New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
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gcagcaCTTGCTCCAAAcccaccgggttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaactgcaaagcggcgagaacttcaatcgcaac > 1:1200120‑M1/1‑17 (MQ=255) cagcaCTTGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTg < 2:710136/150‑1 (MQ=255) aCTTGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGata < 1:1404429/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGatat > 1:100815/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGatat > 2:1132093/1‑150 (MQ=255) ttGCTCC‑AAACCCACCGGGttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaactgcaaagcggc < 1:1523831‑M2/73‑55 (MQ=255) ttGCTCC‑AAACCCACCGGGttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaactgcaaagcggc > 2:1523831‑M2/1‑19 (MQ=255) ttGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCg < 2:1831693/116‑1 (MQ=255) ttGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCg > 1:1831693/1‑116 (MQ=255) tGCTCC‑AAcccggtgggtttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaactgcaaagcggcgagaacttcaatcgcaacttcgtcgacctgtcggacagcatcggcgaccagatcgaagaacacctgacccaggaccag > 1:566280‑M1/1‑8 (MQ=255) tCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACt > 2:113779/1‑150 (MQ=255) tCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACt > 2:553182/1‑150 (MQ=255) tCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACt > 2:428033/1‑150 (MQ=255) cc‑AAcccggtgggtttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaactgcaaagcggcgagaacttcaatcgcaacttcgtcgacctgtcggacagcatcggcgaccagatcgaagaacaccttacccaggacccgacgc < 2:1404429‑M1/150‑147 (MQ=255) cc‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACtt < 2:826998/150‑1 (MQ=255) c‑AAACCCACCGGGtttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaa > 2:1837105‑M2/1‑13 (MQ=255) c‑AAACCCACCGGGtttggagcaagtgctgctggatgcaccattggggcgttttgaa < 1:1837105‑M2/56‑44 (MQ=255) c‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACttt > 2:1595913/1‑150 (MQ=255) aaaCCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACTTTg > 2:665247/1‑150 (MQ=255) aaCCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACTTTGc < 2:100815/150‑1 (MQ=255) aaCCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACTTTGc < 2:1560864/150‑1 (MQ=255) | AGTGCAAGGTTGTGCGTCGGGTCCTGGGTAAGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCC‑AAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACTTTGC > NC_002947/1262255‑1262552 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |