New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 871173 = | 77 (1.030) | 7 (0.110) | 7/224 | NT | 10.6% | intergenic (+18/+57) | PP_0753/PP_0754 | lipoprotein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 871208 = | 50 (0.760) | intergenic (+53/+22) | PP_0753/PP_0754 | lipoprotein/hypothetical protein |
GCTTCGCTGGACCAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCA > NC_002947/871024‑871320 | catcaacgtgcaggaccgccagtggctggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaanaaa > 2:1195527‑M1/150‑150 (MQ=255) atcaacgtgcaggaccgccagtggctggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggcgcgacaacaaaa < 2:813958‑M1/2‑1 (MQ=255) atcaacgtgcaggaccgccagtggctggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaaa < 2:200544‑M1/2‑1 (MQ=255) atcaacgtgcaggaccgccagtggctggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaaa < 1:334467‑M1/2‑1 (MQ=255) cGCTGGACCAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAAc < 1:1004782/150‑1 (MQ=255) gCTGGACCAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAAcc > 2:1746428/1‑150 (MQ=255) cTGGACCAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAAccc > 2:1312136/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGc > 2:697483/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGc < 2:1085970/150‑1 (MQ=255) aggaccgccagtggctggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccaaatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaAAAACCCGCTGc > 2:1215135‑M1/139‑150 (MQ=255) cAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGcc > 1:372230/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGcc > 2:144834/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGcc > 2:1350271/1‑150 (MQ=255) tttCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGt < 1:1303955/150‑1 (MQ=255) tttCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGt < 2:372230/150‑1 (MQ=255) tttCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGt < 2:1583284/150‑1 (MQ=255) cATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAgg < 1:1312136/150‑1 (MQ=255) tggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtcgatctgtaccggccagacaacaaAAAACCCGCTGCCTGAGTGAc < 2:1000147‑M1/21‑1 (MQ=255) tggtctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaAAAACCCGCTGCCTGAGTGAc > 1:1000147‑M1/124‑144 (MQ=255) tctactgtgcgcttggcggacatgtgcatgaggacttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCgg > 2:952004‑M1/121‑150 (MQ=255) gcCGAACTAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGctg < 2:847392/150‑3 (MQ=255) gcCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGTgg < 1:751753/150‑1 (MQ=255) gcCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCgg < 1:1166104/150‑1 (MQ=255) cGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCgggg > 2:1374364/1‑149 (MQ=255) cGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGt < 1:1746428/150‑1 (MQ=255) ccAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAGAACCCGCTGCCTGAGTGAGAGGCAGCggggggtt > 1:123087/1‑145 (MQ=255) ccAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGttttt > 1:1031993/1‑150 (MQ=255) cAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGtttttt < 1:1899708/150‑1 (MQ=255) ggACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTttgt > 2:489176/1‑150 (MQ=255) gACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTttgtt < 1:1839559/150‑1 (MQ=255) acCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTc > 2:580562/1‑150 (MQ=255) cAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTg > 1:813958/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCTTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGt > 2:1815242/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAg < 1:489176/150‑1 (MQ=255) tggtggGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGa < 1:715039/150‑1 (MQ=255) tggtggGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGa < 1:585001/150‑1 (MQ=255) acttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaAAAACCCGCTGCCt < 2:1885240‑M1/14‑1 (MQ=255) acttgcccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaAAAACCCGCTGCCt > 1:1885240‑M1/88‑101 (MQ=255) aTGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGt > 2:1804852/1‑103 (MQ=255) aTGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGt < 1:1804852/103‑1 (MQ=255) aTGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTAcgccg > 1:663780/1‑150 (MQ=255) tgCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCtt < 1:1350271/150‑1 (MQ=255) tgCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCtt > 1:1796552/1‑150 (MQ=255) tgCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCtt > 1:1526758/1‑150 (MQ=255) tGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTa < 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aGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCAt > 2:390919/1‑150 (MQ=255) tAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGc > 2:61527/1‑150 (MQ=255) gCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGTTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTAcgc < 1:1590838/80‑1 (MQ=255) gCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTAcgc > 2:1590838/1‑80 (MQ=255) gCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCAt < 1:190973/145‑1 (MQ=255) gCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCAt > 2:190973/1‑145 (MQ=255) ccagacaacaaAAAACCCGCTGCCTGTCACTCAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTc < 2:1511367‑M1/114‑1 (MQ=255) ccagacaacaaAAAACCCGCTGCCTGTCACTCAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTc > 1:1511367‑M1/12‑125 (MQ=255) gtggtgCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTg > 2:38199/1‑55 (MQ=255) gtggtgCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTg < 1:38199/55‑1 (MQ=255) gtgCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCaa < 1:341560/150‑1 (MQ=255) acaacaaAAAACCCGCTGCCTGTCACTCAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCgg < 2:324077‑M1/116‑1 (MQ=255) acaacaaAAAACCCGCTGCCTGTCACTCAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCgg > 1:324077‑M1/8‑123 (MQ=255) gCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTGCAGATCTACGCGGCTTCGATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTGCTAATGCACATGTGCGCCAAgc > 2:717104/1‑150 (MQ=255) aGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTCCGCCGCCTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCGCTTCGGGCAAGTGCTCGTGCACACGTTCGCCAAGCGca < 2:169645/150‑1 (MQ=255) | GCTTCGCTGGACCAGCGTTTCGGCATGGCGCCGAACCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCA > NC_002947/871024‑871320 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |