New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5632465 | 23 (0.780) | 3 (0.110) | 3/236 | NT | 12.5% | coding (1944/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 5632479 | 20 (0.710) | coding (1958/3954 nt) | putA | proline dehydrogenase/1‑pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
CCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTGCGCACTGAACGCCGCGCCGATCTGGCAGGCCACCCCACCAGCCG > NC_002947/5632333‑5632628 | ccTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCcag < 2:449788‑M2/150‑4 (MQ=255) ccTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCcag < 2:445072‑M2/150‑4 (MQ=255) gCCGCGCGACATGTATGGCCACGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCga < 2:781589/150‑1 (MQ=255) aCCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTg < 1:449788/150‑1 (MQ=255) ggCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAAccc < 1:445072/150‑1 (MQ=255) gCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGGCGGCGCAG‑GCCAGcagcggggcagccttccagtcgttgtgagcggtg > 2:494611‑M2/1‑116 (MQ=255) gCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCg > 2:378689/1‑150 (MQ=255) ccAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTg > 2:577978/1‑140 (MQ=255) ccAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTg < 1:577978/140‑1 (MQ=255) cATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CGGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGTCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGa < 1:140706/150‑1 (MQ=255) aTGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACgtcgtc < 1:279416/150‑1 (MQ=255) gCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGc > 2:413029/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCagga < 2:396448/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGt > 1:432697/1‑150 (MQ=255) tCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGtt > 1:103366/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCGTGTGGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAAc < 1:640414/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGc > 1:466171/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGcc < 1:763809/134‑1 (MQ=255) tGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGcc > 2:763809/1‑134 (MQ=255) cACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCa > 2:596449/1‑150 (MQ=255) gCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTgc > 1:324630/1‑150 (MQ=255) cTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTgcg > 2:524100/1‑150 (MQ=255) acaACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTGCGCAc > 1:598585/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCcagcggggcagccttccagtcgttgtgagcggtggccagcatggc > 1:369953‑M2/1‑20 (MQ=255) ccGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCcagcggggcagccttccagtcgttgtgagcggtggccagcatggc < 2:369953‑M2/65‑46 (MQ=255) ccGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCACAAGGCCACCTTTGCCGACGTTGACAACGCCCTCCCCCGCGCACTGCAccccgcccccgtctcg > 2:294101/1‑143 (MQ=255) cgccAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTGCGCACTGAACGCCGCGCCGATCTGGCAGGCCACCCCACCAGc > 2:776318/1‑150 (MQ=255) ccAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTGCGCACTGAACGCCGCGCCGATCTGGCAGGCCACCCCACCAGCCg > 1:364389/1‑150 (MQ=255) | CCTGCCGCGCGACCTGTATGGCACCGAACGGGCCAACTCGGCCGGCATCGACATGGCCAATGAACACCGCCTGGCGTCGCTGTCCTGCGCCATGCTGGCCACCGCTCACAACGACTGGAAGGCTGCCCCGCTGCTGGC‑CTGCGCCGCCAGCGAGAGCGCTGCCGCACCGGTGCTGAACCCGGCTGACCACCGCGACGTCGTCGGCCATGTGCAGGAGGCCACCGTTGCCGACGTTGACAACGCCATCCAGTGCGCACTGAACGCCGCGCCGATCTGGCAGGCCACCCCACCAGCCG > NC_002947/5632333‑5632628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |