New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 1262403 | 74 (0.990) | 6 (0.080) | 6/246 | NT | 7.2% | coding (238/1116 nt) | PP_1104 | AotO‑related protein |
? | NC_002947 | = 1262413 | 82 (1.140) | coding (228/1116 nt) | PP_1104 | AotO‑related protein |
GCGTCGGGTCCTGGGTAAGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGCCAGGCTACCAGCATGCCCGGCAGCTCGTCGGCGTGCAGTGAGGCCTGGATATAGACTTTGCCTCCACTGCG > NC_002947/1262268‑1262562 | gCGTCGGGTCCTGGGTAAGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGttgg < 2:1404429‑M2/150‑5 (MQ=255) ctggtcCTGGGTCAGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGttggagca > 1:566280‑M2/3‑142 (MQ=255) cTGGGTAAGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCAc > 1:1445056/1‑150 (MQ=255) gTAAGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGt < 1:1900880/150‑1 (MQ=255) aGGTGTTCTTCGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATg < 1:534348/150‑1 (MQ=255) ggTGTACTGCGGTCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCGCCGGCACCAGTATGa < 1:558593/150‑1 (MQ=255) ttcGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTAt > 2:1235981/1‑141 (MQ=255) ttcGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTAt < 1:1235981/141‑1 (MQ=255) ttcGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTcgcg > 1:1149304/1‑150 (MQ=255) ttcGATCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTcgcg > 1:1162350/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCa > 1:1792088/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTAAAAACACAGAGGGTTAGCCACCGGGACCAGTATGATCTCGCGCTGCa > 1:1560864/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTATAGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCAACAGTATGATCTCGCGCTGCa > 1:48010/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGt > 2:1433990/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTc > 1:842444/1‑150 (MQ=255) tCGCCGATGCTGTCCGACAGGTAGACGAAGTTGCGTTTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGAGTGGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCgg > 2:1180022/1‑150 (MQ=255) gCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCTGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGcc < 1:1071783/150‑1 (MQ=255) gCCGATGCTGTCCGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGcc > 1:1029431/1‑150 (MQ=255) 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ccGACAGGTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCa < 2:1149304/150‑1 (MQ=255) gACAGGAGGAGGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCGACGGCGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGc > 2:1005756/1‑150 (MQ=255) gTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGc > 1:187398/1‑150 (MQ=255) gTCGACGAAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGc < 1:916677/150‑1 (MQ=255) gacgaAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAg > 2:1559568/1‑150 (MQ=255) acgaAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAgg > 1:1515013/1‑150 (MQ=255) cgaAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAggc < 1:1089817/150‑1 (MQ=255) gaAGTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAggcg > 1:710136/1‑150 (MQ=255) gTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAACCCGGTGGGTttggagcaagtgctgc < 2:1200120‑M2/98‑17 (MQ=255) gTTGCGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAA‑CCCGGTGGGtttggagcaagtgctgc > 1:1200120‑M2/1‑81 (MQ=255) cGATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTg < 1:548326/150‑1 (MQ=255) gATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAg < 2:233784/94‑1 (MQ=255) gATTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAg > 1:233784/1‑94 (MQ=255) aTTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCggg < 2:58396/76‑1 (MQ=255) aTTGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCggg > 1:58396/1‑76 (MQ=255) ttGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAgg < 2:754779/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTTCTCGCCGCTTTGCAGTTCAAAACGCCCCAATGGTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAACCCACCGGGTTGGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAgg > 1:565587/1‑150 (MQ=255) cgTTCCCGCCGCTTTGTAGTTCCCCTCCCCCCGATGCTGCATCCAGCAGCACTTGCTCCAAAGCCTACAACCCAGCCACCGGCACCAGTATGATCTCGCGCTGCAGTCGGCCTTGCTGTTCCAGCTCGGCCAGGCGGCGCTTGAGGTGcc < 1:34692/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |