| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 871173 = | 77 (1.030) | 7 (0.110) | 7/224 | NT | 10.6% | intergenic (+18/+57) | PP_0753/PP_0754 | lipoprotein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 871208 = | 50 (0.760) | intergenic (+53/+22) | PP_0753/PP_0754 | lipoprotein/hypothetical protein | |||||
CCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCTGCACGTTGATG > NC_002947/871059‑871356 | ccAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGttttt > 1:1031993/1‑150 (MQ=255) cAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGtttttt < 1:1899708/150‑1 (MQ=255) ggACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTttgt > 2:489176/1‑150 (MQ=255) gACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTttgtt < 1:1839559/150‑1 (MQ=255) acCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTc > 2:580562/1‑150 (MQ=255) cAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTg > 1:813958/1‑150 (MQ=255) ccAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCTTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGt > 2:1815242/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAg < 1:489176/150‑1 (MQ=255) tggtggGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGa < 1:715039/150‑1 (MQ=255) tggtggGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGa < 1:585001/150‑1 (MQ=255) aTGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTAcgccg > 1:663780/1‑150 (MQ=255) tgCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCtt > 1:1526758/1‑150 (MQ=255) tgCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCtt > 1:1796552/1‑150 (MQ=255) tgCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCtt < 1:1350271/150‑1 (MQ=255) ccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaaaaacccgctgcctgagtgacaggcagcgggttttTtgttgt > 1:324077‑M2/117‑123 (MQ=255) ccgaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaaaaacccgctgcctgagtgacaggcagcgggttttTtgttgt < 2:324077‑M2/7‑1 (MQ=255) tGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTa < 2:1526758/150‑1 (MQ=255) gaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaaaaacccgctgcctgagtgacaggcagcgggttttTTGTTGTCTgg > 1:1511367‑M2/115‑125 (MQ=255) gaagtggatgccggcactgggttcagcttgctggatttccacatagaagcggcgtagatctgtaccggccagacaacaaaaaacccgctgcctgagtgacaggcagcgggttttTTGTTGTCTgg < 2:1511367‑M2/11‑1 (MQ=255) 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gCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGc < 2:1463842/150‑1 (MQ=255) tGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGa < 2:1176054/150‑1 (MQ=255) gTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGaa > 1:270478/1‑150 (MQ=255) gTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGaa < 2:1795964/150‑1 (MQ=255) gTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGaa < 2:270478/150‑1 (MQ=255) ttCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGCGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAg < 1:1478774/144‑1 (MQ=255) ttCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGCGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAg > 2:1478774/1‑144 (MQ=255) aaGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCa > 2:1391019/1‑150 (MQ=255) ggACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGt < 1:1135914/150‑1 (MQ=255) cccGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGcc > 1:200544/1‑150 (MQ=255) 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cAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCg < 1:1391019/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACNTCg < 2:1189541/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGTCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCgg < 1:580562/150‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCgg > 2:1394431/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTAAGGTGGTACGAGTAAATACGCATCCTTAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCgg < 1:1374364/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTttgtt > 2:684353/1‑72 (MQ=255) 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gtcactcaggcagcgggttttTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCGACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCa < 2:1000147‑M2/123‑1 (MQ=255) tGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAg > 2:106847/1‑67 (MQ=255) tGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAg < 1:106847/67‑1 (MQ=255) tGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAgc > 2:1172349/1‑128 (MQ=255) tGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAgc < 1:1172349/128‑1 (MQ=255) gACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTTTCTTGCCGGTACAGACCTACGCCGCTCCGATCTTGAAATTCTGGATGGTGGACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCg < 1:697483/150‑1 (MQ=255) gACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCg < 1:638777/150‑1 (MQ=255) aCAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCgg < 1:1815242/150‑1 (MQ=255) aggcagcgggttttTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGt > 1:1885240‑M2/15‑101 (MQ=255) aggcagcgggttttTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGt < 2:1885240‑M2/87‑1 (MQ=255) gcagcgggttttTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATTTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCt > 2:1215135‑M2/13‑150 (MQ=255) ttTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCTGCACGTTGAt < 1:334467‑M2/148‑1 (MQ=255) ttTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCTGCACGTTGAt < 2:200544‑M2/148‑1 (MQ=255) ttTTGTTGTCGCGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCTGCACGTTGAt < 2:813958‑M2/148‑1 (MQ=255) tTTNTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCTGCACGTTGATg > 2:1195527‑M2/2‑150 (MQ=255) | CCAGGACACCAACACCCAGCTGGTGGGTGATGTGCTGAGCGATGCCCTGACCCGCCTGTTCAAGGACCCGAGCATCGGGCAGGTGCTGGGTCAGTAAGCTTCAGGTGGTGCAAGAAAACCCGCTGCCTGAGTGACAGGCAGCGGGTTTTTTGTTGTCTGGCCGGTACAGATCTACGCCGCTTCTATGTGGAAATCCAGCAAGCTGAACCCAGTGCCGGCATCCACTTCGGGCAAGTCCTCATGCACATGTCCGCCAAGCGCACAGTAGACCAGCCACTGGCGGTCCTGCACGTTGATG > NC_002947/871059‑871356 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |