New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4987256 | 38 (1.290) | 4 (0.140) | 4/244 | NT | 10.4% | coding (169/468 nt) | PP_4396 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4987290 | 31 (1.060) | coding (203/468 nt) | PP_4396 | hypothetical protein |
TGCTCGACCTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATGGACGACTGCCAGCAGGTCAACCAGACCAATGGCCGGATCATCCAGGT > NC_002947/4987146‑4987434 | tGCTCGACCTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGa < 1:717414/150‑1 (MQ=255) tGCTCGACCTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGa < 1:717336/150‑1 (MQ=255) gCTCGACCTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAg > 2:29040/1‑150 (MQ=255) tCGACCTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTg > 2:531095/1‑150 (MQ=255) ccTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGa < 1:307313/150‑1 (MQ=255) aGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCa < 1:748728/150‑1 (MQ=255) aaTCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGAAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGc > 1:337930/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCa < 1:29040/150‑1 (MQ=255) ccGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGa > 2:702152/1‑110 (MQ=255) ccGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGa < 1:702152/110‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATgg < 1:455345/150‑1 (MQ=255) tgGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCa < 1:272198/130‑1 (MQ=255) tgGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCa > 2:272198/1‑130 (MQ=255) tgGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGgtgatgtga > 2:14309/1‑150 (MQ=255) gAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCa > 1:512704/1‑128 (MQ=255) gAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCa < 2:512704/128‑1 (MQ=255) gAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGtgatgtgatg > 2:558858/1‑150 (MQ=255) cAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTa < 1:467121/117‑1 (MQ=255) cAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTa > 2:467121/1‑117 (MQ=255) tCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGc < 1:672039/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCg < 2:337930/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCt > 2:756544/1‑150 (MQ=255) aaGCAGTCGTTGATCATCTTGATCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCCGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCGGCCCGACCATGTGTTCGGCCTCGAGCACCACACGCACCCCGTGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACAtg < 1:14309/150‑1 (MQ=255) gTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCa > 2:245957/1‑150 (MQ=255) gTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGAGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCa > 1:127546/1‑150 (MQ=255) ttGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCaa > 1:420585/1‑150 (MQ=255) tGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAAc < 1:531095/150‑1 (MQ=255) tcatcTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGcatgctgctcgagcaagatgatcaacgactgcttgcgcgccaggatttgctccagcagcggcatgtcgcggccatgcagggcgattgcttccttg < 1:172085‑M2/150‑96 (MQ=255) tcatcTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGa < 1:558858/150‑1 (MQ=255) tcatcTTGCTAGCGCGGCATAGCTTGCGTCGCAGCCAATTTCTCGGCAGCCTGGGcatgctgctcgagcaagatgatcaacgactgcttgcgcgccaggatttgctccagcagcggcatgtcgcggccatgcagggcgattgcttccttg > 2:172085‑M2/1‑55 (MQ=255) catcTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGTAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGAt < 2:744977/150‑1 (MQ=255) atcTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGAGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATg < 2:127546/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATGgacga > 2:231043/1‑150 (MQ=255) gcagcaTGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCAt < 1:101468/94‑1 (MQ=255) gcagcaTGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCAt > 2:101468/1‑94 (MQ=255) caTGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGcatgctgctcgagcaagatgatcaacgactgcttgcgcgccaggatttg > 2:629719‑M2/1‑38 (MQ=255) caTGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGcatgctgctcgagcaagatgatcaacgactgcttgcgcgccaggatttg < 1:629719‑M2/87‑50 (MQ=255) ccgcAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATGGACGACTGCCAGCAGGTCAACCAGAc < 1:245957/150‑1 (MQ=255) ccAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATGGACGACTGCCAGCAGGTCAACCAGACCAATgg < 1:231043/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATGGACGACTGCCAGCAGGTCAACCAGACCAATGGCCGGATCATCCAGGt < 2:420585/150‑1 (MQ=255) | TGCTCGACCTTCTGCACAAGGAAGCAATCGCCCTGCATGGCCGCGACATGCCGCTGCTGGAGCAAATCCTGGCGCGCAAGCAGTCGTTGATCATCTTGCTCGAGCAGCATGGCCAGCGCCGCAGCCAATTGCTCGGCAGCCTGGGCCTGAGTGCCGACCGCACCGGTGTGCAGGCTGTAGCTGCGCAGTCACCCCATGGTGATGTGATGCTGCAGCGGCTCGACATGTTGTCGCAACTGATGGACGACTGCCAGCAGGTCAACCAGACCAATGGCCGGATCATCCAGGT > NC_002947/4987146‑4987434 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |