New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5335031 | 22 (0.740) | 5 (0.170) | 5/238 | NT | 17.2% | coding (1413/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 5335072 | 27 (0.940) | coding (1454/2976 nt) | PP_4695 | two‑component system sensor histidine kinase |
GATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCAGGAATTCGCCACCCAGCTGGCCAAGC > NC_002947/5334941‑5335221 | gATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCAccc < 1:130090/143‑1 (MQ=255) gATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCAccc > 2:130090/1‑143 (MQ=255) gATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGAtctc > 2:621989/1‑150 (MQ=255) gACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGAGACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGtt > 1:253649/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCTTCCGCGTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACTACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGACCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCAcc > 2:96259/1‑150 (MQ=255) tgcCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCa > 1:343192/1‑150 (MQ=255) ccGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGc > 1:267554/1‑150 (MQ=255) tcGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAACACCGAag > 1:431999/1‑150 (MQ=255) ggCAACTTGCAGGTTTGCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAagag < 2:618265/150‑1 (MQ=255) ggCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAagag < 1:621989/150‑1 (MQ=255) gCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCa > 2:158595/1‑111 (MQ=255) gCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCa < 1:158595/111‑1 (MQ=255) tGCAGGGTTTCTACATCCAGCTGCCGCACATGATCTATGTGCTGGACGACACCATCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTg < 2:370922/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGt < 2:291481/148‑1 (MQ=255) gCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGt > 1:291481/1‑148 (MQ=255) tgCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCcac > 1:180501/1‑150 (MQ=255) tgCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCcac < 1:168719/150‑1 (MQ=255) acgacACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGcgcc < 2:343192/150‑1 (MQ=255) cgacACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGcgccg > 2:741785/1‑150 (MQ=255) acCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTgctggtgtcgtccagcacatagatcatgtccagcagcgggatgtagaaaccctgcaagttgccgagaagcggcagcagcatggtcaccatccacaccagg > 2:61622‑M2/1‑47 (MQ=255) acCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTgctggtgtcgtccagcacatagatcatgtccagcagcgggatgtagaaaccctgcaagttgccgagaagcggcagcagcatggtcaccatccacaccagg < 1:61622‑M2/147‑101 (MQ=255) acCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAg > 2:625387/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCt > 2:354730/1‑150 (MQ=255) acaTGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCAcgccg > 2:164658/1‑150 (MQ=255) ccgccATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTgctggtgtcgtccagcacatagatcatgtccagcagcgggatgtagaaaccctgcaagttgccgagaagcggc > 1:791715‑M2/1‑31 (MQ=255) ccgccATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTgctggtgtcgtccagcacatagatcatgtccagcagcgggatgtagaaaccctgcaagttgccgagaagcggc < 2:791715‑M2/104‑74 (MQ=255) cgccATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCCagctggtgtcgtccagcacatagatcatgtccagcagcgggatgtagaaaccctgcaagttgccgagaagcggcagcagcatggtcaccatccacaccagggtgccggccagcagcccgg < 1:783083‑M2/150‑121 (MQ=255) cATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCa < 2:253649/150‑1 (MQ=255) cATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCa > 1:12250/1‑150 (MQ=255) gCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCGCTGGCCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCAGGaa < 1:407551/150‑1 (MQ=255) ccTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCt < 2:557053/87‑1 (MQ=255) ccTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCt > 1:557053/1‑87 (MQ=255) cAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCAGGAATTCGCCACCCAGCt > 1:228253/1‑150 (MQ=255) aCGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCAGGAATTCGCCACCCAGCTgg < 2:180501/150‑1 (MQ=255) tgctgTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCAGGAATTCGCCACCCAGCTGGCCAAGc > 1:614799/1‑150 (MQ=255) | GATGGTGACCATGCTGCTGCCGCTTCTCGGCAACTTGCAGGGTTTCTACATCCCGCTGCTGGACATGATCTATGTGCTGGACGACACCAGCTGGCACATGGCCGCCATCGCCTCGTTGGCGGCCAACGTGCTGCTGTTCACCCTGATCTCACTGTTCACCAACGCCAGCACCGAAGAGGTCAGTGCGGCCGAAGCCTGTGCCGTGGATAACGTGCGCCGCCCACAGCGCCGCGAGCTGCACGCCGCCTCGCCGCAGGAATTCGCCACCCAGCTGGCCAAGC > NC_002947/5334941‑5335221 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |