230‑M2/144‑1 (MQ=255) | GCCCCACACGCGCAGGCCCAACTCGATGAACACCAGCCAGATGAACAGGTGCACCAGCAGGTAGCCGAAGTTGCGCAGGCGTTCGGTGTACACCGCCTGGCGCTTGCTGGCCCGCTTGGGGTTGGCGGCATGGCGTCGCACCAGGCCGTTGAGCACCATGCACACCACCACCAGCACGGTGCACATCAGCGACTGGCGCAGGGCGGTGCTGGTGTCGCCGGCGGAGACGAAGGTGGCGAACAGCGAAATGGCCACCAGAATCAGCGCCGGAATGAACCAGAAGCTGCCGA > NC_002947/1928841‑1929130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |